RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM227B-211ENST00000560557 ITGB5P18084 799 aa6.92□□□□□ -1.3
FAM227B-211ENST00000560557 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
FAM227B-211ENST00000560557 HMX2A2RU54 273 aa6.91□□□□□ -1.3
FAM227B-211ENST00000560557 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.91□□□□□ -1.3
FAM227B-211ENST00000560557 APBB1O00213 710 aa6.9□□□□□ -1.3
FAM227B-211ENST00000560557 MAP3K6O95382 1288 aa6.9□□□□□ -1.3
FAM227B-211ENST00000560557 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
FAM227B-211ENST00000560557 IL27Q8NEV9 243 aa6.9□□□□□ -1.3
FAM227B-211ENST00000560557 SHKBP1Q8TBC3 707 aa6.9□□□□□ -1.3
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