RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487620.1

ZNF3-215, Transcript of zinc finger protein 3, human

TSL 2

Gene ZNF3, Length 2,660 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF3-215	ENST00000487620	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	LTN1	O94822	1766 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	LIG1	P18858	919 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	HOXB7	P09629	217 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	STK3	Q13188	491 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	MTX1	Q13505	466 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	LUZP1	Q86V48	1076 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	TYRO3	Q06418	890 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	PROSER3	Q2NL68	480 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	KCNB2	Q92953	911 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	SIL1	Q9H173	461 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	SLC27A2	O14975	620 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	TPM3	P06753	285 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	PTGS1	P23219	599 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	PSMA5	P28066	241 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	DRC7	Q8IY82	874 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	MAP4K1	Q92918	833 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	FSD1	Q9BTV5	496 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	TNMD	Q9H2S6	317 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	DACT1	Q9NYF0	836 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620		A0A0D9SFI3	127 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	PDC	P20941	246 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	SPATA32	Q96LK8	384 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	TBX22	Q9Y458	520 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	HIP1	O00291	1037 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	SASH1	O94885	1247 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	CBX1	P83916	185 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	RNF20	Q5VTR2	975 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	KSR2	Q6VAB6	950 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	ALDH1L1	O75891	902 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	KLHL34	Q8N239	644 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	IP6K1	Q92551	441 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	SUCLG2	Q96I99	432 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	ELP1	O95163	1332 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	ANKRD1	Q15327	319 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	KCNA6	P17658	529 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	RPS6KB1	P23443	525 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	TRIM5	Q9C035	493 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	CBX8	Q9HC52	389 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	GRM8	O00222	908 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	BICD2	Q8TD16	824 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	LRMP	Q12912	555 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ZNF3-215	ENST00000487620	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
ZNF3-215	ENST00000487620	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ZNF3-215	ENST00000487620	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
ZNF3-215	ENST00000487620	NR1I2	O75469	434 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ZNF3-215	ENST00000487620	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
ZNF3-215	ENST00000487620	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
ZNF3-215	ENST00000487620	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
ZNF3-215	ENST00000487620	KAZALD1	Q96I82	304 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ZNF3-215	ENST00000487620	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
ZNF3-215	ENST00000487620	ATP2B3	Q16720	1220 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ZNF3-215	ENST00000487620	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ZNF3-215	ENST00000487620	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56

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