RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517309.5

PTDSS1-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS1, Length 5,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-202ENST00000517309 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-202ENST00000517309 USP16Q9Y5T5 823 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A1W2PP64 1363 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-202ENST00000517309 CCDC181Q5TID7 509 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-202ENST00000517309 HSPA2P54652 639 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-202ENST00000517309 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-202ENST00000517309 CCDC82Q8N4S0 544 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-202ENST00000517309 TSG101Q99816 390 aa20.26■□□□□ 0.83
PTDSS1-202ENST00000517309 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
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PTDSS1-202ENST00000517309 POTEJP0CG39 1038 aa20.24■□□□□ 0.83
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PTDSS1-202ENST00000517309 CCT2P78371 535 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
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PTDSS1-202ENST00000517309 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1-202ENST00000517309 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1-202ENST00000517309 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.833e-6■■□□□ 12.3
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PTDSS1-202ENST00000517309 IQCEQ6IPM2 695 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1-202ENST00000517309 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1-202ENST00000517309 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1-202ENST00000517309 PDE1AP54750 535 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-202ENST00000517309 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-202ENST00000517309 FKBP15Q5T1M5 1219 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-202ENST00000517309 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-202ENST00000517309 GUCY1B3Q02153 619 aa20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1-202ENST00000517309 LMTK3Q96Q04 1460 aa20.22■□□□□ 0.83
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PTDSS1-202ENST00000517309 ADGRL2O95490 1459 aa20.21■□□□□ 0.83
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PTDSS1-202ENST00000517309 TTC41PQ6P2S7 1318 aa20.2■□□□□ 0.82
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PTDSS1-202ENST00000517309 ERLIN1O75477 346 aa20.18■□□□□ 0.82
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PTDSS1-202ENST00000517309 TAF4BQ92750 862 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS1-202ENST00000517309 HOXB7P09629 217 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS1-202ENST00000517309 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
PTDSS1-202ENST00000517309 KIAA1328Q86T90 577 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS1-202ENST00000517309 BMP15O95972 392 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS1-202ENST00000517309 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.17■□□□□ 0.82
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PTDSS1-202ENST00000517309 GNAT2P19087 354 aa20.17■□□□□ 0.82
PTDSS1-202ENST00000517309 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.17■□□□□ 0.82
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