RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
FAM49B-222	ENST00000522702	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
FAM49B-222	ENST00000522702	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
FAM49B-222	ENST00000522702	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
FAM49B-222	ENST00000522702	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		7.05	□□□□□ -1.28
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A0A0MRY4	1105 aa		7.04	□□□□□ -1.28
FAM49B-222	ENST00000522702	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
FAM49B-222	ENST00000522702	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		7.04	□□□□□ -1.28
FAM49B-222	ENST00000522702	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		7.04	□□□□□ -1.28
FAM49B-222	ENST00000522702	HIF1A	Q16665	826 aa		7.04	□□□□□ -1.28
FAM49B-222	ENST00000522702	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		7.04	□□□□□ -1.28
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		7.04	□□□□□ -1.28
FAM49B-222	ENST00000522702	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
FAM49B-222	ENST00000522702	ARID3A	Q99856	593 aa		7.04	□□□□□ -1.28
FAM49B-222	ENST00000522702	EFCC1	Q9HA90	598 aa		7.04	□□□□□ -1.28
FAM49B-222	ENST00000522702	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
FAM49B-222	ENST00000522702		M0R2N6	131 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FAM49B-222	ENST00000522702	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
FAM49B-222	ENST00000522702	TYRO3	Q06418	890 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FAM49B-222	ENST00000522702	ADGRE1	Q14246	886 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FAM49B-222	ENST00000522702	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FAM49B-222	ENST00000522702	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FAM49B-222	ENST00000522702	NUDT8	Q8WV74	236 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FAM49B-222	ENST00000522702	SELP	P16109	830 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	CLDN10	P78369	228 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	MBTPS1	Q14703	1052 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	OGFOD1	Q8N543	542 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	PNMA5	Q96PV4	448 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	USP17L3	A6NCW0	530 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	USP17L4	A6NCW7	530 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	POTEA	Q6S8J7	498 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	USP21	Q9UK80	565 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		7.01	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		7	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	POM121C	A8CG34	1229 aa		7	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		7	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	TP53INP1	Q96A56	240 aa		7	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	ATP9B	O43861	1147 aa		6.99	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	PCSK7	Q16549	785 aa		6.99	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		6.99	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		6.99	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		6.99	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	NGLY1	Q96IV0	654 aa		6.99	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	GSX2	Q9BZM3	304 aa		6.99	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		6.98	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	CCIN	Q13939	588 aa		6.98	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	LRP8	Q14114	963 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	SIX5	Q8N196	739 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FAM49B-222	ENST00000522702	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
FAM49B-222	ENST00000522702	C21orf2	O43822	256 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM35A	Q86V20	835 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FAM49B-222	ENST00000522702	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FAM49B-222	ENST00000522702	GLMN	Q92990	594 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FAM49B-222	ENST00000522702	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FAM49B-222	ENST00000522702	EPB42	P16452	691 aa		6.95	□□□□□ -1.3
FAM49B-222	ENST00000522702	NFKB1	P19838	968 aa		6.95	□□□□□ -1.3
FAM49B-222	ENST00000522702	RASA1	P20936	1047 aa		6.95	□□□□□ -1.3
FAM49B-222	ENST00000522702	SEC13	P55735	322 aa		6.95	□□□□□ -1.3
FAM49B-222	ENST00000522702	HINFP	Q9BQA5	517 aa		6.95	□□□□□ -1.3
FAM49B-222	ENST00000522702	RTN1	Q16799	776 aa		6.94	□□□□□ -1.3
FAM49B-222	ENST00000522702	IER5	Q5VY09	327 aa		6.94	□□□□□ -1.3
FAM49B-222	ENST00000522702	MSL1	Q68DK7	614 aa		6.94	□□□□□ -1.3
FAM49B-222	ENST00000522702	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		6.94	□□□□□ -1.3
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
FAM49B-222	ENST00000522702	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		6.93	□□□□□ -1.3
FAM49B-222	ENST00000522702	CPB1	P15086	417 aa		6.93	□□□□□ -1.3
FAM49B-222	ENST00000522702	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		6.93	□□□□□ -1.3
FAM49B-222	ENST00000522702	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
FAM49B-222	ENST00000522702	FBXO11	Q86XK2	927 aa		6.93	□□□□□ -1.3
FAM49B-222	ENST00000522702	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		6.93	□□□□□ -1.3
FAM49B-222	ENST00000522702	UCN2	Q96RP3	112 aa		6.93	□□□□□ -1.3
FAM49B-222	ENST00000522702	DKK1	O94907	266 aa		6.92	□□□□□ -1.3
FAM49B-222	ENST00000522702	MAP3K6	O95382	1288 aa		6.92	□□□□□ -1.3
FAM49B-222	ENST00000522702	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
FAM49B-222	ENST00000522702	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		6.92	□□□□□ -1.3
FAM49B-222	ENST00000522702	ILDR2	Q71H61	639 aa		6.92	□□□□□ -1.3

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