RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TTC41PQ6P2S7 1318 aa29.21■■■□□ 2.27
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DNAJC10Q8IXB1 793 aa29.21■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PKP1Q13835 747 aa29.21■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.27
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GPATCH3Q96I76 525 aa29.18■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANO2Q9NQ90 1003 aa29.18■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ECHDC1Q9NTX5 307 aa29.18■■■□□ 2.26
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LMBRD1Q9NUN5 540 aa29.17■■■□□ 2.26
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 COL15A1P39059 1388 aa29.16■■■□□ 2.26
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa29.14■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NRAPQ86VF7 1730 aa29.14■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TOM1O60784 492 aa29.14■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 STARD3NLO95772 234 aa29.14■■■□□ 2.26
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZDHHC9Q9Y397 364 aa29.14■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LRP6O75581 1613 aa29.13■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LMBR1LQ6UX01 489 aa29.13■■■□□ 2.25
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CHMP3Q9Y3E7 222 aa29.13■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF445P59923 1031 aa29.13■■■□□ 2.25
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC191Q8NCU4 936 aa29.12■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPP1R9BQ96SB3 815 aa29.12■■■□□ 2.25
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TNNI3KQ59H18 835 aa29.04■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GPT2Q8TD30 523 aa29.04■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ACSBG1Q96GR2 724 aa29.04■■■□□ 2.24
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.02■■■□□ 2.24
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NCLP19338 710 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANAPC15P60006 121 aa29.01■■■□□ 2.23
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLIT2O94813 1529 aa29■■■□□ 2.23
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IL17RAQ96F46 866 aa29■■■□□ 2.23
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RAD50Q92878 1312 aa29■■■□□ 2.23
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NWD2Q9ULI1 1742 aa29■■■□□ 2.23
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HLFQ16534 295 aa29■■■□□ 2.23
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