RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
SGMS1-208ENST00000608287 NEFMP07197 916 aa25.39■■□□□ 1.66
SGMS1-208ENST00000608287 GRM1Q13255 1194 aa25.39■■□□□ 1.66
SGMS1-208ENST00000608287 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.39■■□□□ 1.66
SGMS1-208ENST00000608287 GJA3Q9Y6H8 435 aa25.39■■□□□ 1.66
SGMS1-208ENST00000608287 TLL2Q9Y6L7 1015 aa25.39■■□□□ 1.66
SGMS1-208ENST00000608287 BTBD11A6QL63 1104 aa25.38■■□□□ 1.65
SGMS1-208ENST00000608287 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SGMS1-208ENST00000608287 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa25.36■■□□□ 1.65
SGMS1-208ENST00000608287 HHIPL1Q96JK4 782 aa25.36■■□□□ 1.65
SGMS1-208ENST00000608287 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SGMS1-208ENST00000608287 NYXQ9GZU5 481 aa25.35■■□□□ 1.65
SGMS1-208ENST00000608287 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
SGMS1-208ENST00000608287 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
SGMS1-208ENST00000608287 MCOLN1Q9GZU1 580 aa25.34■■□□□ 1.65
SGMS1-208ENST00000608287 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
SGMS1-208ENST00000608287 OLFM4Q6UX06 510 aa25.33■■□□□ 1.65
SGMS1-208ENST00000608287 LARGE2Q8N3Y3 721 aa25.33■■□□□ 1.65
SGMS1-208ENST00000608287 LTBP1Q14766 1721 aa25.32■■□□□ 1.64
SGMS1-208ENST00000608287 SCNN1DP51172 638 aa25.32■■□□□ 1.64
SGMS1-208ENST00000608287 MCM10Q7L590 875 aa25.32■■□□□ 1.64
SGMS1-208ENST00000608287 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.32■■□□□ 1.64
SGMS1-208ENST00000608287 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
SGMS1-208ENST00000608287 USP16Q9Y5T5 823 aa25.32■■□□□ 1.64
SGMS1-208ENST00000608287 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.32■■□□□ 1.64
SGMS1-208ENST00000608287 SNED1Q8TER0 1413 aa25.31■■□□□ 1.64
SGMS1-208ENST00000608287 CRY2Q49AN0 593 aa25.31■■□□□ 1.64
SGMS1-208ENST00000608287 EPS15P42566 896 aa25.3■■□□□ 1.64
SGMS1-208ENST00000608287 CST9Q5W186 159 aa25.3■■□□□ 1.64
SGMS1-208ENST00000608287 NIM1KQ8IY84 436 aa25.3■■□□□ 1.64
SGMS1-208ENST00000608287 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
SGMS1-208ENST00000608287 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
SGMS1-208ENST00000608287 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa25.3■■□□□ 1.64
SGMS1-208ENST00000608287 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
SGMS1-208ENST00000608287 DCTN1Q14203 1278 aa25.29■■□□□ 1.64
SGMS1-208ENST00000608287 SAPCD2Q86UD0 394 aa25.29■■□□□ 1.64
SGMS1-208ENST00000608287 VPS33BQ9H267 617 aa25.29■■□□□ 1.64
SGMS1-208ENST00000608287 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.28■■□□□ 1.64
SGMS1-208ENST00000608287 FAM177BA6PVY3 158 aa25.28■■□□□ 1.64
SGMS1-208ENST00000608287 TSKSQ9UJT2 592 aa25.28■■□□□ 1.64
SGMS1-208ENST00000608287 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.28■■□□□ 1.64
SGMS1-208ENST00000608287 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa25.27■■□□□ 1.64
SGMS1-208ENST00000608287 DGKZQ13574 1117 aa25.27■■□□□ 1.64
SGMS1-208ENST00000608287 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.64
SGMS1-208ENST00000608287 TRAF5O00463 557 aa25.26■■□□□ 1.63
SGMS1-208ENST00000608287 AOC2O75106 756 aa25.26■■□□□ 1.63
SGMS1-208ENST00000608287 CELF2O95319 508 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SGMS1-208ENST00000608287 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
SGMS1-208ENST00000608287 NFE2L2Q16236 605 aa25.26■■□□□ 1.63
SGMS1-208ENST00000608287 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.26■■□□□ 1.63
SGMS1-208ENST00000608287 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SGMS1-208ENST00000608287 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SGMS1-208ENST00000608287 GPRC5DQ9NZD1 345 aa25.25■■□□□ 1.63
SGMS1-208ENST00000608287 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SGMS1-208ENST00000608287 KCNQ3O43525 872 aa25.24■■□□□ 1.63
SGMS1-208ENST00000608287 NOGQ13253 232 aa25.24■■□□□ 1.63
SGMS1-208ENST00000608287 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.633e-16■■■■■ 132.3
SGMS1-208ENST00000608287 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SGMS1-208ENST00000608287 PPIP5K2O43314 1243 aa25.22■■□□□ 1.63
SGMS1-208ENST00000608287 SUPT20HQ8NEM7 779 aa25.22■■□□□ 1.63
SGMS1-208ENST00000608287 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.22■■□□□ 1.63
SGMS1-208ENST00000608287 COL4A5P29400 1685 aa25.22■■□□□ 1.63
SGMS1-208ENST00000608287 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.21■■□□□ 1.63
SGMS1-208ENST00000608287 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.21■■□□□ 1.63
SGMS1-208ENST00000608287 ABCC12Q96J65 1359 aa25.19■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.19■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 NBPF26B4DH59 902 aa25.19■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.19■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 NBPF15Q8N660 670 aa25.19■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.19■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.18■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 RIPK4P57078 832 aa25.18■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 HLFQ16534 295 aa25.18■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 CIAPIN1Q6FI81 312 aa25.18■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.18■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.18■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 SAGE1Q9NXZ1 904 aa25.18■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 PGAP2Q9UHJ9 254 aa25.18■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 ZNRF3Q9ULT6 936 aa25.18■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 NUP98P52948 1817 aa25.18■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 RUNDC1Q96C34 613 aa25.16■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.16■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 ANP32CO43423 234 aa25.15■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 TNIP1Q15025 636 aa25.15■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.15■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.15■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.14■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 AOC3Q16853 763 aa25.14■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SGMS1-208ENST00000608287 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SGMS1-208ENST00000608287 CXCL9Q07325 125 aa25.13■■□□□ 1.61
SGMS1-208ENST00000608287 NEUROD2Q15784 382 aa25.13■■□□□ 1.61
SGMS1-208ENST00000608287 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
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