RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576589.1

NOMO3-217, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 5

Gene NOMO3, Length 683 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-217ENST00000576589 VAMP4O75379 141 aa36.25■■■■□ 3.39
NOMO3-217ENST00000576589 C9orf131Q5VYM1 1079 aa36.25■■■■□ 3.39
NOMO3-217ENST00000576589 STYK1Q6J9G0 422 aa36.25■■■■□ 3.39
NOMO3-217ENST00000576589 ABCC12Q96J65 1359 aa36.25■■■■□ 3.39
NOMO3-217ENST00000576589 CNKSR1Q969H4 720 aa36.23■■■■□ 3.39
NOMO3-217ENST00000576589 NPR1P16066 1061 aa36.22■■■■□ 3.39
NOMO3-217ENST00000576589 DDX58O95786 925 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
NOMO3-217ENST00000576589 SLC4A2P04920 1241 aa36.21■■■■□ 3.39
NOMO3-217ENST00000576589 ISCA1Q9BUE6 129 aa36.21■■■■□ 3.39
NOMO3-217ENST00000576589 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa36.21■■■■□ 3.39
NOMO3-217ENST00000576589 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa36.2■■■■□ 3.39
NOMO3-217ENST00000576589 TOMM70O94826 608 aa36.2■■■■□ 3.39
NOMO3-217ENST00000576589 NMRK2Q9NPI5 230 aa36.2■■■■□ 3.39
NOMO3-217ENST00000576589 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
NOMO3-217ENST00000576589 DLEC1Q9Y238 1755 aa36.18■■■■□ 3.38
NOMO3-217ENST00000576589 RNF123Q5XPI4 1314 aa36.18■■■■□ 3.38
NOMO3-217ENST00000576589 E9PSI1 815 aa36.18■■■■□ 3.38
NOMO3-217ENST00000576589 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
NOMO3-217ENST00000576589 ZNF428Q96B54 188 aa36.17■■■■□ 3.38
NOMO3-217ENST00000576589 SLC10A5Q5PT55 438 aa36.16■■■■□ 3.38
NOMO3-217ENST00000576589 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
NOMO3-217ENST00000576589 G2E3Q7L622 706 aa36.16■■■■□ 3.38
NOMO3-217ENST00000576589 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
NOMO3-217ENST00000576589 RIC1Q4ADV7 1423 aa36.16■■■■□ 3.38
NOMO3-217ENST00000576589 C21orf2O43822 256 aa36.15■■■■□ 3.38
NOMO3-217ENST00000576589 CRY2Q49AN0 593 aa36.15■■■■□ 3.38
NOMO3-217ENST00000576589 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
NOMO3-217ENST00000576589 NLRP3Q96P20 1036 aa36.14■■■■□ 3.38
NOMO3-217ENST00000576589 MYD88Q99836 296 aa36.14■■■■□ 3.38
NOMO3-217ENST00000576589 RNF181Q9P0P0 153 aa36.14■■■■□ 3.38
NOMO3-217ENST00000576589 SH3TC1Q8TE82 1336 aa36.13■■■■□ 3.37
NOMO3-217ENST00000576589 SLFN5Q08AF3 891 aa36.13■■■■□ 3.37
NOMO3-217ENST00000576589 KSR2Q6VAB6 950 aa36.13■■■■□ 3.37
NOMO3-217ENST00000576589 SYNE4Q8N205 404 aa36.13■■■■□ 3.37
NOMO3-217ENST00000576589 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
NOMO3-217ENST00000576589 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa36.13■■■■□ 3.37
NOMO3-217ENST00000576589 PI4KAP2A4QPH2 592 aa36.12■■■■□ 3.37
NOMO3-217ENST00000576589 ALDH1B1P30837 517 aa36.12■■■■□ 3.37
NOMO3-217ENST00000576589 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa36.12■■■■□ 3.37
NOMO3-217ENST00000576589 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
NOMO3-217ENST00000576589 APLP1P51693 650 aa36.11■■■■□ 3.37
NOMO3-217ENST00000576589 C3orf67Q6ZVT6 689 aa36.11■■■■□ 3.37
NOMO3-217ENST00000576589 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa36.11■■■■□ 3.37
NOMO3-217ENST00000576589 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
NOMO3-217ENST00000576589 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
NOMO3-217ENST00000576589 FLIIQ13045 1269 aa36.1■■■■□ 3.37
NOMO3-217ENST00000576589 CDCA7LQ96GN5 454 aa36.1■■■■□ 3.37
NOMO3-217ENST00000576589 RASSF7Q02833 373 aa36.08■■■■□ 3.37
NOMO3-217ENST00000576589 FAM89AQ96GI7 184 aa36.08■■■■□ 3.37
NOMO3-217ENST00000576589 KDM2BQ8NHM5 1336 aa36.08■■■■□ 3.37
