RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171158.7

Sdc1-205, Transcript of Syndecan-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sdc1, Length 2,311 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Grip1Q925T6 1127 aa14.65□□□□□ -0.06
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Srfbp1Q9CZ91 441 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Ppil3Q9D6L8 161 aa14.65□□□□□ -0.06
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Nr4a3Q9QZB6 627 aa14.65□□□□□ -0.06
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Nfkb2Q9WTK5 899 aa14.65□□□□□ -0.06
Sdc1-205ENSMUST00000171158 CN725425A0A087WRU1 652 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Olfr1555-ps1A0A140LHT7 321 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Mthfd2lD3YZG8 338 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Pcdh1F7BJK1 1077 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 FpgtG5E8F4 590 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Scarb2O35114 478 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Bcl2a1dO55179 172 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Klrg1O88713 188 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Syt4P40749 425 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Ucp3P56501 308 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Sf3b6P59708 125 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Rps25P62852 125 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 SnrpnP63163 240 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Adam12Q61824 903 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Olfr857Q7TRF7 309 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 1700001J03RikQ80ZR8 219 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Sult2a8Q8BGL3 282 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Gm9938Q8C3P5 112 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 St7lQ8K4P7 559 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 HpgdQ8VCC1 269 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Oas3Q8VI93 1138 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Pcdhga6Q91XY2 932 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Tex46Q9CPU3 165 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Cmpk1Q9DBP5 196 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Praf2Q9JIG8 178 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Zfp937A2ANU7 503 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Xpnpep2B1AVD1 674 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Otud4B2RRE7 1107 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Slc9a5B2RXE2 898 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Gm8973D3YX71 104 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 SvaE9PX96 165 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 ChadlE9Q7T7 748 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Arl9F7BE40 171 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Clk4O35493 481 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Zw10O54692 779 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Nipsnap2O55126 281 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Thbs1P35441 1170 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Cd63P41731 238 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Nudt18Q3U2V3 323 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Slc47a2Q3V050 573 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Tm9sf4Q8BH24 643 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Nudt6Q8CH40 313 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Olfr633Q8VF02 312 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Olfr881Q8VF63 314 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Olfr161Q8VGB9 313 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Olfr1417Q8VGJ6 315 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 EsamQ925F2 394 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 BlvraQ9CY64 295 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Cypt12Q9DAR6 119 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 NsdhlQ9R1J0 362 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 A0A1Y7VIU7 259 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 BC035947B2RQY6 695 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Coq10aE9Q3H6 259 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Gm17555F6U8B9 371 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Stxbp1O08599 594 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Clcn7O70496 803 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Hoxc5P32043 222 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 TpoP35419 914 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Uap1l1Q3TW96 507 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 AhrrQ3U1U7 701 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 E330014E10RikQ3UL33 481 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 D5Ertd577eQ499F0 481 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Eri2Q5BKS4 688 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Orm1Q60590 207 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Cdh24Q6PFX6 781 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Lamp3Q7TST5 411 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Gm10330Q8BKS1 112 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Adam4Q8CGQ2 763 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Gm42417Q8K1D0 126 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Gpr18Q8K1Z6 331 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 NrarpQ91ZA8 114 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Slc10a6Q9CXB2 373 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 MtpapQ9D0D3 585 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 TapbpQ9R233 465 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Lbx2Q9WUN8 195 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 PvrigA0A1B0GS01 234 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Gm13124A2A752 406 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Olfr601A2RS33 314 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Cldn34aG3UW52 211 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Smim18J3QNP2 93 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 AurkcO88445 282 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Apoa2P09813 102 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Pmp22P16646 161 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 UoxP25688 303 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Hsd3b2P26149 373 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Alox12eP55249 662 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Mat2aQ3THS6 395 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Zfp791Q497V9 528 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Snx33Q4VAA7 574 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Thoc6Q5U4D9 341 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Cxcl16Q8BSU2 246 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Leng9Q8BTN6 485 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 ScaiQ8C8N2 606 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Nedd4lQ8CFI0 1004 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdc1-205ENSMUST00000171158 Ttc23Q8CHY7 488 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.8 ms