RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570016.5

CDIPT-210, Transcript of CDP-diacylglycerol--inositol 3-phosphatidyltransferase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CDIPT, Length 1,346 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDIPT-210ENST00000570016 CHMP4AQ9BY43 222 aa28.11■■■□□ 2.09
CDIPT-210ENST00000570016 CACNA1SQ13698 1873 aa28.1■■■□□ 2.09
CDIPT-210ENST00000570016 ALDH1B1P30837 517 aa28.1■■■□□ 2.09
CDIPT-210ENST00000570016 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa28.1■■■□□ 2.09
CDIPT-210ENST00000570016 NLRP10Q86W26 655 aa28.1■■■□□ 2.09
CDIPT-210ENST00000570016 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
CDIPT-210ENST00000570016 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
CDIPT-210ENST00000570016 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
CDIPT-210ENST00000570016 KIF3CO14782 793 aa28.08■■■□□ 2.09
CDIPT-210ENST00000570016 WDR63Q8IWG1 891 aa28.07■■■□□ 2.08
CDIPT-210ENST00000570016 TSPYL6Q8N831 410 aa28.06■■■□□ 2.08
CDIPT-210ENST00000570016 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
CDIPT-210ENST00000570016 ISCA1Q9BUE6 129 aa28.06■■■□□ 2.08
CDIPT-210ENST00000570016 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
CDIPT-210ENST00000570016 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa28.05■■■□□ 2.08
CDIPT-210ENST00000570016 CCDC30Q5VVM6 783 aa28.05■■■□□ 2.08
CDIPT-210ENST00000570016 TAOK3Q9H2K8 898 aa28.05■■■□□ 2.08
CDIPT-210ENST00000570016 SNED1Q8TER0 1413 aa28.04■■■□□ 2.08
CDIPT-210ENST00000570016 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa28.04■■■□□ 2.08
CDIPT-210ENST00000570016 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
CDIPT-210ENST00000570016 CCDC93Q567U6 631 aa28.04■■■□□ 2.08
CDIPT-210ENST00000570016 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
CDIPT-210ENST00000570016 NLRP3Q96P20 1036 aa28.03■■■□□ 2.08
CDIPT-210ENST00000570016 CRAMP1Q96RY5 1269 aa28.03■■■□□ 2.08
CDIPT-210ENST00000570016 TIAM2Q8IVF5 1701 aa28.02■■■□□ 2.08
CDIPT-210ENST00000570016 C3orf67Q6ZVT6 689 aa28.02■■■□□ 2.08
CDIPT-210ENST00000570016 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.02■■■□□ 2.08
CDIPT-210ENST00000570016 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
CDIPT-210ENST00000570016 KDM2BQ8NHM5 1336 aa28.02■■■□□ 2.08
CDIPT-210ENST00000570016 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
CDIPT-210ENST00000570016 SH3TC1Q8TE82 1336 aa28.01■■■□□ 2.07
CDIPT-210ENST00000570016 RTKN2Q8IZC4 609 aa28■■■□□ 2.07
CDIPT-210ENST00000570016 NMRK2Q9NPI5 230 aa28■■■□□ 2.07
CDIPT-210ENST00000570016 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
CDIPT-210ENST00000570016 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
CDIPT-210ENST00000570016 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa27.99■■■□□ 2.07
CDIPT-210ENST00000570016 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
CDIPT-210ENST00000570016 FANCIQ9NVI1 1328 aa27.99■■■□□ 2.07
CDIPT-210ENST00000570016 GLTPD2A6NH11 291 aa27.98■■■□□ 2.07
CDIPT-210ENST00000570016 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP27.98■■■□□ 2.07
CDIPT-210ENST00000570016 GOLGA2Q08379 1002 aa27.98■■■□□ 2.07
CDIPT-210ENST00000570016 LAMB2P55268 1798 aa27.97■■■□□ 2.07
CDIPT-210ENST00000570016 GRIPAP1Q4V328 841 aa27.96■■■□□ 2.07
CDIPT-210ENST00000570016 OLFM4Q6UX06 510 aa27.96■■■□□ 2.07
CDIPT-210ENST00000570016 RIC3Q7Z5B4 369 aa27.96■■■□□ 2.07
CDIPT-210ENST00000570016 SYNE4Q8N205 404 aa27.96■■■□□ 2.07
CDIPT-210ENST00000570016 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.07
CDIPT-210ENST00000570016 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa27.94■■■□□ 2.06
CDIPT-210ENST00000570016 TOMM70O94826 608 aa27.94■■■□□ 2.06
CDIPT-210ENST00000570016 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
CDIPT-210ENST00000570016 PSMD1Q99460 953 aa27.94■■■□□ 2.06
CDIPT-210ENST00000570016 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
CDIPT-210ENST00000570016 ZNF521Q96K83 1311 aa27.94■■■□□ 2.06
CDIPT-210ENST00000570016 DDX58O95786 925 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
CDIPT-210ENST00000570016 STK31Q9BXU1 1019 aa27.92■■■□□ 2.06
CDIPT-210ENST00000570016 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
CDIPT-210ENST00000570016 ABCC4O15439 1325 aa27.92■■■□□ 2.06
CDIPT-210ENST00000570016 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
CDIPT-210ENST00000570016 CCDC191Q8NCU4 936 aa27.92■■■□□ 2.06
CDIPT-210ENST00000570016 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
CDIPT-210ENST00000570016 VAMP4O75379 141 aa27.91■■■□□ 2.06
CDIPT-210ENST00000570016 DPY19L2Q6NUT2 758 aa27.91■■■□□ 2.06
CDIPT-210ENST00000570016 FAM89AQ96GI7 184 aa27.91■■■□□ 2.06
CDIPT-210ENST00000570016 RRAGCQ9HB90 399 aa27.91■■■□□ 2.06
CDIPT-210ENST00000570016 WDR90Q96KV7 1748 aa27.9■■■□□ 2.06
CDIPT-210ENST00000570016 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
CDIPT-210ENST00000570016 KSR2Q6VAB6 950 aa27.9■■■□□ 2.06
CDIPT-210ENST00000570016 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
CDIPT-210ENST00000570016 BBOX1O75936 387 aa27.89■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 MYD88Q99836 296 aa27.89■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa27.89■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 CACNA1FO60840 1977 aa27.88■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 SLC4A2P04920 1241 aa27.88■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 MYH16Q9H6N6 1097 aa27.88■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 PI4KAP2A4QPH2 592 aa27.87■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 CCER2I3L3R5 266 aa27.87■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 IARSP41252 1262 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa27.87■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa27.87■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 POTECB2RU33 542 aa27.86■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 GRAPQ13588 217 aa27.86■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 G2E3Q7L622 706 aa27.86■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 SP8Q8IXZ3 490 aa27.85■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 FZD9O00144 591 aa27.84■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 HSPA6P17066 643 aa27.84■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 TMC4Q7Z404 712 aa27.84■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 SLC51AQ86UW1 340 aa27.84■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 ZNF428Q96B54 188 aa27.84■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 IGKV5-2P06315 115 aa27.83■■■□□ 2.05
CDIPT-210ENST00000570016 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
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