RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 NYXQ9GZU5 481 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 SLX4Q8IY92 1834 aa14.68□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 POTEIP0CG38 1075 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 POTEJP0CG39 1038 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 GOLGA2Q08379 1002 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 CHADLQ6NUI6 762 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 RTKN2Q8IZC4 609 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 ABCC12Q96J65 1359 aa14.67□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa14.66□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF521Q96K83 1311 aa14.66□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 IQCA1LA6NCM1 817 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 SYNE4Q8N205 404 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 LAMB4A4D0S4 1761 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 IL16Q14005 1332 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 UBN2Q6ZU65 1347 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.65□□□□□ -0.06
UBE2B-208ENST00000511807 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 IARSP41252 1262 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 CRY2Q49AN0 593 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 SUSD4Q5VX71 490 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 KDM3BQ7LBC6 1761 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 ERBB4Q15303 1308 aa14.64□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 E9PSI1 815 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 CACNA1SQ13698 1873 aa14.63□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 GNAI1P63096 354 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 LDHDQ86WU2 507 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF34Q8IZ26 560 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 JDP2Q8WYK2 163 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 NTSR2O95665 410 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 ANXA1P04083 346 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 NECTIN2Q92692 538 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 CFAP44Q96MT7 982 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 PSMD1Q99460 953 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 CREBZFQ9NS37 354 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 IFT57Q9NWB7 429 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 BABAM1Q9NWV8 329 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 HACL1Q9UJ83 578 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 FZD9O00144 591 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 EPHX2P34913 555 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 SLFN5Q08AF3 891 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 PDIA6Q15084 440 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 PROSER3Q2NL68 480 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 PARP10Q53GL7 1025 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 RNF123Q5XPI4 1314 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 SLC51AQ86UW1 340 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 NLRP3Q96P20 1036 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 RNF39Q9H2S5 420 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 GJA3Q9Y6H8 435 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 RIC1Q4ADV7 1423 aa14.58□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 SNED1Q8TER0 1413 aa14.58□□□□□ -0.07
UBE2B-208ENST00000511807 CHL1O00533 1208 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF853P0CG23 659 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 EIF6P56537 245 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 TNS4Q8IZW8 715 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 GPC2Q8N158 579 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 LARGE2Q8N3Y3 721 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 CDCA7LQ96GN5 454 aa14.58□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 GRIPAP1Q4V328 841 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 COPS6Q7L5N1 327 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 PASKQ96RG2 1323 aa14.57□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 KRT24Q2M2I5 525 aa14.56□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms