RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 RNF181Q9P0P0 153 aa27■■□□□ 1.91
CS-222ENST00000550996 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.99■■□□□ 1.91
CS-222ENST00000550996 SYNE4Q8N205 404 aa26.99■■□□□ 1.91
CS-222ENST00000550996 ZNF428Q96B54 188 aa26.99■■□□□ 1.91
CS-222ENST00000550996 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
CS-222ENST00000550996 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.97■■□□□ 1.91
CS-222ENST00000550996 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.96■■□□□ 1.91
CS-222ENST00000550996 OLFM4Q6UX06 510 aa26.96■■□□□ 1.91
CS-222ENST00000550996 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.96■■□□□ 1.91
CS-222ENST00000550996 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
CS-222ENST00000550996 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.95■■□□□ 1.9
CS-222ENST00000550996 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.95■■□□□ 1.9
CS-222ENST00000550996 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
CS-222ENST00000550996 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
CS-222ENST00000550996 SLC10A5Q5PT55 438 aa26.95■■□□□ 1.9
CS-222ENST00000550996 SBF1O95248 1867 aa26.94■■□□□ 1.9
CS-222ENST00000550996 LMNB1P20700 586 aa26.94■■□□□ 1.9
CS-222ENST00000550996 ZNF521Q96K83 1311 aa26.93■■□□□ 1.9
CS-222ENST00000550996 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
CS-222ENST00000550996 SLC51AQ86UW1 340 aa26.93■■□□□ 1.9
CS-222ENST00000550996 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
CS-222ENST00000550996 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.92■■□□□ 1.9
CS-222ENST00000550996 CACNA1SQ13698 1873 aa26.92■■□□□ 1.9
CS-222ENST00000550996 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
CS-222ENST00000550996 GOLGA2Q08379 1002 aa26.91■■□□□ 1.9
CS-222ENST00000550996 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa26.91■■□□□ 1.9
CS-222ENST00000550996 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.9■■□□□ 1.9
CS-222ENST00000550996 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
CS-222ENST00000550996 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.9■■□□□ 1.9
CS-222ENST00000550996 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
CS-222ENST00000550996 SNED1Q8TER0 1413 aa26.9■■□□□ 1.9
CS-222ENST00000550996 SH3TC1Q8TE82 1336 aa26.9■■□□□ 1.9
CS-222ENST00000550996 ALDH1B1P30837 517 aa26.89■■□□□ 1.9
CS-222ENST00000550996 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
CS-222ENST00000550996 G2E3Q7L622 706 aa26.89■■□□□ 1.9
CS-222ENST00000550996 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.89■■□□□ 1.9
CS-222ENST00000550996 CCER2I3L3R5 266 aa26.88■■□□□ 1.89
CS-222ENST00000550996 KIF3CO14782 793 aa26.88■■□□□ 1.89
CS-222ENST00000550996 VAMP4O75379 141 aa26.88■■□□□ 1.89
CS-222ENST00000550996 CCDC93Q567U6 631 aa26.88■■□□□ 1.89
CS-222ENST00000550996 SOGA3Q5TF21 947 aa26.88■■□□□ 1.89
CS-222ENST00000550996 NLRP3Q96P20 1036 aa26.88■■□□□ 1.89
CS-222ENST00000550996 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.88■■□□□ 1.89
CS-222ENST00000550996 C1QTNF8P60827 252 aa26.87■■□□□ 1.89
CS-222ENST00000550996 FAM89AQ96GI7 184 aa26.87■■□□□ 1.89
CS-222ENST00000550996 CRAMP1Q96RY5 1269 aa26.87■■□□□ 1.89
CS-222ENST00000550996 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.87■■□□□ 1.89
CS-222ENST00000550996 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
CS-222ENST00000550996 MYD88Q99836 296 aa26.86■■□□□ 1.89
CS-222ENST00000550996 STK31Q9BXU1 1019 aa26.86■■□□□ 1.89
CS-222ENST00000550996 SLC4A2P04920 1241 aa26.85■■□□□ 1.89
CS-222ENST00000550996 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
CS-222ENST00000550996 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CS-222ENST00000550996 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CS-222ENST00000550996 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.84■■□□□ 1.89
CS-222ENST00000550996 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.84■■□□□ 1.89
CS-222ENST00000550996 ABCC4O15439 1325 aa26.84■■□□□ 1.89
CS-222ENST00000550996 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.83■■□□□ 1.89
CS-222ENST00000550996 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP26.83■■□□□ 1.89
CS-222ENST00000550996 KSR2Q6VAB6 950 aa26.83■■□□□ 1.89
CS-222ENST00000550996 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.83■■□□□ 1.89
CS-222ENST00000550996 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
CS-222ENST00000550996 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
CS-222ENST00000550996 TIAM2Q8IVF5 1701 aa26.82■■□□□ 1.88
CS-222ENST00000550996 LAMB2P55268 1798 aa26.81■■□□□ 1.88
CS-222ENST00000550996 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
CS-222ENST00000550996 RTKN2Q8IZC4 609 aa26.81■■□□□ 1.88
CS-222ENST00000550996 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
CS-222ENST00000550996 IGKV5-2P06315 115 aa26.8■■□□□ 1.88
CS-222ENST00000550996 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.8■■□□□ 1.88
CS-222ENST00000550996 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa26.8■■□□□ 1.88
CS-222ENST00000550996 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
CS-222ENST00000550996 FLIIQ13045 1269 aa26.79■■□□□ 1.88
CS-222ENST00000550996 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
CS-222ENST00000550996 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
CS-222ENST00000550996 GLTPD2A6NH11 291 aa26.78■■□□□ 1.88
CS-222ENST00000550996 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
CS-222ENST00000550996 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.78■■□□□ 1.88
CS-222ENST00000550996 COL4A1P02462 1669 aa26.77■■□□□ 1.88
CS-222ENST00000550996 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CS-222ENST00000550996 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa26.77■■□□□ 1.88
CS-222ENST00000550996 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
CS-222ENST00000550996 PSMD1Q99460 953 aa26.76■■□□□ 1.87
CS-222ENST00000550996 RRAGCQ9HB90 399 aa26.76■■□□□ 1.87
CS-222ENST00000550996 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.76■■□□□ 1.87
CS-222ENST00000550996 GRAPQ13588 217 aa26.75■■□□□ 1.87
CS-222ENST00000550996 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
CS-222ENST00000550996 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
CS-222ENST00000550996 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
CS-222ENST00000550996 MIER1Q8N108 512 aa26.75■■□□□ 1.87
CS-222ENST00000550996 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
CS-222ENST00000550996 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
CS-222ENST00000550996 COL4A5P29400 1685 aa26.74■■□□□ 1.87
CS-222ENST00000550996 CEP350Q5VT06 3117 aa26.74■■□□□ 1.87
CS-222ENST00000550996 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.73■■□□□ 1.87
CS-222ENST00000550996 BBOX1O75936 387 aa26.73■■□□□ 1.87
CS-222ENST00000550996 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CS-222ENST00000550996 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
CS-222ENST00000550996 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.73■■□□□ 1.87
CS-222ENST00000550996 E9PSI1 815 aa26.72■■□□□ 1.87
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