RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487621.5

SEMA3C-209, Transcript of semaphorin 3C, human

TSL 5

Gene SEMA3C, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA3C-209	ENST00000487621	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SEMA3C-209	ENST00000487621	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SEMA3C-209	ENST00000487621	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SEMA3C-209	ENST00000487621	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SEMA3C-209	ENST00000487621	HOXB7	P09629	217 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SEMA3C-209	ENST00000487621	ZNF853	P0CG23	659 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SEMA3C-209	ENST00000487621	APAF1	O14727	1248 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SEMA3C-209	ENST00000487621	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
SEMA3C-209	ENST00000487621	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SEMA3C-209	ENST00000487621	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
SEMA3C-209	ENST00000487621	MBIP	Q9NS73	344 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SEMA3C-209	ENST00000487621	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SEMA3C-209	ENST00000487621	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
SEMA3C-209	ENST00000487621	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
SEMA3C-209	ENST00000487621	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
SEMA3C-209	ENST00000487621	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SEMA3C-209	ENST00000487621	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SEMA3C-209	ENST00000487621	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SEMA3C-209	ENST00000487621	TCIRG1	Q13488	830 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SEMA3C-209	ENST00000487621	NLRP10	Q86W26	655 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SEMA3C-209	ENST00000487621	PSMD1	Q99460	953 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SEMA3C-209	ENST00000487621	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SEMA3C-209	ENST00000487621	CCDC184	Q52MB2	194 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SEMA3C-209	ENST00000487621	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SEMA3C-209	ENST00000487621	SYNE4	Q8N205	404 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SEMA3C-209	ENST00000487621	HTRA3	P83110	453 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SEMA3C-209	ENST00000487621	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SEMA3C-209	ENST00000487621	SLC51A	Q86UW1	340 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SEMA3C-209	ENST00000487621	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
SEMA3C-209	ENST00000487621	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SEMA3C-209	ENST00000487621	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
SEMA3C-209	ENST00000487621	NLRP3	Q96P20	1036 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SEMA3C-209	ENST00000487621	IFT57	Q9NWB7	429 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SEMA3C-209	ENST00000487621	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
SEMA3C-209	ENST00000487621	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
SEMA3C-209	ENST00000487621	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
SEMA3C-209	ENST00000487621	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SEMA3C-209	ENST00000487621	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SEMA3C-209	ENST00000487621	FZD9	O00144	591 aa		32.25	■■■□□ 2.75
SEMA3C-209	ENST00000487621	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
SEMA3C-209	ENST00000487621	GNAI1	P63096	354 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SEMA3C-209	ENST00000487621	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SEMA3C-209	ENST00000487621	COL4A5	P29400	1685 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SEMA3C-209	ENST00000487621	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
SEMA3C-209	ENST00000487621	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SEMA3C-209	ENST00000487621	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SEMA3C-209	ENST00000487621	HYPK	Q9NX55	129 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SEMA3C-209	ENST00000487621	ABCC4	O15439	1325 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SEMA3C-209	ENST00000487621	POTEI	P0CG38	1075 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SEMA3C-209	ENST00000487621	POTEJ	P0CG39	1038 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SEMA3C-209	ENST00000487621	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
SEMA3C-209	ENST00000487621	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
SEMA3C-209	ENST00000487621	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		32.21	■■■□□ 2.75
SEMA3C-209	ENST00000487621	KLRG1	Q96E93	195 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SEMA3C-209	ENST00000487621	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		32.19	■■■□□ 2.74
SEMA3C-209	ENST00000487621	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
SEMA3C-209	ENST00000487621	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	32.19	■■■□□ 2.74
SEMA3C-209	ENST00000487621	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		32.19	■■■□□ 2.74
SEMA3C-209	ENST00000487621	LAMB2	P55268	1798 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SEMA3C-209	ENST00000487621	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SEMA3C-209	ENST00000487621	CHADL	Q6NUI6	762 aa		32.17	■■■□□ 2.74
SEMA3C-209	ENST00000487621	SCN4A	P35499	1836 aa		32.16	■■■□□ 2.74
SEMA3C-209	ENST00000487621	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	32.16	■■■□□ 2.74
SEMA3C-209	ENST00000487621	JDP2	Q8WYK2	163 aa		32.16	■■■□□ 2.74
SEMA3C-209	ENST00000487621	ZNF428	Q96B54	188 aa		32.16	■■■□□ 2.74
SEMA3C-209	ENST00000487621	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		32.15	■■■□□ 2.74
SEMA3C-209	ENST00000487621	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
SEMA3C-209	ENST00000487621	BBOX1	O75936	387 aa		32.14	■■■□□ 2.74
SEMA3C-209	ENST00000487621	GPC2	Q8N158	579 aa		32.14	■■■□□ 2.74
SEMA3C-209	ENST00000487621	JMY	Q8N9B5	988 aa		32.14	■■■□□ 2.74
SEMA3C-209	ENST00000487621	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
SEMA3C-209	ENST00000487621	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
SEMA3C-209	ENST00000487621	CCDC27	Q2M243	656 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SEMA3C-209	ENST00000487621	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
SEMA3C-209	ENST00000487621	GRAP	Q13588	217 aa		32.12	■■■□□ 2.73
SEMA3C-209	ENST00000487621	LDHD	Q86WU2	507 aa		32.12	■■■□□ 2.73
SEMA3C-209	ENST00000487621	SP8	Q8IXZ3	490 aa		32.12	■■■□□ 2.73
SEMA3C-209	ENST00000487621	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		32.12	■■■□□ 2.73
SEMA3C-209	ENST00000487621	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
SEMA3C-209	ENST00000487621	FAM89A	Q96GI7	184 aa		32.12	■■■□□ 2.73
SEMA3C-209	ENST00000487621	HACL1	Q9UJ83	578 aa		32.12	■■■□□ 2.73
SEMA3C-209	ENST00000487621	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
SEMA3C-209	ENST00000487621	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
SEMA3C-209	ENST00000487621	TSPYL6	Q8N831	410 aa		32.1	■■■□□ 2.73
SEMA3C-209	ENST00000487621	VPS33B	Q9H267	617 aa		32.1	■■■□□ 2.73
SEMA3C-209	ENST00000487621	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
SEMA3C-209	ENST00000487621	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
SEMA3C-209	ENST00000487621	WWC1	Q8IX03	1113 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SEMA3C-209	ENST00000487621	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SEMA3C-209	ENST00000487621	EPHX2	P34913	555 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SEMA3C-209	ENST00000487621	GOLGA2	Q08379	1002 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SEMA3C-209	ENST00000487621	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
SEMA3C-209	ENST00000487621	PPIP5K2	O43314	1243 aa		32.07	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	AOC3	Q16853	763 aa		32.07	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		32.07	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	PASK	Q96RG2	1323 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	PCNT	O95613	3336 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
SEMA3C-209	ENST00000487621	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		32.05	■■■□□ 2.72

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