RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512131.5

SH3BP2-223, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-223ENST00000512131 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-223ENST00000512131 NUP98P52948 1817 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-223ENST00000512131 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-223ENST00000512131 VAMP4O75379 141 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-223ENST00000512131 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-223ENST00000512131 TNS4Q8IZW8 715 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-223ENST00000512131 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 E9PSI1 815 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 SLFN5Q08AF3 891 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 CNBD1Q8NA66 436 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 CAPN15O75808 1086 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 STYK1Q6J9G0 422 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 CNKSR1Q969H4 720 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 SRGNP10124 158 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 TCIRG1Q13488 830 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 NPHP1O15259 732 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 GPTP24298 496 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 ST5P78524 1137 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 STK31Q9BXU1 1019 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-223ENST00000512131 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 PARP10Q53GL7 1025 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 CHADLQ6NUI6 762 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 MASTLQ96GX5 879 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 POTEIP0CG38 1075 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 POTEJP0CG39 1038 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 SOGA3Q5TF21 947 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 SUSD4Q5VX71 490 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 SLC4A2P04920 1241 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 NYXQ9GZU5 481 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 CREBZFQ9NS37 354 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 NTSR2O95665 410 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 G2E3Q7L622 706 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 NLRP10Q86W26 655 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 SLX4Q8IY92 1834 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 CACNA1FO60840 1977 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 FAM177BA6PVY3 158 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-223ENST00000512131 KSR2Q6VAB6 950 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-223ENST00000512131 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-223ENST00000512131 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-223ENST00000512131 ABCC12Q96J65 1359 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-223ENST00000512131 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-223ENST00000512131 FLIIQ13045 1269 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-223ENST00000512131 CCDC93Q567U6 631 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-223ENST00000512131 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-223ENST00000512131 ZNF428Q96B54 188 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-223ENST00000512131 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-223ENST00000512131 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-223ENST00000512131 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-223ENST00000512131 NPR1P16066 1061 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-223ENST00000512131 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-223ENST00000512131 LDHDQ86WU2 507 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-223ENST00000512131 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-223ENST00000512131 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-223ENST00000512131 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-223ENST00000512131 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-223ENST00000512131 CRY2Q49AN0 593 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-223ENST00000512131 PASKQ96RG2 1323 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-223ENST00000512131 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-223ENST00000512131 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.132e-6■■■■□ 20.1
SH3BP2-223ENST00000512131 MYD88Q99836 296 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-223ENST00000512131 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-223ENST00000512131 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-223ENST00000512131 CNTNAP1P78357 1384 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-223ENST00000512131 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-223ENST00000512131 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-223ENST00000512131 OLFM4Q6UX06 510 aa22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms