RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620030.1

PPP1CC-211, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2

Gene PPP1CC, Length 582 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-211ENST00000620030 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
PPP1CC-211ENST00000620030 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
PPP1CC-211ENST00000620030 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa30.64■■■□□ 2.5
PPP1CC-211ENST00000620030 TCIRG1Q13488 830 aa30.64■■■□□ 2.5
PPP1CC-211ENST00000620030 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa30.64■■■□□ 2.5
PPP1CC-211ENST00000620030 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
PPP1CC-211ENST00000620030 DPY19L2Q6NUT2 758 aa30.63■■■□□ 2.49
PPP1CC-211ENST00000620030 C3orf67Q6ZVT6 689 aa30.63■■■□□ 2.49
PPP1CC-211ENST00000620030 RTKN2Q8IZC4 609 aa30.63■■■□□ 2.49
PPP1CC-211ENST00000620030 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
PPP1CC-211ENST00000620030 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
PPP1CC-211ENST00000620030 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP30.62■■■□□ 2.49
PPP1CC-211ENST00000620030 NLRP10Q86W26 655 aa30.62■■■□□ 2.49
PPP1CC-211ENST00000620030 POTECB2RU33 542 aa30.61■■■□□ 2.49
PPP1CC-211ENST00000620030 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
PPP1CC-211ENST00000620030 CRAMP1Q96RY5 1269 aa30.61■■■□□ 2.49
PPP1CC-211ENST00000620030 CACNA1SQ13698 1873 aa30.6■■■□□ 2.49
PPP1CC-211ENST00000620030 PLBD2Q8NHP8 589 aa30.6■■■□□ 2.49
PPP1CC-211ENST00000620030 FSTL1Q12841 308 aa30.59■■■□□ 2.49
PPP1CC-211ENST00000620030 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa30.59■■■□□ 2.49
PPP1CC-211ENST00000620030 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
PPP1CC-211ENST00000620030 NLRP3Q96P20 1036 aa30.59■■■□□ 2.49
PPP1CC-211ENST00000620030 HYPKQ9NX55 129 aa30.59■■■□□ 2.49
PPP1CC-211ENST00000620030 CEP350Q5VT06 3117 aa30.59■■■□□ 2.49
PPP1CC-211ENST00000620030 RNF123Q5XPI4 1314 aa30.58■■■□□ 2.49
PPP1CC-211ENST00000620030 ANP32CO43423 234 aa30.57■■■□□ 2.48
PPP1CC-211ENST00000620030 SYNE4Q8N205 404 aa30.57■■■□□ 2.48
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
PPP1CC-211ENST00000620030 TIAM2Q8IVF5 1701 aa30.56■■■□□ 2.48
PPP1CC-211ENST00000620030 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
PPP1CC-211ENST00000620030 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
PPP1CC-211ENST00000620030 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa30.56■■■□□ 2.48
PPP1CC-211ENST00000620030 C8orf58Q8NAV2 365 aa30.56■■■□□ 2.48
PPP1CC-211ENST00000620030 SNED1Q8TER0 1413 aa30.56■■■□□ 2.48
PPP1CC-211ENST00000620030 APLP1P51693 650 aa30.55■■■□□ 2.48
PPP1CC-211ENST00000620030 CCDC27Q2M243 656 aa30.55■■■□□ 2.48
PPP1CC-211ENST00000620030 DDNO94850 711 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
PPP1CC-211ENST00000620030 PSMD1Q99460 953 aa30.54■■■□□ 2.48
PPP1CC-211ENST00000620030 ISCA1Q9BUE6 129 aa30.54■■■□□ 2.48
PPP1CC-211ENST00000620030 MRS2Q9HD23 443 aa30.54■■■□□ 2.48
PPP1CC-211ENST00000620030 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
PPP1CC-211ENST00000620030 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
PPP1CC-211ENST00000620030 WWC1Q8IX03 1113 aa30.52■■■□□ 2.48
PPP1CC-211ENST00000620030 SMC1BQ8NDV3 1235 aa30.52■■■□□ 2.48
PPP1CC-211ENST00000620030 IARSP41252 1262 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
PPP1CC-211ENST00000620030 GRIPAP1Q4V328 841 aa30.51■■■□□ 2.47
PPP1CC-211ENST00000620030 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
PPP1CC-211ENST00000620030 SH3TC1Q8TE82 1336 aa30.5■■■□□ 2.47
PPP1CC-211ENST00000620030 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC51AQ86UW1 340 aa30.5■■■□□ 2.47
