RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 C8orf34Q49A92 452 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 TMC4Q7Z404 712 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 HSH2DQ96JZ2 352 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 CSRNP1Q96S65 589 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 DNAJC25Q9H1X3 360 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 PARP2Q9UGN5 583 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 SMARCA4P51532 1647 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 FAM187AA6NFU0 413 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 EPB42P16452 691 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 CTC1Q2NKJ3 1217 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 BTLAQ7Z6A9 289 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF280CQ8ND82 737 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 MSX1P28360 303 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 DAB2P98082 770 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 PSMD2Q13200 908 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 ZIC5Q96T25 663 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD3-208ENST00000560725 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
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TMOD3-208ENST00000560725 OPLAHO14841 1288 aa9.33□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 SORBS3O60504 671 aa9.33□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 INPP5BP32019 993 aa9.33□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 FRMD6Q96NE9 622 aa9.33□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 CRISPLD1Q9H336 500 aa9.33□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.33□□□□□ -0.92
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TMOD3-208ENST00000560725 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 GNA15P30679 374 aa9.32□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 XKR5Q6UX68 686 aa9.32□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.32□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 WWC3Q9ULE0 1092 aa9.32□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 GJA3Q9Y6H8 435 aa9.32□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 A0A1W2PNR3 127 aa9.31□□□□□ -0.92
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TMOD3-208ENST00000560725 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa9.31□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 KLRG1Q96E93 195 aa9.31□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 BACH2Q9BYV9 841 aa9.31□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 VTI1BQ9UEU0 232 aa9.31□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 DYRK1BQ9Y463 629 aa9.31□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 PEG3Q9GZU2 1588 aa9.3□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.3□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF438Q7Z4V0 828 aa9.3□□□□□ -0.92
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TMOD3-208ENST00000560725 C11orf16Q9NQ32 467 aa9.3□□□□□ -0.92
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TMOD3-208ENST00000560725 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
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TMOD3-208ENST00000560725 SETDB2Q96T68 719 aa9.29□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 SPG7Q9UQ90 795 aa9.29□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 A6NHS1 94 aa9.28□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 TNFRSF21O75509 655 aa9.28□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 DGAT1O75907 488 aa9.28□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP9.28□□□□□ -0.92
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TMOD3-208ENST00000560725 CRIPAKQ8N1N5 446 aa9.28□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 CFHR5Q9BXR6 569 aa9.28□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 KCNMB2Q9Y691 235 aa9.28□□□□□ -0.92
TMOD3-208ENST00000560725 FIGNL2A6NMB9 653 aa9.27□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 F11P03951 625 aa9.27□□□□□ -0.93
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TMOD3-208ENST00000560725 CEP63Q96MT8 703 aa9.27□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 GPAMQ9HCL2 828 aa9.27□□□□□ -0.93
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TMOD3-208ENST00000560725 NESP48681 1621 aa9.27□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 AXIN1O15169 862 aa9.26□□□□□ -0.93
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TMOD3-208ENST00000560725 PHACTR2O75167 634 aa9.26□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 EFHC2Q5JST6 749 aa9.26□□□□□ -0.93
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TMOD3-208ENST00000560725 RNF19AQ9NV58 838 aa9.25□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 DNMT3LQ9UJW3 386 aa9.25□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 USP20Q9Y2K6 914 aa9.25□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 MROH2BQ7Z745 1585 aa9.24□□□□□ -0.93
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