RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 BTBD11A6QL63 1104 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 E9PSI1 815 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 CHL1O00533 1208 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNQ4P56696 695 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 TREML4Q6UXN2 200 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 PIGBQ92521 554 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 BCL2L13Q9BXK5 485 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 IFT57Q9NWB7 429 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 ASAP1Q9ULH1 1129 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 SBF2Q86WG5 1849 aa7.82□□□□□ -1.16
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CAPNS1-208ENST00000589162 PAPPAQ13219 1627 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 KAT6BQ8WYB5 2073 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 GNAI1P63096 354 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 KRT27Q7Z3Y8 459 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 CFAP44Q96MT7 982 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 MYH16Q9H6N6 1097 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 TMOD3Q9NYL9 352 aa7.82□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 BTAF1O14981 1849 aa7.81□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 NGEFQ8N5V2 710 aa7.81□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 ATG3Q9NT62 314 aa7.81□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 TNNQ9UQP3 1299 aa7.81□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 NHSQ6T4R5 1651 aa7.81□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 KCPQ6ZWJ8 1503 aa7.81□□□□□ -1.16
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CAPNS1-208ENST00000589162 UBR2Q8IWV8 1755 aa7.8□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 ERVV-2B6SEH9 535 aa7.8□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 PLIN1O60240 522 aa7.8□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 BCAR3O75815 825 aa7.8□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM37O94972 964 aa7.8□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 ANXA1P04083 346 aa7.8□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.8□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 STK17AQ9UEE5 414 aa7.8□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa7.8□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 TJP1Q07157 1748 aa7.79□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 VAMP4O75379 141 aa7.79□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 PRR20EP86478 221 aa7.79□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 PRR20CP86479 221 aa7.79□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 PRR20DP86480 221 aa7.79□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 PRR20BP86481 221 aa7.79□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 PRR20AP86496 221 aa7.79□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
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CAPNS1-208ENST00000589162 SSH1Q8WYL5 1049 aa7.78□□□□□ -1.16
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CAPNS1-208ENST00000589162 USP16Q9Y5T5 823 aa7.78□□□□□ -1.16
CAPNS1-208ENST00000589162 PALLDQ8WX93 1383 aa7.77□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 HEG1Q9ULI3 1381 aa7.77□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 ITPK1Q13572 414 aa7.77□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 PROSER3Q2NL68 480 aa7.77□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 G2E3Q7L622 706 aa7.77□□□□□ -1.17
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CAPNS1-208ENST00000589162 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 LAMB4A4D0S4 1761 aa7.76□□□□□ -1.17
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CAPNS1-208ENST00000589162 RARSP54136 660 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 C20orf194Q5TEA3 1177 aa7.76□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM196AQ6ZSG2 479 aa7.76□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF428Q96B54 188 aa7.76□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 FMNL2Q96PY5 1086 aa7.76□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 SMC4Q9NTJ3 1288 aa7.76□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 A1BGP04217 495 aa7.75□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 MYL6BP14649 208 aa7.75□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC19A1P41440 591 aa7.75□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC4A3P48751 1232 aa7.75□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa7.75□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 CHPF2Q9P2E5 772 aa7.75□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 LY75O60449 1722 aa7.75□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa7.74□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 NBPF26B4DH59 902 aa7.74□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 APBA3O96018 575 aa7.74□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP6V1AP38606 617 aa7.74□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 SIK1P57059 783 aa7.74□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 NBPF14Q5TI25 921 aa7.74□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 DEFB132Q7Z7B7 95 aa7.74□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
CAPNS1-208ENST00000589162 NBPF15Q8N660 670 aa7.74□□□□□ -1.17
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