RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493959.6

SENP6-211, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 867 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-211ENST00000493959 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
SENP6-211ENST00000493959 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa29.44■■■□□ 2.3
SENP6-211ENST00000493959 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
SENP6-211ENST00000493959 GLTPD2A6NH11 291 aa29.43■■■□□ 2.3
SENP6-211ENST00000493959 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
SENP6-211ENST00000493959 CCDC93Q567U6 631 aa29.43■■■□□ 2.3
SENP6-211ENST00000493959 SLC51AQ86UW1 340 aa29.43■■■□□ 2.3
SENP6-211ENST00000493959 NLRP10Q86W26 655 aa29.43■■■□□ 2.3
SENP6-211ENST00000493959 LTBP3Q9NS15 1303 aa29.43■■■□□ 2.3
SENP6-211ENST00000493959 SOGA3Q5TF21 947 aa29.42■■■□□ 2.3
SENP6-211ENST00000493959 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
SENP6-211ENST00000493959 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
SENP6-211ENST00000493959 SLC10A5Q5PT55 438 aa29.41■■■□□ 2.3
SENP6-211ENST00000493959 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa29.41■■■□□ 2.3
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SENP6-211ENST00000493959 PLBD2Q8NHP8 589 aa29.4■■■□□ 2.3
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SENP6-211ENST00000493959 WWC1Q8IX03 1113 aa29.39■■■□□ 2.3
SENP6-211ENST00000493959 TSPYL6Q8N831 410 aa29.39■■■□□ 2.3
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SENP6-211ENST00000493959 HYPKQ9NX55 129 aa29.39■■■□□ 2.3
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SENP6-211ENST00000493959 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa29.38■■■□□ 2.29
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SENP6-211ENST00000493959 NLRP3Q96P20 1036 aa29.38■■■□□ 2.29
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SENP6-211ENST00000493959 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
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SENP6-211ENST00000493959 RTKN2Q8IZC4 609 aa29.36■■■□□ 2.29
SENP6-211ENST00000493959 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
SENP6-211ENST00000493959 CRAMP1Q96RY5 1269 aa29.36■■■□□ 2.29
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SENP6-211ENST00000493959 RIC1Q4ADV7 1423 aa29.36■■■□□ 2.29
SENP6-211ENST00000493959 CCDC27Q2M243 656 aa29.35■■■□□ 2.29
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SENP6-211ENST00000493959 DPY19L2Q6NUT2 758 aa29.34■■■□□ 2.29
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SENP6-211ENST00000493959 SNED1Q8TER0 1413 aa29.3■■■□□ 2.28
SENP6-211ENST00000493959 RIC3Q7Z5B4 369 aa29.3■■■□□ 2.28
SENP6-211ENST00000493959 FAM89AQ96GI7 184 aa29.3■■■□□ 2.28
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SENP6-211ENST00000493959 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
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SENP6-211ENST00000493959 RNF123Q5XPI4 1314 aa29.28■■■□□ 2.28
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SENP6-211ENST00000493959 CCDC30Q5VVM6 783 aa29.27■■■□□ 2.28
SENP6-211ENST00000493959 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa29.27■■■□□ 2.28
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SENP6-211ENST00000493959 LAMB2P55268 1798 aa29.25■■■□□ 2.27
SENP6-211ENST00000493959 IL16Q14005 1332 aa29.24■■■□□ 2.27
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SENP6-211ENST00000493959 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa29.24■■■□□ 2.27
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SENP6-211ENST00000493959 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
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SENP6-211ENST00000493959 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
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SENP6-211ENST00000493959 BBOX1O75936 387 aa29.21■■■□□ 2.27
SENP6-211ENST00000493959 G2E3Q7L622 706 aa29.21■■■□□ 2.27
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SENP6-211ENST00000493959 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
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SENP6-211ENST00000493959 POTEJP0CG39 1038 aa29.19■■■□□ 2.26
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SENP6-211ENST00000493959 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
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SENP6-211ENST00000493959 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
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SENP6-211ENST00000493959 SP8Q8IXZ3 490 aa29.18■■■□□ 2.26
SENP6-211ENST00000493959 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
SENP6-211ENST00000493959 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
SENP6-211ENST00000493959 CHMP4AQ9BY43 222 aa29.18■■■□□ 2.26
SENP6-211ENST00000493959 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa29.18■■■□□ 2.26
SENP6-211ENST00000493959 PI4KAP2A4QPH2 592 aa29.17■■■□□ 2.26
SENP6-211ENST00000493959 SLC4A2P04920 1241 aa29.17■■■□□ 2.26
SENP6-211ENST00000493959 LARGE2Q8N3Y3 721 aa29.17■■■□□ 2.26
SENP6-211ENST00000493959 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa29.17■■■□□ 2.26
SENP6-211ENST00000493959 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa29.17■■■□□ 2.26
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