RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 ABCC12Q96J65 1359 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 SMC1BQ8NDV3 1235 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 CHPF2Q9P2E5 772 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 UBN2Q6ZU65 1347 aa10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 NPM3O75607 178 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 FSTL1Q12841 308 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF34Q8IZ26 560 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 RTKN2Q8IZC4 609 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 SYNE4Q8N205 404 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 NLRP3Q96P20 1036 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 CLEC11AQ9Y240 323 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 ERBB4Q15303 1308 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 CHL1O00533 1208 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 KCNA4P22459 653 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 PDIA6Q15084 440 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 PARP10Q53GL7 1025 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 DUSP27Q5VZP5 1158 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 JDP2Q8WYK2 163 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 BABAM1Q9NWV8 329 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 GJA3Q9Y6H8 435 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 TAF1P21675 1872 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 RGL2O15211 777 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 NTSR2O95665 410 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 IARSP41252 1262 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 C3orf67Q6ZVT6 689 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 MBIPQ9NS73 344 aa10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 TCIRG1Q13488 830 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC184Q52MB2 194 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 SLC51AQ86UW1 340 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 LARGE2Q8N3Y3 721 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 C7orf43Q8WVR3 580 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 CFAP44Q96MT7 982 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 MRS2Q9HD23 443 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 LTBP3Q9NS15 1303 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-209ENST00000480420 LAMB2P55268 1798 aa10.46□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF541Q9H0D2 1346 aa10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 IQCA1LA6NCM1 817 aa10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 POTECB2RU33 542 aa10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 ANP32CO43423 234 aa10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 EIF6P56537 245 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 GNAI1P63096 354 aa10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 RIC3Q7Z5B4 369 aa10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 NLRP10Q86W26 655 aa10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 RNF123Q5XPI4 1314 aa10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 SH3TC1Q8TE82 1336 aa10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 PPIP5K2O43314 1243 aa10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 POTEIP0CG38 1075 aa10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 POTEJP0CG39 1038 aa10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 GOLGA2Q08379 1002 aa10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 CRY2Q49AN0 593 aa10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 NIM1KQ8IY84 436 aa10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 PLBD2Q8NHP8 589 aa10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 FAM89AQ96GI7 184 aa10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 CRAMP1Q96RY5 1269 aa10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 HYPKQ9NX55 129 aa10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 ABCC4O15439 1325 aa10.43□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa10.43□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 CHADLQ6NUI6 762 aa10.43□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 LRP10Q7Z4F1 713 aa10.43□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 IFT57Q9NWB7 429 aa10.43□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 HACL1Q9UJ83 578 aa10.43□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 SCN4AP35499 1836 aa10.42□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 AOC3Q16853 763 aa10.42□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 C8orf58Q8NAV2 365 aa10.42□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 MYD88Q99836 296 aa10.42□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 HOXB7P09629 217 aa10.41□□□□□ -0.74
CTPS1-209ENST00000480420 EPHX2P34913 555 aa10.41□□□□□ -0.74
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