RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481079.1

PTPRD-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-210ENST00000481079 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
PTPRD-210ENST00000481079 TCIRG1Q13488 830 aa31.07■■■□□ 2.56
PTPRD-210ENST00000481079 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa31.07■■■□□ 2.56
PTPRD-210ENST00000481079 C3orf67Q6ZVT6 689 aa31.07■■■□□ 2.56
PTPRD-210ENST00000481079 NLRP10Q86W26 655 aa31.07■■■□□ 2.56
PTPRD-210ENST00000481079 SOGA3Q5TF21 947 aa31.06■■■□□ 2.56
PTPRD-210ENST00000481079 PLBD2Q8NHP8 589 aa31.06■■■□□ 2.56
PTPRD-210ENST00000481079 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
PTPRD-210ENST00000481079 HYPKQ9NX55 129 aa31.06■■■□□ 2.56
PTPRD-210ENST00000481079 SLC10A5Q5PT55 438 aa31.05■■■□□ 2.56
PTPRD-210ENST00000481079 TAOK3Q9H2K8 898 aa31.05■■■□□ 2.56
PTPRD-210ENST00000481079 ALDH1B1P30837 517 aa31.04■■■□□ 2.56
PTPRD-210ENST00000481079 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
PTPRD-210ENST00000481079 OLFM4Q6UX06 510 aa31.04■■■□□ 2.56
PTPRD-210ENST00000481079 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa31.04■■■□□ 2.56
PTPRD-210ENST00000481079 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
PTPRD-210ENST00000481079 TSPYL6Q8N831 410 aa31.03■■■□□ 2.56
PTPRD-210ENST00000481079 SNED1Q8TER0 1413 aa31.03■■■□□ 2.56
PTPRD-210ENST00000481079 RNF123Q5XPI4 1314 aa31.02■■■□□ 2.56
PTPRD-210ENST00000481079 CEP350Q5VT06 3117 aa31.02■■■□□ 2.56
PTPRD-210ENST00000481079 CCDC93Q567U6 631 aa31.02■■■□□ 2.56
PTPRD-210ENST00000481079 IL16Q14005 1332 aa31.01■■■□□ 2.56
PTPRD-210ENST00000481079 KDM2BQ8NHM5 1336 aa31.01■■■□□ 2.56
PTPRD-210ENST00000481079 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
PTPRD-210ENST00000481079 LAMB2P55268 1798 aa31■■■□□ 2.55
PTPRD-210ENST00000481079 SYNE4Q8N205 404 aa31■■■□□ 2.55
PTPRD-210ENST00000481079 ISCA1Q9BUE6 129 aa31■■■□□ 2.55
PTPRD-210ENST00000481079 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
PTPRD-210ENST00000481079 GLTPD2A6NH11 291 aa30.98■■■□□ 2.55
PTPRD-210ENST00000481079 CRAMP1Q96RY5 1269 aa30.98■■■□□ 2.55
PTPRD-210ENST00000481079 NLRP3Q96P20 1036 aa30.97■■■□□ 2.55
PTPRD-210ENST00000481079 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP30.96■■■□□ 2.55
PTPRD-210ENST00000481079 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
PTPRD-210ENST00000481079 RRAGCQ9HB90 399 aa30.96■■■□□ 2.55
PTPRD-210ENST00000481079 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
PTPRD-210ENST00000481079 TOMM70O94826 608 aa30.95■■■□□ 2.55
PTPRD-210ENST00000481079 SLC51AQ86UW1 340 aa30.95■■■□□ 2.55
PTPRD-210ENST00000481079 RTKN2Q8IZC4 609 aa30.95■■■□□ 2.55
PTPRD-210ENST00000481079 FAM9BQ8IZU0 186 aa30.95■■■□□ 2.55
PTPRD-210ENST00000481079 SH3TC1Q8TE82 1336 aa30.95■■■□□ 2.54
PTPRD-210ENST00000481079 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa30.94■■■□□ 2.54
PTPRD-210ENST00000481079 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
PTPRD-210ENST00000481079 CCDC30Q5VVM6 783 aa30.94■■■□□ 2.54
PTPRD-210ENST00000481079 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
PTPRD-210ENST00000481079 ZNF428Q96B54 188 aa30.94■■■□□ 2.54
PTPRD-210ENST00000481079 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
PTPRD-210ENST00000481079 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
PTPRD-210ENST00000481079 WDR63Q8IWG1 891 aa30.93■■■□□ 2.54
PTPRD-210ENST00000481079 FANCIQ9NVI1 1328 aa30.92■■■□□ 2.54
PTPRD-210ENST00000481079 WDR90Q96KV7 1748 aa30.91■■■□□ 2.54
PTPRD-210ENST00000481079 GOLGA2Q08379 1002 aa30.91■■■□□ 2.54
