RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594693.5

ZNF548-204, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF548, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-204ENST00000594693 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.41■■□□□ 1.18
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ZNF548-204ENST00000594693 ERFEQ4G0M1 354 aa22.41■■□□□ 1.18
ZNF548-204ENST00000594693 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.41■■□□□ 1.18
ZNF548-204ENST00000594693 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.41■■□□□ 1.18
ZNF548-204ENST00000594693 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.41■■□□□ 1.18
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ZNF548-204ENST00000594693 SYT17Q9BSW7 474 aa22.41■■□□□ 1.18
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ZNF548-204ENST00000594693 TGFB2P61812 414 aa22.4■■□□□ 1.18
ZNF548-204ENST00000594693 GCKRQ14397 625 aa22.4■■□□□ 1.18
ZNF548-204ENST00000594693 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
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ZNF548-204ENST00000594693 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.39■■□□□ 1.17
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ZNF548-204ENST00000594693 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
ZNF548-204ENST00000594693 KLHL34Q8N239 644 aa22.38■■□□□ 1.17
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ZNF548-204ENST00000594693 A0A0G2JLW4 131 aa22.34■■□□□ 1.17
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ZNF548-204ENST00000594693 CASP7P55210 303 aa22.34■■□□□ 1.17
ZNF548-204ENST00000594693 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
ZNF548-204ENST00000594693 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
ZNF548-204ENST00000594693 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
ZNF548-204ENST00000594693 NLRP3Q96P20 1036 aa22.33■■□□□ 1.17
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ZNF548-204ENST00000594693 H0YIN7 160 aa22.32■■□□□ 1.16
ZNF548-204ENST00000594693 CHRNA5P30532 468 aa22.32■■□□□ 1.16
ZNF548-204ENST00000594693 CRY2Q49AN0 593 aa22.32■■□□□ 1.16
ZNF548-204ENST00000594693 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.32■■□□□ 1.16
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ZNF548-204ENST00000594693 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.3■■□□□ 1.16
ZNF548-204ENST00000594693 PDE8AO60658 829 aa22.29■■□□□ 1.16
ZNF548-204ENST00000594693 RLBP1P12271 317 aa22.29■■□□□ 1.16
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ZNF548-204ENST00000594693 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
ZNF548-204ENST00000594693 STYK1Q6J9G0 422 aa22.28■■□□□ 1.16
ZNF548-204ENST00000594693 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.28■■□□□ 1.16
ZNF548-204ENST00000594693 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
ZNF548-204ENST00000594693 MASTLQ96GX5 879 aa22.28■■□□□ 1.16
ZNF548-204ENST00000594693 NPR1P16066 1061 aa22.27■■□□□ 1.16
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ZNF548-204ENST00000594693 PDE3AQ14432 1141 aa22.25■■□□□ 1.15
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ZNF548-204ENST00000594693 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
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ZNF548-204ENST00000594693 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.24■■□□□ 1.15
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ZNF548-204ENST00000594693 ALDH1B1P30837 517 aa22.23■■□□□ 1.15
ZNF548-204ENST00000594693 CTSWP56202 376 aa22.23■■□□□ 1.15
ZNF548-204ENST00000594693 TTLL6Q8N841 843 aa22.23■■□□□ 1.15
ZNF548-204ENST00000594693 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
ZNF548-204ENST00000594693 CNKSR1Q969H4 720 aa22.23■■□□□ 1.15
ZNF548-204ENST00000594693 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
ZNF548-204ENST00000594693 SUCLG2Q96I99 432 aa22.23■■□□□ 1.15
ZNF548-204ENST00000594693 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
ZNF548-204ENST00000594693 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
ZNF548-204ENST00000594693 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.22■■□□□ 1.15
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