RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-208ENST00000574234 DEFB115Q30KQ5 88 aa7.38□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa7.38□□□□□ -1.23
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TRIM25-208ENST00000574234 IP6K1Q92551 441 aa7.38□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 MCOLN1Q9GZU1 580 aa7.38□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 MTMR7Q9Y216 660 aa7.38□□□□□ -1.23
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TRIM25-208ENST00000574234 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 DIXDC1Q155Q3 683 aa7.37□□□□□ -1.23
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TRIM25-208ENST00000574234 EVC2Q86UK5 1308 aa7.36□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
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TRIM25-208ENST00000574234 CA12O43570 354 aa7.35□□□□□ -1.23
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TRIM25-208ENST00000574234 ITPK1Q13572 414 aa7.35□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
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TRIM25-208ENST00000574234 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa7.34□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
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TRIM25-208ENST00000574234 ECE1P42892 770 aa7.34□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.34□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 TYW1BQ6NUM6 668 aa7.34□□□□□ -1.23
TRIM25-208ENST00000574234 PIGBQ92521 554 aa7.34□□□□□ -1.23
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TRIM25-208ENST00000574234 NME9Q86XW9 330 aa7.32□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
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TRIM25-208ENST00000574234 GLMNQ92990 594 aa7.32□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 SZT2Q5T011 3432 aa7.31□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 BCORQ6W2J9 1755 aa7.31□□□□□ -1.24
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TRIM25-208ENST00000574234 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
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TRIM25-208ENST00000574234 SOX10P56693 466 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 NBPF6Q5VWK0 638 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 NBPF4Q96M43 638 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 PRM3Q9NNZ6 103 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 SCN11AQ9UI33 1791 aa7.3□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 NCAPD2Q15021 1401 aa7.29□□□□□ -1.24
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