PTPRD-210ENST00000481079 CHMP4AQ9BY43 222 aa30.91■■■□□ 2.54
PTPRD-210ENST00000481079 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
PTPRD-210ENST00000481079 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
PTPRD-210ENST00000481079 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa30.9■■■□□ 2.54
PTPRD-210ENST00000481079 RIC3Q7Z5B4 369 aa30.9■■■□□ 2.54
PTPRD-210ENST00000481079 PSMD1Q99460 953 aa30.9■■■□□ 2.54
PTPRD-210ENST00000481079 ABCC4O15439 1325 aa30.9■■■□□ 2.54
PTPRD-210ENST00000481079 POTECB2RU33 542 aa30.89■■■□□ 2.54
PTPRD-210ENST00000481079 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
PTPRD-210ENST00000481079 FAM89AQ96GI7 184 aa30.89■■■□□ 2.54
PTPRD-210ENST00000481079 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
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PTPRD-210ENST00000481079 HSPA6P17066 643 aa30.87■■■□□ 2.53
PTPRD-210ENST00000481079 DPY19L2Q6NUT2 758 aa30.87■■■□□ 2.53
PTPRD-210ENST00000481079 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
PTPRD-210ENST00000481079 COL4A5P29400 1685 aa30.85■■■□□ 2.53
PTPRD-210ENST00000481079 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
PTPRD-210ENST00000481079 IARSP41252 1262 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
PTPRD-210ENST00000481079 MYD88Q99836 296 aa30.85■■■□□ 2.53
PTPRD-210ENST00000481079 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa30.85■■■□□ 2.53
PTPRD-210ENST00000481079 TAF1P21675 1872 aa30.84■■■□□ 2.53
PTPRD-210ENST00000481079 GRIPAP1Q4V328 841 aa30.84■■■□□ 2.53
PTPRD-210ENST00000481079 DDNO94850 711 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
PTPRD-210ENST00000481079 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
PTPRD-210ENST00000481079 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
PTPRD-210ENST00000481079 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
PTPRD-210ENST00000481079 DDX58O95786 925 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
PTPRD-210ENST00000481079 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
PTPRD-210ENST00000481079 G2E3Q7L622 706 aa30.82■■■□□ 2.52
PTPRD-210ENST00000481079 STK31Q9BXU1 1019 aa30.82■■■□□ 2.52
PTPRD-210ENST00000481079 COL4A1P02462 1669 aa30.81■■■□□ 2.52
PTPRD-210ENST00000481079 BBOX1O75936 387 aa30.81■■■□□ 2.52
PTPRD-210ENST00000481079 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
PTPRD-210ENST00000481079 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
PTPRD-210ENST00000481079 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
PTPRD-210ENST00000481079 CCDC191Q8NCU4 936 aa30.81■■■□□ 2.52
PTPRD-210ENST00000481079 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa30.81■■■□□ 2.52
PTPRD-210ENST00000481079 ZNF521Q96K83 1311 aa30.8■■■□□ 2.52
PTPRD-210ENST00000481079 ZNF541Q9H0D2 1346 aa30.8■■■□□ 2.52
PTPRD-210ENST00000481079 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
PTPRD-210ENST00000481079 VAMP4O75379 141 aa30.8■■■□□ 2.52
PTPRD-210ENST00000481079 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
PTPRD-210ENST00000481079 GRAPQ13588 217 aa30.8■■■□□ 2.52
PTPRD-210ENST00000481079 KSR2Q6VAB6 950 aa30.8■■■□□ 2.52
PTPRD-210ENST00000481079 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
PTPRD-210ENST00000481079 PI4KAP2A4QPH2 592 aa30.79■■■□□ 2.52
PTPRD-210ENST00000481079 FZD9O00144 591 aa30.79■■■□□ 2.52
PTPRD-210ENST00000481079 SLC4A2P04920 1241 aa30.79■■■□□ 2.52
PTPRD-210ENST00000481079 SP8Q8IXZ3 490 aa30.79■■■□□ 2.52
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