NOMO3-217ENST00000576589 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.36
NOMO3-217ENST00000576589 SOGA3Q5TF21 947 aa36.06■■■■□ 3.36
NOMO3-217ENST00000576589 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
NOMO3-217ENST00000576589 CCDC191Q8NCU4 936 aa36.06■■■■□ 3.36
NOMO3-217ENST00000576589 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
NOMO3-217ENST00000576589 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa36.06■■■■□ 3.36
NOMO3-217ENST00000576589 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
NOMO3-217ENST00000576589 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
NOMO3-217ENST00000576589 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
NOMO3-217ENST00000576589 C7orf43Q8WVR3 580 aa36.05■■■■□ 3.36
NOMO3-217ENST00000576589 NFKBIEO00221 500 aa36.04■■■■□ 3.36
NOMO3-217ENST00000576589 NEXNQ0ZGT2 675 aa36.04■■■■□ 3.36
NOMO3-217ENST00000576589 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
NOMO3-217ENST00000576589 IFFO2Q5TF58 517 aa36.03■■■■□ 3.36
NOMO3-217ENST00000576589 CRAMP1Q96RY5 1269 aa36.03■■■■□ 3.36
NOMO3-217ENST00000576589 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
NOMO3-217ENST00000576589 SLX4Q8IY92 1834 aa36.01■■■■□ 3.36
NOMO3-217ENST00000576589 CCDC93Q567U6 631 aa36.01■■■■□ 3.36
NOMO3-217ENST00000576589 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.36
NOMO3-217ENST00000576589 RRAGCQ9HB90 399 aa36.01■■■■□ 3.36
NOMO3-217ENST00000576589 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
NOMO3-217ENST00000576589 IGKV5-2P06315 115 aa36■■■■□ 3.35
NOMO3-217ENST00000576589 LMNB1P20700 586 aa36■■■■□ 3.35
NOMO3-217ENST00000576589 PRELPP51888 382 aa35.99■■■■□ 3.35
NOMO3-217ENST00000576589 SBF1O95248 1867 aa35.99■■■■□ 3.35
NOMO3-217ENST00000576589 OLFM4Q6UX06 510 aa35.98■■■■□ 3.35
NOMO3-217ENST00000576589 DNAAF4Q8WXU2 420 aa35.98■■■■□ 3.35
NOMO3-217ENST00000576589 TAOK3Q9H2K8 898 aa35.98■■■■□ 3.35
NOMO3-217ENST00000576589 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
NOMO3-217ENST00000576589 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
NOMO3-217ENST00000576589 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa35.97■■■■□ 3.35
NOMO3-217ENST00000576589 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
NOMO3-217ENST00000576589 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
NOMO3-217ENST00000576589 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
NOMO3-217ENST00000576589 ABCC4O15439 1325 aa35.95■■■■□ 3.35
NOMO3-217ENST00000576589 LTBP3Q9NS15 1303 aa35.95■■■■□ 3.35
NOMO3-217ENST00000576589 NEURL1BA8MQ27 555 aa35.95■■■■□ 3.35
NOMO3-217ENST00000576589 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP35.95■■■■□ 3.35
NOMO3-217ENST00000576589 FSTL1Q12841 308 aa35.95■■■■□ 3.35
NOMO3-217ENST00000576589 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
NOMO3-217ENST00000576589 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
NOMO3-217ENST00000576589 RTKN2Q8IZC4 609 aa35.94■■■■□ 3.34
NOMO3-217ENST00000576589 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
NOMO3-217ENST00000576589 F6X3S4 739 aa35.92■■■■□ 3.34
NOMO3-217ENST00000576589 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa35.92■■■■□ 3.34
NOMO3-217ENST00000576589 CACNA1SQ13698 1873 aa35.91■■■■□ 3.34
NOMO3-217ENST00000576589 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP35.9■■■■□ 3.34
NOMO3-217ENST00000576589 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
NOMO3-217ENST00000576589 LINS1Q8NG48 757 aa35.9■■■■□ 3.34
NOMO3-217ENST00000576589 BBOX1O75936 387 aa35.89■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms