RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600240.5

LINC00635-210, long intergenic non-protein coding RNA 635, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00635, Length 714 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00635-210ENST00000600240 RIPK4P57078 832 aa11.76□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 NFKBIEO00221 500 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 SRGNP10124 158 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 MYL6BP14649 208 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 HLFQ16534 295 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 STYK1Q6J9G0 422 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 TPTE2Q6XPS3 522 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 CNKSR1Q969H4 720 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 MASTLQ96GX5 879 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 TRIM35Q9UPQ4 493 aa11.75□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 SLX4Q8IY92 1834 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 TSPYL4Q9UJ04 414 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 NUP98P52948 1817 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa11.74□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 GLTPD2A6NH11 291 aa11.73□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 RGL2O15211 777 aa11.73□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 TMPOP42166 694 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 APLP1P51693 650 aa11.73□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 NEUROD2Q15784 382 aa11.73□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 TIAM2Q8IVF5 1701 aa11.73□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 CCDC146Q8IYE0 955 aa11.73□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 ERVV-1B6SEH8 477 aa11.72□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 ST18O60284 1047 aa11.72□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 NPR1P16066 1061 aa11.72□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 ERFEQ4G0M1 354 aa11.72□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 KIF6Q6ZMV9 814 aa11.72□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 TTLL7Q6ZT98 887 aa11.72□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 MIER1Q8N108 512 aa11.72□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa11.72□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa11.71□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 LMOD3Q0VAK6 560 aa11.71□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP11.71□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 SOGA3Q5TF21 947 aa11.71□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 DPY19L2Q6NUT2 758 aa11.71□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 NUTM1Q86Y26 1132 aa11.71□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 TAOK3Q9H2K8 898 aa11.71□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 ZBTB3Q9H5J0 574 aa11.71□□□□□ -0.53
LINC00635-210ENST00000600240 CEP350Q5VT06 3117 aa11.71□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 GPTP24298 496 aa11.7□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 FSTL1Q12841 308 aa11.7□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 NYXQ9GZU5 481 aa11.7□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 LTBP3Q9NS15 1303 aa11.69□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 SLAIN1Q8ND83 568 aa11.69□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 C7orf43Q8WVR3 580 aa11.69□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 NECTIN2Q92692 538 aa11.69□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 RUNDC1Q96C34 613 aa11.69□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 BABAM1Q9NWV8 329 aa11.69□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 ADAMTS8Q9UP79 889 aa11.69□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 ERBB4Q15303 1308 aa11.68□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 ANXA1P04083 346 aa11.68□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 ALDH1B1P30837 517 aa11.68□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 CCDC93Q567U6 631 aa11.68□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 SUSD4Q5VX71 490 aa11.68□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 OLFM4Q6UX06 510 aa11.68□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 SMC1BQ8NDV3 1235 aa11.68□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 WDR90Q96KV7 1748 aa11.68□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 UBN2Q6ZU65 1347 aa11.67□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 POTECB2RU33 542 aa11.67□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 HTRA3P83110 453 aa11.67□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 PDIA6Q15084 440 aa11.67□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 PROSER3Q2NL68 480 aa11.67□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 ZNF34Q8IZ26 560 aa11.67□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa11.67□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 ABCC12Q96J65 1359 aa11.67□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 CHL1O00533 1208 aa11.66□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 DDNO94850 711 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 KRT24Q2M2I5 525 aa11.66□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa11.66□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 RTKN2Q8IZC4 609 aa11.66□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa11.66□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 CRY2Q49AN0 593 aa11.65□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 IER5LQ5T953 404 aa11.65□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 COPS6Q7L5N1 327 aa11.65□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 LRP10Q7Z4F1 713 aa11.65□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 IFNL1Q8IU54 200 aa11.65□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 SYNE4Q8N205 404 aa11.65□□□□□ -0.54
LINC00635-210ENST00000600240 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
LINC00635-210ENST00000600240 NTSR2O95665 410 aa11.64□□□□□ -0.55
LINC00635-210ENST00000600240 PARP10Q53GL7 1025 aa11.64□□□□□ -0.55
LINC00635-210ENST00000600240 XAGE3Q8WTP9 111 aa11.64□□□□□ -0.55
LINC00635-210ENST00000600240 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms