RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 PXDNLA1KZ92 1463 aa11.94□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 UBN2Q6ZU65 1347 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 A0A0G2JLW4 131 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 DSG3P32926 999 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 NLRP10Q86W26 655 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 ISCA1Q9BUE6 129 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 PIM2Q9P1W9 311 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 NTSR2O95665 410 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 DPEP1P16444 411 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 G2E3Q7L622 706 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 C2CD5Q86YS7 1000 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 CCDC191Q8NCU4 936 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 MYD88Q99836 296 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 SH3TC1Q8TE82 1336 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 GRIN3BO60391 1043 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 KCNA3P22001 575 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 ERFEQ4G0M1 354 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 NUTM1Q86Y26 1132 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 CCDC24Q8N4L8 307 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 RIC1Q4ADV7 1423 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 ADCY9O60503 1353 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 PTPRCP08575 1304 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 CHRNA5P30532 468 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 SLC10A5Q5PT55 438 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 DNAAF4Q8WXU2 420 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 SSH1Q8WYL5 1049 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 MASTLQ96GX5 879 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 NLRP3Q96P20 1036 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 SMC4Q9NTJ3 1288 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CS-224ENST00000551155 SRGNP10124 158 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 NPR1P16066 1061 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 STYK1Q6J9G0 422 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 TTLL6Q8N841 843 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 LINS1Q8NG48 757 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 CNKSR1Q969H4 720 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 BCS1LQ9Y276 419 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 ALDH1B1P30837 517 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 RARSP54136 660 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 CACNA1SQ13698 1873 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 CHD4Q14839 1912 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 LAMB2P55268 1798 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 NEURL1BA8MQ27 555 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 IGKV5-2P06315 115 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP11.87□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 CRY2Q49AN0 593 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 FAM89AQ96GI7 184 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 BCL2L13Q9BXK5 485 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 ABCC12Q96J65 1359 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 KIF16BQ96L93 1317 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 F6X3S4 739 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 SLC4A10Q6U841 1118 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 WWC3Q9ULE0 1092 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 ALDH1L1O75891 902 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 GCKRQ14397 625 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 BEND3Q5T5X7 828 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 SOGA3Q5TF21 947 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 SYNE4Q8N205 404 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 ARHGAP45Q92619 1136 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 MYH3P11055 1940 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 CDHR2Q9BYE9 1310 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 PDE8AO60658 829 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 CRAMP1Q96RY5 1269 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 SLX4Q8IY92 1834 aa11.83□□□□□ -0.51
CS-224ENST00000551155 H7C1W4 665 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-224ENST00000551155 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-224ENST00000551155 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-224ENST00000551155 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-224ENST00000551155 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-224ENST00000551155 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms