RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
GGA3-217ENST00000583667 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
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GGA3-217ENST00000583667 TAOK3Q9H2K8 898 aa15.23■□□□□ 0.03
GGA3-217ENST00000583667 TSPYL4Q9UJ04 414 aa15.23■□□□□ 0.03
GGA3-217ENST00000583667 THSD7BQ9C0I4 1608 aa15.23■□□□□ 0.03
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GGA3-217ENST00000583667 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP15.22■□□□□ 0.03
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GGA3-217ENST00000583667 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP15.22■□□□□ 0.03
GGA3-217ENST00000583667 HACL1Q9UJ83 578 aa15.22■□□□□ 0.03
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GGA3-217ENST00000583667 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP15.2■□□□□ 0.02
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GGA3-217ENST00000583667 STYK1Q6J9G0 422 aa15.09■□□□□ 0.01
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GGA3-217ENST00000583667 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
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GGA3-217ENST00000583667 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
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