RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615329.4

RPS6KC1-209, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KC1, Length 4,022 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-209ENST00000615329 VPS53Q5VIR6 699 aa15.01□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 RAB11FIP3O75154 756 aa15.01□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 ZNF165P49910 485 aa15.01□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 ANAPC15P60006 121 aa15.01□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 ATP8B2P98198 1209 aa15.01□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 CEP57L1Q8IYX8 460 aa15.01□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 USHBP1Q8N6Y0 703 aa15.01□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 IL25Q9H293 177 aa15.01□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 PIK3R4Q99570 1358 aa15.01□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 ROBO2Q9HCK4 1378 aa15.01□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 TMCO3Q6UWJ1 677 aa15.01□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 RASEFQ8IZ41 740 aa15.01□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 SNX14Q9Y5W7 946 aa15.01□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 PNPLA6Q8IY17 1366 aa15□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 CUL4AQ13619 759 aa15□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa15□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 KIF18AQ8NI77 898 aa15□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 EID1Q9Y6B2 187 aa15□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 VGLL3A8MV65 326 aa15□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa15□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 DDX58O95786 925 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa15□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 RHPN1Q8TCX5 695 aa14.99□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 BOLA2Q9H3K6 86 aa14.99□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa14.99□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 LRMPQ12912 555 aa14.99□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 TTC5Q8N0Z6 440 aa14.99□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.99□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 LARGE1O95461 756 aa14.99□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 AK7Q96M32 723 aa14.99□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 TMEM2Q9UHN6 1383 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 ATP2B3Q16720 1220 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 ATP10DQ9P241 1426 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 RAD21O60216 631 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 USP32Q8NFA0 1604 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 ANO6Q4KMQ2 910 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 RUFY3Q7L099 469 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 DACT1Q9NYF0 836 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 ACBD3Q9H3P7 528 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 CENPHQ9H3R5 247 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 PRDM4Q9UKN5 801 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 HSPA4P34932 840 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 KIF1BPQ96EK5 621 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 AGLP35573 1532 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 MYL6BP14649 208 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-209ENST00000615329 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 CPLX3Q8WVH0 158 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 TYRO3Q06418 890 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 ZNF710Q8N1W2 664 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 DNAJC25Q9H1X3 360 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 KLHL10Q6JEL2 608 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 OSBPL3Q9H4L5 887 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 LIG1P18858 919 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 MAP3K19Q56UN5 1328 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 SGSM2O43147 1006 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 CPS1P31327 1500 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 RGS12O14924 1447 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 LRRC2Q9BYS8 371 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 FAM200AQ8TCP9 573 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 KIF24Q5T7B8 1368 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 PI4KAP2A4QPH2 592 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 PTH1RQ03431 593 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 CFAP45Q9UL16 551 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 ATP7BP35670 1465 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 CEP135Q66GS9 1140 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 TMC6Q7Z403 805 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 RAD50Q92878 1312 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 LMAN1P49257 510 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 CDC37L1Q7L3B6 337 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 USP44Q9H0E7 712 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-209ENST00000615329 PLCD4Q9BRC7 762 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.9 ms