RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-208ENST00000574234 DEFB115Q30KQ5 88 aa7.38□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa7.38□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 NLRP7Q8WX94 980 aa7.38□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 IP6K1Q92551 441 aa7.38□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 MCOLN1Q9GZU1 580 aa7.38□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 MTMR7Q9Y216 660 aa7.38□□□□□ -1.23
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TRIM25-208ENST00000574234 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 DIXDC1Q155Q3 683 aa7.37□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 TRAPPC3LQ5T215 181 aa7.37□□□□□ -1.23
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TRIM25-208ENST00000574234 MTMR14Q8NCE2 650 aa7.37□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 PXYLP1Q8TE99 480 aa7.37□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 GDPD2Q9HCC8 539 aa7.37□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa7.36□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 MAP3K19Q56UN5 1328 aa7.36□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 EVC2Q86UK5 1308 aa7.36□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
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TRIM25-208ENST00000574234 POTEJP0CG39 1038 aa7.36□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 SLAIN1Q8ND83 568 aa7.36□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 LIMD1Q9UGP4 676 aa7.36□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.36□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 ADGRG1Q9Y653 693 aa7.36□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 AKAP11Q9UKA4 1901 aa7.36□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 IQCA1LA6NCM1 817 aa7.35□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 CA12O43570 354 aa7.35□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 PDE4CQ08493 712 aa7.35□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 ITPK1Q13572 414 aa7.35□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 KDRP35968 1356 aa7.34□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa7.34□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 CHRNA5P30532 468 aa7.34□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 ATP6V1AP38606 617 aa7.34□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 ECE1P42892 770 aa7.34□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.34□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 TYW1BQ6NUM6 668 aa7.34□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 PIGBQ92521 554 aa7.34□□□□□ -1.23
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TRIM25-208ENST00000574234 RTL1A6NKG5 1358 aa7.33□□□□□ -1.24
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TRIM25-208ENST00000574234 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
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TRIM25-208ENST00000574234 MAP2K2P36507 400 aa7.32□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 NBPF1Q3BBV0 1214 aa7.32□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 ERFEQ4G0M1 354 aa7.32□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 NME9Q86XW9 330 aa7.32□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.32□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 GLMNQ92990 594 aa7.32□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 SZT2Q5T011 3432 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 BCORQ6W2J9 1755 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 SPTLC1O15269 473 aa7.31□□□□□ -1.24
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TRIM25-208ENST00000574234 DDR1Q08345 913 aa7.31□□□□□ -1.24
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TRIM25-208ENST00000574234 NBPF15Q8N660 670 aa7.31□□□□□ -1.24
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TRIM25-208ENST00000574234 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 FBXW7Q969H0 707 aa7.31□□□□□ -1.24
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TRIM25-208ENST00000574234 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
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TRIM25-208ENST00000574234 INSRP06213 1382 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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TRIM25-208ENST00000574234 DDNO94850 711 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 ABL2P42684 1182 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 SOX10P56693 466 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 NBPF6Q5VWK0 638 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 NBPF4Q96M43 638 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 PRM3Q9NNZ6 103 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 SCN11AQ9UI33 1791 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 NCAPD2Q15021 1401 aa7.29□□□□□ -1.24
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