RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 USP5P45974 858 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 BTLAQ7Z6A9 289 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 RGL4Q8IZJ4 473 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 CFHR5Q9BXR6 569 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 THBS1P07996 1170 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 PCSK2P16519 638 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 IDH3AP50213 366 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 EDEM1Q92611 657 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 PDGFAP04085 211 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 INPP5BP32019 993 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 ARSDP51689 593 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 PDE3BQ13370 1112 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 GPR152Q8TDT2 470 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 POLIQ9UNA4 740 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 OPLAHO14841 1288 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 GMPRP36959 345 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 TYRO3Q06418 890 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 TMC7Q7Z402 723 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 TMC1Q8TDI8 760 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 CEP63Q96MT8 703 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 EPB42P16452 691 aa8.53□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 LCE2CQ5TA81 110 aa8.53□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 GJD3Q8N144 294 aa8.53□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.53□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 FAM129BQ96TA1 746 aa8.53□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 NDFIP2Q9NV92 336 aa8.53□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CCL20-204ENST00000489160 GPR25O00155 361 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 FAM157BP0CG42 384 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 COL19A1Q14993 1142 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 TTC16Q8NEE8 873 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 WIPF1O43516 503 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 BNIP3LO60238 219 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 EHHADHQ08426 723 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 BRD7Q9NPI1 651 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 TREHO43280 583 aa8.5□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 TNP2Q05952 138 aa8.5□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 LAMC2Q13753 1193 aa8.5□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 GAS6Q14393 721 aa8.5□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 C11orf16Q9NQ32 467 aa8.5□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 MBIPQ9NS73 344 aa8.5□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
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CCL20-204ENST00000489160 MX2P20592 715 aa8.49□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 FGFR3P22607 806 aa8.49□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 KCNQ4P56696 695 aa8.49□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 C8orf34Q49A92 452 aa8.49□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 ABHD17AQ96GS6 310 aa8.49□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa8.49□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa8.49□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 MAPTP10636 758 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 PLCB3Q01970 1234 aa8.48□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 DSC3Q14574 896 aa8.48□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 RNFT1Q5M7Z0 435 aa8.48□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 BCL2L13Q9BXK5 485 aa8.48□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 GGNBP2Q9H3C7 697 aa8.48□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 USP20Q9Y2K6 914 aa8.48□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.48□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 DCDC2BA2VCK2 349 aa8.47□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 UBAP1LF5GYI3 381 aa8.47□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 GPR182O15218 404 aa8.47□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 EFSO43281 561 aa8.47□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 KRT76Q01546 638 aa8.47□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 FAM182BQ5T319 152 aa8.47□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 MARK1Q9P0L2 795 aa8.47□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 KCNH4Q9UQ05 1017 aa8.47□□□□□ -1.05
CCL20-204ENST00000489160 EGFRP00533 1210 aa8.46□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 NEFLP07196 543 aa8.46□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 MAP2K3P46734 347 aa8.46□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP8.46□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 XKR5Q6UX68 686 aa8.46□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 XYLBO75191 536 aa8.45□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 P4HBP07237 508 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
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