RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531920.6

MED17-208, Transcript of mediator complex subunit 17, human

TSL 3

Gene MED17, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED17-208	ENST00000531920	PLCB3	Q01970	1234 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MED17-208	ENST00000531920	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MED17-208	ENST00000531920	CD163	Q86VB7	1156 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MED17-208	ENST00000531920	NGLY1	Q96IV0	654 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MED17-208	ENST00000531920	FAM161B	Q96MY7	647 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MED17-208	ENST00000531920	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
MED17-208	ENST00000531920	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MED17-208	ENST00000531920	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
MED17-208	ENST00000531920	STIM2	Q9P246	746 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MED17-208	ENST00000531920	TNFRSF10B	O14763	440 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	7.02	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	USP3	Q9Y6I4	520 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	MEN1	O00255	615 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	RHOQ	P17081	205 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	MX2	P20592	715 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	MTFR1	Q15390	333 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	FAM26D	Q5JW98	314 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	ATCAY	Q86WG3	371 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	C8orf37	Q96NL8	207 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	RNF19A	Q9NV58	838 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	PARP2	Q9UGN5	583 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	ZBTB39	O15060	712 aa		7	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	IL2RA	P01589	272 aa		7	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	EHHADH	Q08426	723 aa		7	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	DSC3	Q14574	896 aa		7	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	TLR1	Q15399	786 aa		7	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		7	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	NLRP3	Q96P20	1036 aa		7	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	CITED4	Q96RK1	184 aa		7	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		7	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		7	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	GPR182	O15218	404 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	ABTB2	Q8N961	1025 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	CNKSR1	Q969H4	720 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	XAGE2	Q96GT9	111 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	DRC1	Q96MC2	740 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	SETDB2	Q96T68	719 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920		H7C1W4	665 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	IGHA2	P01877	340 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	MYO19	Q96H55	970 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	FAM129B	Q96TA1	746 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	MRS2	Q9HD23	443 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	POLI	Q9UNA4	740 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	CDK2AP1	O14519	115 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	CHRNA4	P43681	627 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	MAP2K3	P46734	347 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	PDE3B	Q13370	1112 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	CABP1	Q9NZU7	370 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MED17-208	ENST00000531920	SERTM1	A2A2V5	107 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MED17-208	ENST00000531920	EML1	O00423	815 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MED17-208	ENST00000531920	NOS2	P35228	1153 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MED17-208	ENST00000531920	ATP2B2	Q01814	1243 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MED17-208	ENST00000531920	DGKZ	Q13574	1117 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MED17-208	ENST00000531920	GRIN2C	Q14957	1233 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MED17-208	ENST00000531920	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MED17-208	ENST00000531920	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MED17-208	ENST00000531920	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MED17-208	ENST00000531920	EDEM1	Q92611	657 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MED17-208	ENST00000531920	KLRG1	Q96E93	195 aa		6.96	□□□□□ -1.3

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