RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 TM6SF1Q9BZW5 370 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 SIL1Q9H173 461 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 PDRG1Q9NUG6 133 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 MTMR6Q9Y217 621 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 COL15A1P39059 1388 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 NEURL1BA8MQ27 555 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 GJB2P29033 226 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 CREB3L3Q68CJ9 461 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 PKD1L3Q7Z443 1732 aa16.05■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 RUFY2Q8WXA3 655 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 MAP4K1Q92918 833 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 SLC52A2Q9HAB3 445 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 NPHP3Q7Z494 1330 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 TPCN1Q9ULQ1 816 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 MYL6BP14649 208 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 MSNP26038 577 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 SMC3Q9UQE7 1217 aa16.04■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 NECAB1Q8N987 351 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 GPATCH3Q96I76 525 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 SLC27A2O14975 620 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 XAGE3Q8WTP9 111 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 STRCP1A6NGW2 1772 aa16.03■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 PHKG2P15735 406 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 GCKRQ14397 625 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 BOLA2Q9H3K6 86 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 LAMB4A4D0S4 1761 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 ABCC6O95255 1503 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa16.02■□□□□ 0.16
C9orf170-201ENST00000623052 FIBPO43427 364 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 CHGBP05060 677 aa16.02■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 TPRNQ4KMQ1 711 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC183Q5T5S1 534 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 DDX58O95786 925 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 COPS6Q7L5N1 327 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 RIC3Q7Z5B4 369 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 TCEANC2Q96MN5 208 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 MYD88Q99836 296 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 UBE2HP62256 183 aa16■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 FUCA2Q9BTY2 467 aa16■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 USP16Q9Y5T5 823 aa16■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 TJP1Q07157 1748 aa16■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 NUP188Q5SRE5 1749 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 FSD1Q9BTV5 496 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 LAMA4Q16363 1823 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 CDC37L1Q7L3B6 337 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC39Q9UFE4 941 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 HDAC5Q9UQL6 1122 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 CYP27B1O15528 508 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 PHF14O94880 888 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 NLRP2Q9NX02 1062 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF609O15014 1411 aa15.97■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 TRHP20396 242 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa15.97■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 TPM2P07951 284 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 COPRSQ9NQ92 184 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 USP25Q9UHP3 1055 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 HIP1O00291 1037 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 AP5Z1O43299 807 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 TAF5LO75529 589 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 RPS6KB1P23443 525 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 CASP7P55210 303 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 TFCP2Q12800 502 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
C9orf170-201ENST00000623052 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 FAM173BQ6P4H8 233 aa15.96■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 CABLES1Q8TDN4 633 aa15.96■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 UBR2Q8IWV8 1755 aa15.95■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 TNNI3KQ59H18 835 aa15.95■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 GIMAP6Q6P9H5 292 aa15.95■□□□□ 0.14
C9orf170-201ENST00000623052 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms