RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494045.5

REXO4-206, Transcript of REX4 homolog, 3'-5' exonuclease, human

TSL 3

Gene REXO4, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
REXO4-206	ENST00000494045	NTSR2	O95665	410 aa		33.24	■■■□□ 2.91
REXO4-206	ENST00000494045	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	33.24	■■■□□ 2.91
REXO4-206	ENST00000494045	NLRP10	Q86W26	655 aa		33.24	■■■□□ 2.91
REXO4-206	ENST00000494045	RNF181	Q9P0P0	153 aa		33.24	■■■□□ 2.91
REXO4-206	ENST00000494045	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
REXO4-206	ENST00000494045	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
REXO4-206	ENST00000494045	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	33.23	■■■□□ 2.91
REXO4-206	ENST00000494045	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
REXO4-206	ENST00000494045	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		33.23	■■■□□ 2.91
REXO4-206	ENST00000494045	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		33.23	■■■□□ 2.91
REXO4-206	ENST00000494045	ABCC12	Q96J65	1359 aa		33.22	■■■□□ 2.91
REXO4-206	ENST00000494045	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		33.22	■■■□□ 2.91
REXO4-206	ENST00000494045	PRELP	P51888	382 aa		33.22	■■■□□ 2.91
REXO4-206	ENST00000494045	ZNF428	Q96B54	188 aa		33.22	■■■□□ 2.91
REXO4-206	ENST00000494045	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		33.21	■■■□□ 2.91
REXO4-206	ENST00000494045	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		33.21	■■■□□ 2.91
REXO4-206	ENST00000494045	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		33.21	■■■□□ 2.91
REXO4-206	ENST00000494045	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	33.2	■■■□□ 2.91
REXO4-206	ENST00000494045	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
REXO4-206	ENST00000494045	FLII	Q13045	1269 aa		33.18	■■■□□ 2.9
REXO4-206	ENST00000494045	KSR2	Q6VAB6	950 aa		33.18	■■■□□ 2.9
REXO4-206	ENST00000494045	MYD88	Q99836	296 aa		33.18	■■■□□ 2.9
REXO4-206	ENST00000494045	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		33.18	■■■□□ 2.9
REXO4-206	ENST00000494045	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		33.17	■■■□□ 2.9
REXO4-206	ENST00000494045	SRGN	P10124	158 aa		33.17	■■■□□ 2.9
REXO4-206	ENST00000494045	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		33.17	■■■□□ 2.9
REXO4-206	ENST00000494045	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
REXO4-206	ENST00000494045	SBF1	O95248	1867 aa		33.16	■■■□□ 2.9
REXO4-206	ENST00000494045	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
REXO4-206	ENST00000494045	NFKBIE	O00221	500 aa		33.15	■■■□□ 2.9
REXO4-206	ENST00000494045	MASTL	Q96GX5	879 aa		33.15	■■■□□ 2.9
REXO4-206	ENST00000494045	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
REXO4-206	ENST00000494045	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
REXO4-206	ENST00000494045	C21orf2	O43822	256 aa		33.14	■■■□□ 2.9
REXO4-206	ENST00000494045	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
REXO4-206	ENST00000494045	STYK1	Q6J9G0	422 aa		33.14	■■■□□ 2.9
REXO4-206	ENST00000494045	SYNE4	Q8N205	404 aa		33.14	■■■□□ 2.9
REXO4-206	ENST00000494045	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		33.13	■■■□□ 2.89
REXO4-206	ENST00000494045	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
REXO4-206	ENST00000494045	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		33.11	■■■□□ 2.89
REXO4-206	ENST00000494045	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		33.11	■■■□□ 2.89
REXO4-206	ENST00000494045	NPR1	P16066	1061 aa		33.11	■■■□□ 2.89
REXO4-206	ENST00000494045	CNKSR1	Q969H4	720 aa		33.11	■■■□□ 2.89
REXO4-206	ENST00000494045	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		33.1	■■■□□ 2.89
REXO4-206	ENST00000494045	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		33.1	■■■□□ 2.89
REXO4-206	ENST00000494045	CACNA1F	O60840	1977 aa		33.09	■■■□□ 2.89
REXO4-206	ENST00000494045	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
REXO4-206	ENST00000494045	LMNB1	P20700	586 aa		33.09	■■■□□ 2.89
REXO4-206	ENST00000494045	FAM89A	Q96GI7	184 aa		33.09	■■■□□ 2.89
REXO4-206	ENST00000494045	CRY2	Q49AN0	593 aa		33.08	■■■□□ 2.89
REXO4-206	ENST00000494045	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	33.08	■■■□□ 2.89
REXO4-206	ENST00000494045	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
REXO4-206	ENST00000494045	NLRP3	Q96P20	1036 aa		33.08	■■■□□ 2.89
REXO4-206	ENST00000494045	SLX4	Q8IY92	1834 aa		33.07	■■■□□ 2.89
REXO4-206	ENST00000494045	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		33.07	■■■□□ 2.88
REXO4-206	ENST00000494045	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		33.07	■■■□□ 2.88
REXO4-206	ENST00000494045	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
REXO4-206	ENST00000494045	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	33.06	■■■□□ 2.88
REXO4-206	ENST00000494045	IGKV5-2	P06315	115 aa		33.05	■■■□□ 2.88
REXO4-206	ENST00000494045	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
REXO4-206	ENST00000494045	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		33.05	■■■□□ 2.88
REXO4-206	ENST00000494045	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		33.05	■■■□□ 2.88
REXO4-206	ENST00000494045	HSPA6	P17066	643 aa		33.04	■■■□□ 2.88
REXO4-206	ENST00000494045	CACNA1S	Q13698	1873 aa		33.03	■■■□□ 2.88
REXO4-206	ENST00000494045		F6X3S4	739 aa		33.03	■■■□□ 2.88
REXO4-206	ENST00000494045	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
REXO4-206	ENST00000494045	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
REXO4-206	ENST00000494045	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		33.03	■■■□□ 2.88
REXO4-206	ENST00000494045	RRAGC	Q9HB90	399 aa		33.03	■■■□□ 2.88
REXO4-206	ENST00000494045	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		33.02	■■■□□ 2.88
REXO4-206	ENST00000494045	TOMM70	O94826	608 aa		33.02	■■■□□ 2.88
REXO4-206	ENST00000494045	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
REXO4-206	ENST00000494045	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		33.02	■■■□□ 2.88
REXO4-206	ENST00000494045	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.87
REXO4-206	ENST00000494045	ALDH1B1	P30837	517 aa		33.01	■■■□□ 2.87
REXO4-206	ENST00000494045	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.87
REXO4-206	ENST00000494045	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		33	■■■□□ 2.87
REXO4-206	ENST00000494045	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
REXO4-206	ENST00000494045	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
REXO4-206	ENST00000494045	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
REXO4-206	ENST00000494045	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		32.99	■■■□□ 2.87
REXO4-206	ENST00000494045	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		32.99	■■■□□ 2.87
REXO4-206	ENST00000494045	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		32.99	■■■□□ 2.87
REXO4-206	ENST00000494045	OLFM4	Q6UX06	510 aa		32.99	■■■□□ 2.87
REXO4-206	ENST00000494045	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		32.99	■■■□□ 2.87
REXO4-206	ENST00000494045	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		32.99	■■■□□ 2.87
REXO4-206	ENST00000494045	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		32.99	■■■□□ 2.87
REXO4-206	ENST00000494045	LINS1	Q8NG48	757 aa		32.97	■■■□□ 2.87
REXO4-206	ENST00000494045	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		32.97	■■■□□ 2.87
REXO4-206	ENST00000494045	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
REXO4-206	ENST00000494045	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		32.96	■■■□□ 2.87
REXO4-206	ENST00000494045	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
REXO4-206	ENST00000494045	CEP350	Q5VT06	3117 aa		32.95	■■■□□ 2.87
REXO4-206	ENST00000494045	GLTPD2	A6NH11	291 aa		32.95	■■■□□ 2.87
REXO4-206	ENST00000494045	LAMB2	P55268	1798 aa		32.95	■■■□□ 2.87
REXO4-206	ENST00000494045	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		32.95	■■■□□ 2.86
REXO4-206	ENST00000494045	GCKR	Q14397	625 aa		32.94	■■■□□ 2.86
REXO4-206	ENST00000494045	BEND3	Q5T5X7	828 aa		32.93	■■■□□ 2.86
REXO4-206	ENST00000494045	SOGA3	Q5TF21	947 aa		32.93	■■■□□ 2.86
REXO4-206	ENST00000494045	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		32.93	■■■□□ 2.86

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