RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 FSD2A1L4K1 749 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 NEURL1BA8MQ27 555 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 CDC45O75419 566 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 ADAMTS2O95450 1211 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 IGKV5-2P06315 115 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 MTX1Q13505 466 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 C22orf23Q9BZE7 217 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 SALL3Q9BXA9 1300 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 NWD2Q9ULI1 1742 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 ITGB4P16144 1822 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 EXOC5O00471 708 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 SURF6O75683 361 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 PDE1AP54750 535 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 MYD88Q99836 296 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 NBPF26B4DH59 902 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 GCKRQ14397 625 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 NBPF14Q5TI25 921 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 NBPF15Q8N660 670 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 PLBD2Q8NHP8 589 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 PIGBQ92521 554 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 SUCLG2Q96I99 432 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 NUP188Q5SRE5 1749 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 ESPNB1AK53 854 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 SDSP20132 328 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 MX1P20591 662 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 SLC20A2Q08357 652 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 BECN1Q14457 450 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 RHPN1Q8TCX5 695 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 KIF1BPQ96EK5 621 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 KAZALD1Q96I82 304 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 STAP2Q9UGK3 403 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 SLIT2O94813 1529 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 BCL9O00512 1426 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 AOX1Q06278 1338 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 A1BGP04217 495 aa9.46□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 SLC4A3P48751 1232 aa9.46□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 RBM25P49756 843 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 ATG3Q9NT62 314 aa9.46□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 ASAP1Q9ULH1 1129 aa9.46□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 COL15A1P39059 1388 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 CASC1Q6TDU7 716 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 DOT1LQ8TEK3 1739 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 TSHZ3Q63HK5 1081 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 TTLL7Q6ZT98 887 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 ERC1Q8IUD2 1116 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 STARD3NLO95772 234 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 DDB1Q16531 1140 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 BARGINQ6ZT62 677 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 DNAJC10Q8IXB1 793 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 JCADQ9P266 1359 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 A0A087WZG4 1122 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 CASP7P55210 303 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 NUTM1Q86Y26 1132 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 PLCD3Q8N3E9 789 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 TJP1Q07157 1748 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP9.42□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 MRE11P49959 708 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-204ENST00000546621 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP9.42□□□□□ -0.97e-8■■■□□ 15.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms