RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SH3BP4-209ENST00000484097 CACNA1SQ13698 1873 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP4-209ENST00000484097 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP4-209ENST00000484097 C21orf2O43822 256 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP4-209ENST00000484097 VAMP4O75379 141 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC4A2P04920 1241 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP4-209ENST00000484097 ALDH1B1P30837 517 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP4-209ENST00000484097 NLRP3Q96P20 1036 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP4-209ENST00000484097 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP4-209ENST00000484097 ABCC12Q96J65 1359 aa24.75■■□□□ 1.55
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SH3BP4-209ENST00000484097 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
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SH3BP4-209ENST00000484097 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF521Q96K83 1311 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP4-209ENST00000484097 CACNA1FO60840 1977 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3BP4-209ENST00000484097 SLX4Q8IY92 1834 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP4-209ENST00000484097 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP4-209ENST00000484097 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP4-209ENST00000484097 SOGA3Q5TF21 947 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP4-209ENST00000484097 MYD88Q99836 296 aa24.72■■□□□ 1.55
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SH3BP4-209ENST00000484097 CRY2Q49AN0 593 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP4-209ENST00000484097 C9orf131Q5VYM1 1079 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP4-209ENST00000484097 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SH3BP4-209ENST00000484097 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.7■■□□□ 1.55
SH3BP4-209ENST00000484097 E9PSI1 815 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP4-209ENST00000484097 KSR2Q6VAB6 950 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF428Q96B54 188 aa24.7■■□□□ 1.54
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SH3BP4-209ENST00000484097 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
SH3BP4-209ENST00000484097 RNF181Q9P0P0 153 aa24.69■■□□□ 1.54
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SH3BP4-209ENST00000484097 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP4-209ENST00000484097 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SH3BP4-209ENST00000484097 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.68■■□□□ 1.54
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SH3BP4-209ENST00000484097 SYNE4Q8N205 404 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP4-209ENST00000484097 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP4-209ENST00000484097 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM89AQ96GI7 184 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP4-209ENST00000484097 LMNB1P20700 586 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP4-209ENST00000484097 FLIIQ13045 1269 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP4-209ENST00000484097 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC93Q567U6 631 aa24.66■■□□□ 1.54
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SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
SH3BP4-209ENST00000484097 CRAMP1Q96RY5 1269 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP4-209ENST00000484097 ADCY9O60503 1353 aa24.66■■□□□ 1.54
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SH3BP4-209ENST00000484097 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
SH3BP4-209ENST00000484097 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.65■■□□□ 1.54
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SH3BP4-209ENST00000484097 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
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SH3BP4-209ENST00000484097 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.64■■□□□ 1.54
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SH3BP4-209ENST00000484097 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa24.64■■□□□ 1.53
SH3BP4-209ENST00000484097 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
SH3BP4-209ENST00000484097 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
SH3BP4-209ENST00000484097 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
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SH3BP4-209ENST00000484097 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP4-209ENST00000484097 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP4-209ENST00000484097 LTBP3Q9NS15 1303 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP4-209ENST00000484097 LAMB2P55268 1798 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP4-209ENST00000484097 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
SH3BP4-209ENST00000484097 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
SH3BP4-209ENST00000484097 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP4-209ENST00000484097 BBOX1O75936 387 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP4-209ENST00000484097 IGKV5-2P06315 115 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP4-209ENST00000484097 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.53
SH3BP4-209ENST00000484097 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP4-209ENST00000484097 OLFM4Q6UX06 510 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP4-209ENST00000484097 ABCC4O15439 1325 aa24.58■■□□□ 1.52
SH3BP4-209ENST00000484097 PRELPP51888 382 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP4-209ENST00000484097 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
SH3BP4-209ENST00000484097 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
SH3BP4-209ENST00000484097 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
SH3BP4-209ENST00000484097 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
SH3BP4-209ENST00000484097 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP4-209ENST00000484097 GRAPQ13588 217 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP4-209ENST00000484097 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
SH3BP4-209ENST00000484097 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
SH3BP4-209ENST00000484097 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
SH3BP4-209ENST00000484097 PDE8AO60658 829 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP4-209ENST00000484097 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP4-209ENST00000484097 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
SH3BP4-209ENST00000484097 LINS1Q8NG48 757 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP4-209ENST00000484097 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP4-209ENST00000484097 F6X3S4 739 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP4-209ENST00000484097 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.52
SH3BP4-209ENST00000484097 DPY19L2Q6NUT2 758 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
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