RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF358	Q9NW07	568 aa		6.07	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		6.07	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	SERTM1	A2A2V5	107 aa		6.06	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		6.06	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	MSL1	Q68DK7	614 aa		6.06	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		6.05	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	POTEA	Q6S8J7	498 aa		6.05	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		6.05	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	SFI1	A8K8P3	1242 aa		6.04	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	6.04	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		6.04	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	GRIK5	Q16478	980 aa		6.03	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	IGFLR1	Q9H665	355 aa		6.03	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		6.03	□□□□□ -1.44
AKAP13-223	ENST00000560957	GSC2	O15499	205 aa		6.02	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	MED26	O95402	600 aa		6.02	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	GTF2I	P78347	998 aa		6.02	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	VAC14	Q08AM6	782 aa		6.02	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	PCSK7	Q16549	785 aa		6.02	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	EML3	Q32P44	896 aa		6.02	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		6.02	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		6.02	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	SUSD3	Q96L08	255 aa		6.02	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		6.02	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	NOD1	Q9Y239	953 aa		6.02	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	DLL1	O00548	723 aa		6.01	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	SOX11	P35716	441 aa		6.01	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	TNS4	Q8IZW8	715 aa		6.01	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		6.01	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		6.01	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		6	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		6	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		6	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC9	Q92623	222 aa		6	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		6	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	GSX2	Q9BZM3	304 aa		6	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	JAG1	P78504	1218 aa		5.99	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	PSME1	Q06323	249 aa		5.99	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957		Q6ZS46	218 aa		5.99	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM35A	Q86V20	835 aa		5.99	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		5.99	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	TGFB1	P01137	390 aa		5.98	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	IGLV1-40	P01703	118 aa		5.98	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	SPINK2	P20155	84 aa		5.98	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	SEMA3F	Q13275	785 aa		5.98	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	CCIN	Q13939	588 aa		5.98	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	HIF1A	Q16665	826 aa		5.98	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	WASHC4	Q2M389	1173 aa		5.98	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	IL27	Q8NEV9	243 aa		5.98	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	PNMA5	Q96PV4	448 aa		5.98	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		5.98	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957		F8W735	103 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	PIK3CD	O00329	1044 aa		5.97	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	MAP3K6	O95382	1288 aa		5.97	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	CPB1	P15086	417 aa		5.97	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	NFKB1	P19838	968 aa		5.97	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	PERM1	Q5SV97	790 aa		5.97	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	RAX	Q9Y2V3	346 aa		5.97	□□□□□ -1.45
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAMTS4	O75173	837 aa		5.96	□□□□□ -1.46
AKAP13-223	ENST00000560957	IER5	Q5VY09	327 aa		5.96	□□□□□ -1.46
AKAP13-223	ENST00000560957	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		5.96	□□□□□ -1.46
AKAP13-223	ENST00000560957	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
AKAP13-223	ENST00000560957	ALX3	O95076	343 aa		5.95	□□□□□ -1.46
AKAP13-223	ENST00000560957	PLAUR	Q03405	335 aa		5.95	□□□□□ -1.46
AKAP13-223	ENST00000560957	NEUROD2	Q15784	382 aa		5.95	□□□□□ -1.46
AKAP13-223	ENST00000560957	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		5.95	□□□□□ -1.46
AKAP13-223	ENST00000560957	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		5.95	□□□□□ -1.46
AKAP13-223	ENST00000560957	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		5.95	□□□□□ -1.46
AKAP13-223	ENST00000560957	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
AKAP13-223	ENST00000560957	GRIK1	P39086	918 aa		5.94	□□□□□ -1.46
AKAP13-223	ENST00000560957	NCOA4	Q13772	614 aa		5.94	□□□□□ -1.46
AKAP13-223	ENST00000560957	DTX1	Q86Y01	620 aa		5.94	□□□□□ -1.46
AKAP13-223	ENST00000560957	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		5.94	□□□□□ -1.46
AKAP13-223	ENST00000560957		M0R2N6	131 aa		5.93	□□□□□ -1.46
AKAP13-223	ENST00000560957	SKI	P12755	728 aa		5.93	□□□□□ -1.46
AKAP13-223	ENST00000560957	GPLD1	P80108	840 aa		5.93	□□□□□ -1.46
AKAP13-223	ENST00000560957	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		5.93	□□□□□ -1.46
AKAP13-223	ENST00000560957	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		5.93	□□□□□ -1.46
AKAP13-223	ENST00000560957	STOML1	Q9UBI4	398 aa		5.93	□□□□□ -1.46
AKAP13-223	ENST00000560957	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		5.93	□□□□□ -1.46
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		5.92	□□□□□ -1.46
AKAP13-223	ENST00000560957	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM50	Q86XT4	487 aa		5.92	□□□□□ -1.46
AKAP13-223	ENST00000560957	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		5.91	□□□□□ -1.46
AKAP13-223	ENST00000560957	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
AKAP13-223	ENST00000560957	WNT11	O96014	354 aa		5.91	□□□□□ -1.46

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