RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-223ENST00000551137 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.9□□□□□ -0.02
CS-223ENST00000551137 WWC1Q8IX03 1113 aa14.9□□□□□ -0.02
CS-223ENST00000551137 PLBD2Q8NHP8 589 aa14.9□□□□□ -0.02
CS-223ENST00000551137 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CS-223ENST00000551137 TAOK3Q9H2K8 898 aa14.9□□□□□ -0.02
CS-223ENST00000551137 NMRK2Q9NPI5 230 aa14.9□□□□□ -0.02
CS-223ENST00000551137 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CS-223ENST00000551137 IL16Q14005 1332 aa14.9□□□□□ -0.02
CS-223ENST00000551137 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 GLTPD2A6NH11 291 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 CCDC93Q567U6 631 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 NLRP10Q86W26 655 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 RTKN2Q8IZC4 609 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 GRIPAP1Q4V328 841 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 C8orf58Q8NAV2 365 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 SNED1Q8TER0 1413 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 NLRP3Q96P20 1036 aa14.87□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 ISCA1Q9BUE6 129 aa14.87□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.86□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 PSMD1Q99460 953 aa14.86□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 CACNA1SQ13698 1873 aa14.86□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 HSPA6P17066 643 aa14.85□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 CCDC30Q5VVM6 783 aa14.85□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.85□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.85□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 WDR63Q8IWG1 891 aa14.85□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 SH3TC1Q8TE82 1336 aa14.85□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 TIAM2Q8IVF5 1701 aa14.84□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 RRAGCQ9HB90 399 aa14.84□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CS-223ENST00000551137 FSTL1Q12841 308 aa14.83□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 OLFM4Q6UX06 510 aa14.83□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 TSPYL6Q8N831 410 aa14.83□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 POTECB2RU33 542 aa14.82□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 BBOX1O75936 387 aa14.82□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 SYNE4Q8N205 404 aa14.82□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 WDR90Q96KV7 1748 aa14.82□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 GOLGA2Q08379 1002 aa14.81□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 RIC3Q7Z5B4 369 aa14.81□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa14.81□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 FZD9O00144 591 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 DDX58O95786 925 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 IARSP41252 1262 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 CCDC191Q8NCU4 936 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 VPS33BQ9H267 617 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 ABCC4O15439 1325 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 LAMB2P55268 1798 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 TMC4Q7Z404 712 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 SP8Q8IXZ3 490 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 APLP1P51693 650 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 KSR2Q6VAB6 950 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 SMC1BQ8NDV3 1235 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 FAM89AQ96GI7 184 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 STK31Q9BXU1 1019 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 CACNA1FO60840 1977 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-223ENST00000551137 DDNO94850 711 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CS-223ENST00000551137 GRAPQ13588 217 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-223ENST00000551137 FAM9BQ8IZU0 186 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-223ENST00000551137 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CS-223ENST00000551137 JDP2Q8WYK2 163 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-223ENST00000551137 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CS-223ENST00000551137 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CS-223ENST00000551137 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CS-223ENST00000551137 VAMP4O75379 141 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-223ENST00000551137 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CS-223ENST00000551137 MYD88Q99836 296 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-223ENST00000551137 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-223ENST00000551137 SCN4AP35499 1836 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-223ENST00000551137 ZNF521Q96K83 1311 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-223ENST00000551137 PI4KAP2A4QPH2 592 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-223ENST00000551137 IQCA1LA6NCM1 817 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms