RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543823.1

SYTL1-208, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYTL1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-208ENST00000543823 SGSM2O43147 1006 aa22.57■■□□□ 1.2
SYTL1-208ENST00000543823 PKP1Q13835 747 aa22.57■■□□□ 1.2
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SYTL1-208ENST00000543823 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
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SYTL1-208ENST00000543823 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
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SYTL1-208ENST00000543823 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.55■■□□□ 1.2
SYTL1-208ENST00000543823 H7C1W4 665 aa22.55■■□□□ 1.2
SYTL1-208ENST00000543823 MCCP23508 829 aa22.55■■□□□ 1.2
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SYTL1-208ENST00000543823 GPATCH3Q96I76 525 aa22.53■■□□□ 1.2
SYTL1-208ENST00000543823 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.53■■□□□ 1.2
SYTL1-208ENST00000543823 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SYTL1-208ENST00000543823 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.53■■□□□ 1.2
SYTL1-208ENST00000543823 TRAK2O60296 914 aa22.52■■□□□ 1.2
SYTL1-208ENST00000543823 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.52■■□□□ 1.2
SYTL1-208ENST00000543823 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.52■■□□□ 1.2
SYTL1-208ENST00000543823 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SYTL1-208ENST00000543823 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.52■■□□□ 1.2
SYTL1-208ENST00000543823 RAD50Q92878 1312 aa22.52■■□□□ 1.2
SYTL1-208ENST00000543823 COL15A1P39059 1388 aa22.52■■□□□ 1.2
SYTL1-208ENST00000543823 TOM1O60784 492 aa22.51■■□□□ 1.19
SYTL1-208ENST00000543823 HSPA4P34932 840 aa22.51■■□□□ 1.19
SYTL1-208ENST00000543823 TFCP2Q12800 502 aa22.51■■□□□ 1.19
SYTL1-208ENST00000543823 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.51■■□□□ 1.19
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SYTL1-208ENST00000543823 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.51■■□□□ 1.19
SYTL1-208ENST00000543823 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.51■■□□□ 1.19
SYTL1-208ENST00000543823 SLIT2O94813 1529 aa22.51■■□□□ 1.19
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SYTL1-208ENST00000543823 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.51■■□□□ 1.19
SYTL1-208ENST00000543823 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
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SYTL1-208ENST00000543823 DDB1Q16531 1140 aa22.5■■□□□ 1.19
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SYTL1-208ENST00000543823 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.49■■□□□ 1.19
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SYTL1-208ENST00000543823 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.48■■□□□ 1.19
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SYTL1-208ENST00000543823 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
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SYTL1-208ENST00000543823 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SYTL1-208ENST00000543823 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.42■■□□□ 1.18
SYTL1-208ENST00000543823 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.41■■□□□ 1.18
SYTL1-208ENST00000543823 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.41■■□□□ 1.18
SYTL1-208ENST00000543823 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SYTL1-208ENST00000543823 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SYTL1-208ENST00000543823 BARGINQ6ZT62 677 aa22.41■■□□□ 1.18
SYTL1-208ENST00000543823 DTNBO60941 627 aa22.4■■□□□ 1.18
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