RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486192.1

SORCS1-208, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene SORCS1, Length 632 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS1-208ENST00000486192 CACNA1FO60840 1977 aa11.36□□□□□ -0.59
SORCS1-208ENST00000486192 MS4A1P11836 297 aa11.35□□□□□ -0.59
SORCS1-208ENST00000486192 NFIXQ14938 502 aa11.35□□□□□ -0.59
SORCS1-208ENST00000486192 HLFQ16534 295 aa11.35□□□□□ -0.59
SORCS1-208ENST00000486192 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa11.35□□□□□ -0.59
SORCS1-208ENST00000486192 ZNF34Q8IZ26 560 aa11.35□□□□□ -0.59
SORCS1-208ENST00000486192 LINS1Q8NG48 757 aa11.35□□□□□ -0.59
SORCS1-208ENST00000486192 KLRG1Q96E93 195 aa11.35□□□□□ -0.59
SORCS1-208ENST00000486192 NYXQ9GZU5 481 aa11.35□□□□□ -0.59
SORCS1-208ENST00000486192 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP11.35□□□□□ -0.59
SORCS1-208ENST00000486192 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa11.35□□□□□ -0.59
SORCS1-208ENST00000486192 PARP3Q9Y6F1 533 aa11.35□□□□□ -0.59
SORCS1-208ENST00000486192 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa11.35□□□□□ -0.59
SORCS1-208ENST00000486192 BCAR3O75815 825 aa11.34□□□□□ -0.59
SORCS1-208ENST00000486192 MMP10P09238 476 aa11.34□□□□□ -0.59
SORCS1-208ENST00000486192 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
SORCS1-208ENST00000486192 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa11.34□□□□□ -0.59
SORCS1-208ENST00000486192 TBC1D9BQ66K14 1250 aa11.34□□□□□ -0.59
SORCS1-208ENST00000486192 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa11.34□□□□□ -0.59
SORCS1-208ENST00000486192 CCDC191Q8NCU4 936 aa11.34□□□□□ -0.59
SORCS1-208ENST00000486192 ISCA1Q9BUE6 129 aa11.34□□□□□ -0.59
SORCS1-208ENST00000486192 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
SORCS1-208ENST00000486192 PCNTO95613 3336 aa11.34□□□□□ -0.59
SORCS1-208ENST00000486192 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 ALDH1L1O75891 902 aa11.33□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 CCT4P50991 539 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 TPTE2Q6XPS3 522 aa11.33□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 BEND3Q5T5X7 828 aa11.32□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 NLRP10Q86W26 655 aa11.32□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 MYD88Q99836 296 aa11.32□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa11.32□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 ABCC4O15439 1325 aa11.32□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 UBN2Q6ZU65 1347 aa11.32□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 KIF13BQ9NQT8 1826 aa11.31□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 NEURL1BA8MQ27 555 aa11.31□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 NPHP1O15259 732 aa11.31□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 SERPINB2P05120 415 aa11.31□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 TRIM27P14373 513 aa11.31□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 DPEP1P16444 411 aa11.31□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 PRELPP51888 382 aa11.31□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 ST5P78524 1137 aa11.31□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 DDR1Q08345 913 aa11.31□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 C9orf131Q5VYM1 1079 aa11.31□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 BICDL1Q6ZP65 573 aa11.31□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 CNBD1Q8NA66 436 aa11.31□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa11.31□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 RRAGCQ9HB90 399 aa11.31□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 RIC1Q4ADV7 1423 aa11.31□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 F6X3S4 739 aa11.3□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 NTSR2O95665 410 aa11.3□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 IGKV5-2P06315 115 aa11.3□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 GPTP24298 496 aa11.3□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 PDE3AQ14432 1141 aa11.3□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 SLC4A10Q6U841 1118 aa11.3□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 JMYQ8N9B5 988 aa11.3□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 HDAC5Q9UQL6 1122 aa11.3□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa11.3□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 SH3TC1Q8TE82 1336 aa11.3□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 C10orf71Q711Q0 1435 aa11.29□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa11.29□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 GCKRQ14397 625 aa11.29□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 SUSD4Q5VX71 490 aa11.29□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 PRR5LQ6MZQ0 368 aa11.29□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 BRIP1Q9BX63 1249 aa11.29□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 PDE6BP35913 854 aa11.28□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 SLC10A5Q5PT55 438 aa11.28□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 NRXN2Q9P2S2 1712 aa11.28□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 CDHR2Q9BYE9 1310 aa11.28□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa11.28□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 NUP98P52948 1817 aa11.28□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 SBF1O95248 1867 aa11.27□□□□□ -0.6
SORCS1-208ENST00000486192 H7C1W4 665 aa11.27□□□□□ -0.61
SORCS1-208ENST00000486192 GRM8O00222 908 aa11.27□□□□□ -0.61
SORCS1-208ENST00000486192 RRP1P56182 461 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
SORCS1-208ENST00000486192 TGFB2P61812 414 aa11.27□□□□□ -0.61
SORCS1-208ENST00000486192 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
SORCS1-208ENST00000486192 RNF181Q9P0P0 153 aa11.27□□□□□ -0.61
SORCS1-208ENST00000486192 UTYO14607 1347 aa11.27□□□□□ -0.61
SORCS1-208ENST00000486192 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa11.26□□□□□ -0.61
SORCS1-208ENST00000486192 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa11.26□□□□□ -0.61
SORCS1-208ENST00000486192 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
SORCS1-208ENST00000486192 GNAI3P08754 354 aa11.26□□□□□ -0.61
SORCS1-208ENST00000486192 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms