RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635562.1

PSPC1-208, Transcript of paraspeckle component 1, human

TSL 3

Gene PSPC1, Length 422 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSPC1-208	ENST00000635562	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	DYRK3	O43781	588 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	ALB	P02768	609 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	NID1	P14543	1247 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	ELN	P15502	786 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	RAC1	P63000	192 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	PCSK7	Q16549	785 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	CCDC102B	Q68D86	513 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	TNS4	Q8IZW8	715 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	CEP63	Q96MT8	703 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	SLC30A3	Q99726	388 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	UST	Q9Y2C2	406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	FAM196B	A6NMK8	535 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	DKK1	O94907	266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	ITGB7	P26010	798 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	TYRO3	Q06418	890 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	IER5	Q5VY09	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	SIX5	Q8N196	739 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	PTK7	Q13308	1070 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	CDCA8	Q53HL2	280 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	SUSD3	Q96L08	255 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	USP17L15	C9J2P7	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	USP17L10	C9JJH3	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	USP17L12	C9JPN9	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	USP17L11	C9JVI0	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	USP17L21	D6R901	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	USP17L18	D6R9N7	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	USP17L22	D6RA61	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	USP17L19	D6RCP7	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	USP17L20	D6RJB6	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	EPB42	P16452	691 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	CLDN10	P78369	228 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	USP17L24	Q0WX57	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	ADGRE1	Q14246	886 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	ARTN	Q5T4W7	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	OGFOD1	Q8N543	542 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	SFI1	A8K8P3	1242 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	PDE4C	Q08493	712 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	NBPF11	Q86T75	865 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	STK32A	Q8WU08	396 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	BHMT	Q93088	406 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	PNMA5	Q96PV4	448 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562		A0A0A0MRY4	1105 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	CARNS1	A5YM72	827 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	FAM229A	H3BQW9	127 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	MBTPS1	Q14703	1052 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	GRIK4	Q16099	956 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	RTN1	Q16799	776 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSPC1-208	ENST00000635562	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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