RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567432.1

GINS3-208, Transcript of GINS complex subunit 3, human

TSL 3

Gene GINS3, Length 322 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GINS3-208	ENST00000567432	GPR152	Q8TDT2	470 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	EDEM1	Q92611	657 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	BRD7	Q9NPI1	651 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	GPR25	O00155	361 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	NDUFB5	O43674	189 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	VSIG8	P0DPA2	414 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	PCSK2	P16519	638 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	CCDC27	Q2M243	656 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	STRN4	Q9NRL3	753 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	MARK1	Q9P0L2	795 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	USP20	Q9Y2K6	914 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	PDGFA	P04085	211 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	CD33	P20138	364 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	FGFR3	P22607	806 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	USP5	P45974	858 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	TTC16	Q8NEE8	873 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	CITED4	Q96RK1	184 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	HCN2	Q9UL51	889 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	POLI	Q9UNA4	740 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GINS3-208	ENST00000567432	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	XYLB	O75191	536 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	MAPK1	P28482	360 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	CTBS	Q01459	385 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	GAS6	Q14393	721 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	FAM182B	Q5T319	152 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	GJD3	Q8N144	294 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	IRF7	Q92985	503 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	ERBB4	Q15303	1308 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	EGFR	P00533	1210 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	MX2	P20592	715 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	EHHADH	Q08426	723 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	SPEM2	Q0P670	501 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	PDE3B	Q13370	1112 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	CCIN	Q13939	588 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	GRIN2C	Q14957	1233 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	C8orf34	Q49A92	452 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	TMC1	Q8TDI8	760 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	GSX2	Q9BZM3	304 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	C2CD2L	O14523	706 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	SASH3	O75995	380 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	WFS1	O76024	890 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	BMP4	P12644	408 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	NEUROD1	Q13562	356 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	XKR5	Q6UX68	686 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	TMC7	Q7Z402	723 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	NLRP13	Q86W25	1043 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	ASB16	Q96NS5	453 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	PNMA5	Q96PV4	448 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	FAM129B	Q96TA1	746 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	SLC30A3	Q99726	388 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	ELP3	Q9H9T3	547 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	EFCC1	Q9HA90	598 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	MBIP	Q9NS73	344 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432		A6NHS1	94 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	IGHA2	P01877	340 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	NFKB1	P19838	968 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	TREML4	Q6UXN2	200 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	BHMT	Q93088	406 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	IGF1R	P08069	1367 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GINS3-208	ENST00000567432	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		4.17	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms