RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627578.2

FHL1-223, Transcript of four and a half LIM domains 1, human

TSL 4

Gene FHL1, Length 580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FHL1-223	ENST00000627578	CFAP44	Q96MT7	982 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	SNED1	Q8TER0	1413 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	HOXB7	P09629	217 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	MBIP	Q9NS73	344 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	ZNF853	P0CG23	659 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	CCDC184	Q52MB2	194 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	LAMB2	P55268	1798 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	SLC51A	Q86UW1	340 aa		13.41	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	TCIRG1	Q13488	830 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	NLRP10	Q86W26	655 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	SYNE4	Q8N205	404 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	IFT57	Q9NWB7	429 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
FHL1-223	ENST00000627578	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	HTRA3	P83110	453 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	NLRP3	Q96P20	1036 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	PSMD1	Q99460	953 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	COL4A5	P29400	1685 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	GNAI1	P63096	354 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	ABCC4	O15439	1325 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	SCN4A	P35499	1836 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	ZNF428	Q96B54	188 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	HYPK	Q9NX55	129 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	FZD9	O00144	591 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	POTEI	P0CG38	1075 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	POTEJ	P0CG39	1038 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	CHADL	Q6NUI6	762 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	JDP2	Q8WYK2	163 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	TAF1	P21675	1872 aa		13.33	□□□□□ -0.27
FHL1-223	ENST00000627578	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	CCDC27	Q2M243	656 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	GPC2	Q8N158	579 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	TSPYL6	Q8N831	410 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	KLRG1	Q96E93	195 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	FAM89A	Q96GI7	184 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	MRS2	Q9HD23	443 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	COL4A1	P02462	1669 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	ANP32C	O43423	234 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	BBOX1	O75936	387 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	GOLGA2	Q08379	1002 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	GRAP	Q13588	217 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	WWC1	Q8IX03	1113 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	HACL1	Q9UJ83	578 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	LTBP1	Q14766	1721 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	PPIP5K2	O43314	1243 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	AOC3	Q16853	763 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	LDHD	Q86WU2	507 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	SP8	Q8IXZ3	490 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FHL1-223	ENST00000627578	JMY	Q8N9B5	988 aa		13.31	□□□□□ -0.28

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