RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494971.2

USP20-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 3

Gene USP20, Length 503 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-208ENST00000494971 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.05■■□□□ 1.12
USP20-208ENST00000494971 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.05■■□□□ 1.12
USP20-208ENST00000494971 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
USP20-208ENST00000494971 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.04■■□□□ 1.12
USP20-208ENST00000494971 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.04■■□□□ 1.12
USP20-208ENST00000494971 LMNB1P20700 586 aa22.03■■□□□ 1.12
USP20-208ENST00000494971 ALDH1B1P30837 517 aa22.03■■□□□ 1.12
USP20-208ENST00000494971 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
USP20-208ENST00000494971 PRELPP51888 382 aa22.03■■□□□ 1.12
USP20-208ENST00000494971 SOGA3Q5TF21 947 aa22.03■■□□□ 1.12
USP20-208ENST00000494971 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.03■■□□□ 1.12
USP20-208ENST00000494971 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
USP20-208ENST00000494971 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
USP20-208ENST00000494971 RNF181Q9P0P0 153 aa22.03■■□□□ 1.12
USP20-208ENST00000494971 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
USP20-208ENST00000494971 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
USP20-208ENST00000494971 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.02■■□□□ 1.12
USP20-208ENST00000494971 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
USP20-208ENST00000494971 CCER2I3L3R5 266 aa22.01■■□□□ 1.11
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USP20-208ENST00000494971 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22■■□□□ 1.11
USP20-208ENST00000494971 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
USP20-208ENST00000494971 NLRP3Q96P20 1036 aa22■■□□□ 1.11
USP20-208ENST00000494971 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
USP20-208ENST00000494971 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22■■□□□ 1.11
USP20-208ENST00000494971 ZNF521Q96K83 1311 aa22■■□□□ 1.11
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USP20-208ENST00000494971 CCDC93Q567U6 631 aa21.98■■□□□ 1.11
USP20-208ENST00000494971 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.98■■□□□ 1.11
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USP20-208ENST00000494971 CRAMP1Q96RY5 1269 aa21.98■■□□□ 1.11
USP20-208ENST00000494971 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.98■■□□□ 1.11
USP20-208ENST00000494971 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
USP20-208ENST00000494971 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.97■■□□□ 1.11
USP20-208ENST00000494971 SYNE4Q8N205 404 aa21.97■■□□□ 1.11
USP20-208ENST00000494971 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
USP20-208ENST00000494971 STK31Q9BXU1 1019 aa21.97■■□□□ 1.11
USP20-208ENST00000494971 LAMB2P55268 1798 aa21.97■■□□□ 1.11
USP20-208ENST00000494971 SNED1Q8TER0 1413 aa21.97■■□□□ 1.11
USP20-208ENST00000494971 VAMP4O75379 141 aa21.96■■□□□ 1.11
USP20-208ENST00000494971 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
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USP20-208ENST00000494971 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.96■■□□□ 1.11
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USP20-208ENST00000494971 CACNA1FO60840 1977 aa21.95■■□□□ 1.1
USP20-208ENST00000494971 KIF3CO14782 793 aa21.94■■□□□ 1.1
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USP20-208ENST00000494971 RTKN2Q8IZC4 609 aa21.94■■□□□ 1.1
USP20-208ENST00000494971 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
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USP20-208ENST00000494971 SLC4A2P04920 1241 aa21.92■■□□□ 1.1
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USP20-208ENST00000494971 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.92■■□□□ 1.1
USP20-208ENST00000494971 ABCC4O15439 1325 aa21.91■■□□□ 1.1
USP20-208ENST00000494971 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.91■■□□□ 1.1
USP20-208ENST00000494971 PI4KAP2A4QPH2 592 aa21.91■■□□□ 1.1
USP20-208ENST00000494971 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.91■■□□□ 1.1
USP20-208ENST00000494971 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa21.91■■□□□ 1.1
USP20-208ENST00000494971 ZNF428Q96B54 188 aa21.91■■□□□ 1.1
USP20-208ENST00000494971 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
USP20-208ENST00000494971 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
USP20-208ENST00000494971 PSMD1Q99460 953 aa21.9■■□□□ 1.1
USP20-208ENST00000494971 NMRK2Q9NPI5 230 aa21.9■■□□□ 1.1
USP20-208ENST00000494971 GLTPD2A6NH11 291 aa21.89■■□□□ 1.09
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USP20-208ENST00000494971 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
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USP20-208ENST00000494971 BBOX1O75936 387 aa21.88■■□□□ 1.09
USP20-208ENST00000494971 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
USP20-208ENST00000494971 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
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USP20-208ENST00000494971 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
USP20-208ENST00000494971 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.87■■□□□ 1.09
USP20-208ENST00000494971 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
USP20-208ENST00000494971 GRAPQ13588 217 aa21.86■■□□□ 1.09
USP20-208ENST00000494971 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
USP20-208ENST00000494971 SLC51AQ86UW1 340 aa21.86■■□□□ 1.09
USP20-208ENST00000494971 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
USP20-208ENST00000494971 E9PSI1 815 aa21.85■■□□□ 1.09
USP20-208ENST00000494971 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
USP20-208ENST00000494971 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.85■■□□□ 1.09
USP20-208ENST00000494971 TOMM70O94826 608 aa21.84■■□□□ 1.09
USP20-208ENST00000494971 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
USP20-208ENST00000494971 DPY19L2Q6NUT2 758 aa21.84■■□□□ 1.09
USP20-208ENST00000494971 SP8Q8IXZ3 490 aa21.84■■□□□ 1.09
USP20-208ENST00000494971 RRAGCQ9HB90 399 aa21.84■■□□□ 1.09
USP20-208ENST00000494971 TAF1P21675 1872 aa21.83■■□□□ 1.09
USP20-208ENST00000494971 WDR90Q96KV7 1748 aa21.83■■□□□ 1.09
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