RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.59■■□□□ 1.21
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ATG4B-217ENST00000475693 NUP98P52948 1817 aa22.58■■□□□ 1.21
ATG4B-217ENST00000475693 H7C1W4 665 aa22.58■■□□□ 1.2
ATG4B-217ENST00000475693 RGS3P49796 1198 aa22.58■■□□□ 1.2
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ATG4B-217ENST00000475693 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.57■■□□□ 1.2
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ATG4B-217ENST00000475693 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
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ATG4B-217ENST00000475693 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.53■■□□□ 1.2
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ATG4B-217ENST00000475693 SSH3Q8TE77 659 aa22.51■■□□□ 1.19
ATG4B-217ENST00000475693 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.51■■□□□ 1.19
ATG4B-217ENST00000475693 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
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ATG4B-217ENST00000475693 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ATG4B-217ENST00000475693 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
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ATG4B-217ENST00000475693 SIL1Q9H173 461 aa22.49■■□□□ 1.19
ATG4B-217ENST00000475693 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.48■■□□□ 1.19
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ATG4B-217ENST00000475693 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
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ATG4B-217ENST00000475693 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
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ATG4B-217ENST00000475693 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.41■■□□□ 1.18
ATG4B-217ENST00000475693 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
ATG4B-217ENST00000475693 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
ATG4B-217ENST00000475693 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG4B-217ENST00000475693 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
ATG4B-217ENST00000475693 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.39■■□□□ 1.18
ATG4B-217ENST00000475693 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
ATG4B-217ENST00000475693 CTSWP56202 376 aa22.39■■□□□ 1.17
ATG4B-217ENST00000475693 SLC15A2Q16348 729 aa22.39■■□□□ 1.17
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