RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	IER5	Q5VY09	327 aa		7.51	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		7.51	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	SV2A	Q7L0J3	742 aa		7.51	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		7.51	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	EDEM1	Q92611	657 aa		7.51	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		7.51	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	BNIP3L	O60238	219 aa		7.5	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	FZD6	O60353	706 aa		7.5	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	INPP5B	P32019	993 aa		7.5	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		7.5	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		7.5	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	BRD7	Q9NPI1	651 aa		7.5	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	HCN2	Q9UL51	889 aa		7.5	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	ARSD	P51689	593 aa		7.49	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	TNP2	Q05952	138 aa		7.49	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	GRIN2C	Q14957	1233 aa		7.49	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		7.49	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	GMCL1	Q96IK5	515 aa		7.49	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	STRN4	Q9NRL3	753 aa		7.49	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		7.49	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		7.49	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	POLI	Q9UNA4	740 aa		7.49	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	MAPK1	P28482	360 aa		7.48	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC27	Q2M243	656 aa		7.48	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934		H3BM21	787 aa		7.47	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	EFS	O43281	561 aa		7.47	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	PDGFA	P04085	211 aa		7.47	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	FAM157B	P0CG42	384 aa		7.47	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		7.47	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		7.47	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		7.47	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		7.47	□□□□□ -1.21
LINS1-210	ENST00000560934		A6NHS1	94 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	CD33	P20138	364 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	CTBS	Q01459	385 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	MARK1	Q9P0L2	795 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	HMGXB3	Q12766	1538 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	NDUFB5	O43674	189 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	C8orf34	Q49A92	452 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	TMC1	Q8TDI8	760 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	PHF24	Q9UPV7	400 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	ERBB4	Q15303	1308 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	EPB42	P16452	691 aa		7.44	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	PCSK2	P16519	638 aa		7.44	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	FGFR3	P22607	806 aa		7.44	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	KCNQ4	P56696	695 aa		7.44	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		7.44	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		7.44	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		7.44	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		7.43	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	XYLB	O75191	536 aa		7.43	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	TTC16	Q8NEE8	873 aa		7.43	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	SLC30A3	Q99726	388 aa		7.43	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	C2CD2L	O14523	706 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	SASH3	O75995	380 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	LAMC2	Q13753	1193 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	GAS6	Q14393	721 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	TMC7	Q7Z402	723 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	GSX2	Q9BZM3	304 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	USP5	P45974	858 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	SPEM2	Q0P670	501 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	CCIN	Q13939	588 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	GJD3	Q8N144	294 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	BMP4	P12644	408 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	MX2	P20592	715 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22

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