RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 PSMD1Q99460 953 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 WBP1LQ9NX94 342 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 LTBP1Q14766 1721 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 DEFB115Q30KQ5 88 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 CRY2Q49AN0 593 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 NYXQ9GZU5 481 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGEF1-207ENST00000484547 RASSF10A6NK89 507 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 EIF6P56537 245 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 TRPM7Q96QT4 1865 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 GPTP24298 496 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 KIF6Q6ZMV9 814 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 TTLL7Q6ZT98 887 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC51AQ86UW1 340 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 ERVV-1B6SEH8 477 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 MYL6BP14649 208 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 LARGE2Q8N3Y3 721 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 ZBTB3Q9H5J0 574 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 UBN2Q6ZU65 1347 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 EPS15P42566 896 aa15.54■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 MIER1Q8N108 512 aa15.54■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 SCNN1DP51172 638 aa15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 SUSD4Q5VX71 490 aa15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 RIC1Q4ADV7 1423 aa15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 NEFMP07197 916 aa15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 GRM1Q13255 1194 aa15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 C3orf67Q6ZVT6 689 aa15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
RABGEF1-207ENST00000484547 CRAMP1Q96RY5 1269 aa15.52■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 THSD7BQ9C0I4 1608 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 TRAF5O00463 557 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 NTSR2O95665 410 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 GRIPAP1Q4V328 841 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 NIM1KQ8IY84 436 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF34Q8IZ26 560 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 CAPNS2Q96L46 248 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 PPIP5K2O43314 1243 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 CYP4F22Q6NT55 531 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 ABHD8Q96I13 439 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 AOC3Q16853 763 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 ECE1P42892 770 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 NFE2L2Q16236 605 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 CST9Q5W186 159 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 LAMB2P55268 1798 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 NLRP3Q96P20 1036 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 BEGAINQ9BUH8 593 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 PARP10Q53GL7 1025 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 PLEKHF1Q96S99 279 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 GPRC5DQ9NZD1 345 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 TAF1P21675 1872 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 ABCC4O15439 1325 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 ERBB4Q15303 1308 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 TSKSQ9UJT2 592 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 TLL2Q9Y6L7 1015 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGEF1-207ENST00000484547 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 AOC2O75106 756 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 ANXA1P04083 346 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 CXCL9Q07325 125 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 TSPYL4Q9UJ04 414 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNRF3Q9ULT6 936 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 PROSER3Q2NL68 480 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM161AQ3B820 660 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 CELF2O95319 508 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 PDIA6Q15084 440 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC10A5Q5PT55 438 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 LRP10Q7Z4F1 713 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 SUPT20HQ8NEM7 779 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1-207ENST00000484547 VPS33BQ9H267 617 aa15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms