RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 PSMD1Q99460 953 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 NUP98P52948 1817 aa21.58■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 NTSR2O95665 410 aa21.58■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 NECTIN2Q92692 538 aa21.58■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 ABCC12Q96J65 1359 aa21.58■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa21.58■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 SYNE4Q8N205 404 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 WDR90Q96KV7 1748 aa21.56■■□□□ 1.04
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SPNS1-211ENST00000568829 GNAI1P63096 354 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 HYPKQ9NX55 129 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 ANXA1P04083 346 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 TCIRG1Q13488 830 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 PROSER3Q2NL68 480 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 CACNA1SQ13698 1873 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 KLRG1Q96E93 195 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 IFT57Q9NWB7 429 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 APAF1O14727 1248 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 EIF6P56537 245 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 CHADLQ6NUI6 762 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 NLRP10Q86W26 655 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 SUPT20HQ8NEM7 779 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 VPS33BQ9H267 617 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 POTECB2RU33 542 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 BBOX1O75936 387 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS1-211ENST00000568829 FZD9O00144 591 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-211ENST00000568829 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-211ENST00000568829 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-211ENST00000568829 LDHDQ86WU2 507 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-211ENST00000568829 GPC2Q8N158 579 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-211ENST00000568829 MBIPQ9NS73 344 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-211ENST00000568829 HACL1Q9UJ83 578 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS1-211ENST00000568829 KRT24Q2M2I5 525 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-211ENST00000568829 OLFM4Q6UX06 510 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-211ENST00000568829 TMC4Q7Z404 712 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-211ENST00000568829 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-211ENST00000568829 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-211ENST00000568829 GOLGA2Q08379 1002 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF853P0CG23 659 aa21.48■■□□□ 1.03
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SPNS1-211ENST00000568829 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
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SPNS1-211ENST00000568829 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-211ENST00000568829 NIM1KQ8IY84 436 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-211ENST00000568829 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-211ENST00000568829 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-211ENST00000568829 SP8Q8IXZ3 490 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-211ENST00000568829 JMYQ8N9B5 988 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF541Q9H0D2 1346 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-211ENST00000568829 SCN4AP35499 1836 aa21.45■■□□□ 1.03
SPNS1-211ENST00000568829 PPIP5K2O43314 1243 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-211ENST00000568829 EPHX2P34913 555 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-211ENST00000568829 HTRA3P83110 453 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-211ENST00000568829 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
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SPNS1-211ENST00000568829 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
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SPNS1-211ENST00000568829 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-211ENST00000568829 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-211ENST00000568829 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-211ENST00000568829 ABCC4O15439 1325 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-211ENST00000568829 ANP32CO43423 234 aa21.44■■□□□ 1.02
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SPNS1-211ENST00000568829 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.44■■□□□ 1.02
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SPNS1-211ENST00000568829 GJA3Q9Y6H8 435 aa21.44■■□□□ 1.02
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SPNS1-211ENST00000568829 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-211ENST00000568829 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-211ENST00000568829 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-211ENST00000568829 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-211ENST00000568829 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-211ENST00000568829 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-211ENST00000568829 IFFO2Q5TF58 517 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-211ENST00000568829 FAM89AQ96GI7 184 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-211ENST00000568829 STK31Q9BXU1 1019 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-211ENST00000568829 ZNRF3Q9ULT6 936 aa21.39■■□□□ 1.01
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