PPP1CC-211ENST00000620030 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
PPP1CC-211ENST00000620030 WDR90Q96KV7 1748 aa30.5■■■□□ 2.47
PPP1CC-211ENST00000620030 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
PPP1CC-211ENST00000620030 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa30.48■■■□□ 2.47
PPP1CC-211ENST00000620030 TSPYL6Q8N831 410 aa30.48■■■□□ 2.47
PPP1CC-211ENST00000620030 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa30.47■■■□□ 2.47
PPP1CC-211ENST00000620030 FZD9O00144 591 aa30.47■■■□□ 2.47
PPP1CC-211ENST00000620030 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
PPP1CC-211ENST00000620030 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa30.47■■■□□ 2.47
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF428Q96B54 188 aa30.47■■■□□ 2.47
PPP1CC-211ENST00000620030 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa30.47■■■□□ 2.47
PPP1CC-211ENST00000620030 ABCC4O15439 1325 aa30.47■■■□□ 2.47
PPP1CC-211ENST00000620030 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
PPP1CC-211ENST00000620030 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
PPP1CC-211ENST00000620030 BBOX1O75936 387 aa30.45■■■□□ 2.47
PPP1CC-211ENST00000620030 CCDC30Q5VVM6 783 aa30.45■■■□□ 2.47
PPP1CC-211ENST00000620030 RIC3Q7Z5B4 369 aa30.45■■■□□ 2.47
PPP1CC-211ENST00000620030 FAM89AQ96GI7 184 aa30.45■■■□□ 2.47
PPP1CC-211ENST00000620030 CHMP4AQ9BY43 222 aa30.45■■■□□ 2.47
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF541Q9H0D2 1346 aa30.45■■■□□ 2.46
PPP1CC-211ENST00000620030 GOLGA2Q08379 1002 aa30.43■■■□□ 2.46
PPP1CC-211ENST00000620030 IL16Q14005 1332 aa30.43■■■□□ 2.46
PPP1CC-211ENST00000620030 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
PPP1CC-211ENST00000620030 SP8Q8IXZ3 490 aa30.42■■■□□ 2.46
PPP1CC-211ENST00000620030 JDP2Q8WYK2 163 aa30.41■■■□□ 2.46
PPP1CC-211ENST00000620030 HTRA3P83110 453 aa30.4■■■□□ 2.46
PPP1CC-211ENST00000620030 GRAPQ13588 217 aa30.4■■■□□ 2.46
PPP1CC-211ENST00000620030 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
PPP1CC-211ENST00000620030 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
PPP1CC-211ENST00000620030 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
PPP1CC-211ENST00000620030 IQCA1LA6NCM1 817 aa30.39■■■□□ 2.46
PPP1CC-211ENST00000620030 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
PPP1CC-211ENST00000620030 VPS33BQ9H267 617 aa30.38■■■□□ 2.45
PPP1CC-211ENST00000620030 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
PPP1CC-211ENST00000620030 COL4A5P29400 1685 aa30.37■■■□□ 2.45
PPP1CC-211ENST00000620030 POTEIP0CG38 1075 aa30.37■■■□□ 2.45
PPP1CC-211ENST00000620030 POTEJP0CG39 1038 aa30.37■■■□□ 2.45
PPP1CC-211ENST00000620030 LARGE2Q8N3Y3 721 aa30.37■■■□□ 2.45
PPP1CC-211ENST00000620030 MYD88Q99836 296 aa30.37■■■□□ 2.45
PPP1CC-211ENST00000620030 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
PPP1CC-211ENST00000620030 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
PPP1CC-211ENST00000620030 WDR63Q8IWG1 891 aa30.36■■■□□ 2.45
PPP1CC-211ENST00000620030 GPC2Q8N158 579 aa30.36■■■□□ 2.45
PPP1CC-211ENST00000620030 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
PPP1CC-211ENST00000620030 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
PPP1CC-211ENST00000620030 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
PPP1CC-211ENST00000620030 CHADLQ6NUI6 762 aa30.35■■■□□ 2.45
PPP1CC-211ENST00000620030 CCDC191Q8NCU4 936 aa30.35■■■□□ 2.45
PPP1CC-211ENST00000620030 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
PPP1CC-211ENST00000620030 LAMB2P55268 1798 aa30.35■■■□□ 2.45
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