RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559573.3

FAM227B-208, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, human

TSL 3

Gene FAM227B, Length 2,204 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM227B-208	ENST00000559573	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		12.96	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		12.96	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		12.96	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		12.95	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		12.95	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	IGKV5-2	P06315	115 aa		12.95	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	TCIRG1	Q13488	830 aa		12.95	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		12.95	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		12.94	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	NTSR2	O95665	410 aa		12.94	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	COL4A1	P02462	1669 aa		12.94	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	ERBB4	Q15303	1308 aa		12.94	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		12.93	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		12.93	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	C21orf2	O43822	256 aa		12.92	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		12.92	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		12.92	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	ST5	P78524	1137 aa		12.92	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	KSR2	Q6VAB6	950 aa		12.92	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	SLX4	Q8IY92	1834 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573		H0YIN7	160 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	RASSF7	Q02833	373 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		12.9	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		12.9	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	ATP10D	Q9P241	1426 aa		12.9	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	SRGN	P10124	158 aa		12.9	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	PRELP	P51888	382 aa		12.9	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		12.9	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	PIM2	Q9P1W9	311 aa		12.9	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		12.9	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		12.9	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	PLIN1	O60240	522 aa		12.89	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	TGFB2	P61812	414 aa		12.89	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		12.89	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		12.89	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		12.89	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		12.88	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	PDE6B	P35913	854 aa		12.87	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		12.87	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	BEND3	Q5T5X7	828 aa		12.86	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	TTLL6	Q8N841	843 aa		12.86	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	LAMB2	P55268	1798 aa		12.86	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		12.86	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	NYX	Q9GZU5	481 aa		12.86	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	GCKR	Q14397	625 aa		12.85	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	PARP10	Q53GL7	1025 aa		12.85	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		12.85	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	NLRP3	Q96P20	1036 aa		12.85	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	NEFL	P07196	543 aa		12.84	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		12.84	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	MASTL	Q96GX5	879 aa		12.84	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	ABCC4	O15439	1325 aa		12.84	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		12.84	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	GREM2	Q9H772	168 aa		12.84	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		12.84	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		12.84	□□□□□ -0.35
FAM227B-208	ENST00000559573	SNAP23	O00161	211 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	NFKBIE	O00221	500 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	RLBP1	P12271	317 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	YY1	P25490	414 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	CRY2	Q49AN0	593 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	CACNA1F	O60840	1977 aa		12.83	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	TRIM27	P14373	513 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	NPR1	P16066	1061 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	LINS1	Q8NG48	757 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	CASP7	P55210	303 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM161A	Q3B820	660 aa		12.81	□□□□□ -0.36

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