RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225576.7

TVP23C-201, Transcript of trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TVP23C, Length 1,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23C-201ENST00000225576 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa15.51■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 FBLIM1Q8WUP2 373 aa15.51■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 SLC38A4Q969I6 547 aa15.51■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 APOL4Q9BPW4 351 aa15.51■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 GMPPBQ9Y5P6 360 aa15.51■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 MYO15AQ9UKN7 3530 aa15.5■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 A6NHS1 94 aa15.5■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 RFPL3O75679 317 aa15.5■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 CYP4B1P13584 511 aa15.5■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 EPHA2P29317 976 aa15.5■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 SLC5A2P31639 672 aa15.5■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 ESRRGP62508 458 aa15.5■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 HOXC5Q00444 222 aa15.5■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 FGFBP1Q14512 234 aa15.5■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 CSRP2Q16527 193 aa15.5■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa15.5■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 PGBD2Q6P3X8 592 aa15.5■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 CD300LDQ6UXZ3 194 aa15.5■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 SLC29A4Q7RTT9 530 aa15.5■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 OR4K5Q8NGD3 323 aa15.5■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 SEMA4CQ9C0C4 833 aa15.5■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 CTPS2Q9NRF8 586 aa15.5■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 FER1L5A0AVI2 2057 aa15.5■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 SAGE2PA6NJ88 616 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 C4orf47A7E2U8 309 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 LRP3O75074 770 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 POU2F1P14859 743 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 IFNGR2P38484 337 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 UGT2B15P54855 530 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 FOXL2P58012 376 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 RAB15P59190 212 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 PSPHP78330 225 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 PLAURQ03405 335 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 CD47Q08722 323 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 COX10Q12887 443 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 APOFQ13790 326 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 CDCP2Q5VXM1 449 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 C1orf94Q6P1W5 598 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 KLHL17Q6TDP4 642 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 TMEM205Q6UW68 189 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 GDF7Q7Z4P5 450 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF441Q8N8Z8 693 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 B3GNT7Q8NFL0 401 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 TSPAN14Q8NG11 270 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 OR4C3Q8NH37 302 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 HSPBAP1Q96EW2 488 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 SLC41A3Q96GZ6 507 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 CRB3Q9BUF7 120 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 ULBP3Q9BZM4 244 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 UCK2Q9BZX2 261 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 WWTR1Q9GZV5 400 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 LOXL2Q9Y4K0 774 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa15.49■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 GPR179Q6PRD1 2367 aa15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 A0A087WUU8 490 aa15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 TRAPPC13A5PLN9 417 aa15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 THY1P04216 161 aa15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 GKN3PP0CG01 181 aa15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 PRG2P13727 222 aa15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 ADH7P40394 386 aa15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 KLHL26Q53HC5 615 aa15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 C6orf141Q5SZD1 244 aa15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 DCAF12Q5T6F0 453 aa15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 ZER1Q7Z7L7 766 aa15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF614Q8N883 585 aa15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 TP53INP1Q96A56 240 aa15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 GAL3ST4Q96RP7 486 aa15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 PRRX2Q99811 253 aa15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF559Q9BR84 538 aa15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 ZPBPQ9BS86 351 aa15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 UBQLN4Q9NRR5 601 aa15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 NTNG1Q9Y2I2 539 aa15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 DPPA5A6NC42 116 aa15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 SERINC4A6NH21 518 aa15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 C9J4A7 227 aa15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 CLPTM1O96005 669 aa15.48■□□□□ 0.07
TVP23C-201ENST00000225576 OSMP13725 252 aa15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms