RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.487e-14■■□□□ 14.5
SYF2-203ENST00000474160 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SYF2-203ENST00000474160 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.3■■□□□ 1.48
SYF2-203ENST00000474160 CRY2Q49AN0 593 aa24.29■■□□□ 1.48
SYF2-203ENST00000474160 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SYF2-203ENST00000474160 ERFEQ4G0M1 354 aa24.28■■□□□ 1.48
SYF2-203ENST00000474160 SOGA3Q5TF21 947 aa24.28■■□□□ 1.48
SYF2-203ENST00000474160 ABCC12Q96J65 1359 aa24.28■■□□□ 1.48
SYF2-203ENST00000474160 SLC4A2P04920 1241 aa24.27■■□□□ 1.48
SYF2-203ENST00000474160 ALDH1B1P30837 517 aa24.27■■□□□ 1.48
SYF2-203ENST00000474160 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.27■■□□□ 1.48
SYF2-203ENST00000474160 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.27■■□□□ 1.48
SYF2-203ENST00000474160 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.26■■□□□ 1.47
SYF2-203ENST00000474160 SLFN5Q08AF3 891 aa24.26■■□□□ 1.47
SYF2-203ENST00000474160 KSR2Q6VAB6 950 aa24.26■■□□□ 1.47
SYF2-203ENST00000474160 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa24.26■■□□□ 1.47
SYF2-203ENST00000474160 ZNF428Q96B54 188 aa24.26■■□□□ 1.47
SYF2-203ENST00000474160 NLRP3Q96P20 1036 aa24.26■■□□□ 1.47
SYF2-203ENST00000474160 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
SYF2-203ENST00000474160 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.25■■□□□ 1.47
SYF2-203ENST00000474160 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SYF2-203ENST00000474160 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
SYF2-203ENST00000474160 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SYF2-203ENST00000474160 FLIIQ13045 1269 aa24.23■■□□□ 1.47
SYF2-203ENST00000474160 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SYF2-203ENST00000474160 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SYF2-203ENST00000474160 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.22■■□□□ 1.47
SYF2-203ENST00000474160 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SYF2-203ENST00000474160 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SYF2-203ENST00000474160 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.21■■□□□ 1.47
SYF2-203ENST00000474160 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.21■■□□□ 1.47
SYF2-203ENST00000474160 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.21■■□□□ 1.47
SYF2-203ENST00000474160 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
SYF2-203ENST00000474160 CRAMP1Q96RY5 1269 aa24.21■■□□□ 1.47
SYF2-203ENST00000474160 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.21■■□□□ 1.47
SYF2-203ENST00000474160 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
SYF2-203ENST00000474160 ADCY9O60503 1353 aa24.2■■□□□ 1.46
SYF2-203ENST00000474160 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SYF2-203ENST00000474160 MYD88Q99836 296 aa24.2■■□□□ 1.46
SYF2-203ENST00000474160 LTBP3Q9NS15 1303 aa24.19■■□□□ 1.46
SYF2-203ENST00000474160 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SYF2-203ENST00000474160 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.19■■□□□ 1.46
SYF2-203ENST00000474160 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa24.19■■□□□ 1.46
SYF2-203ENST00000474160 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SYF2-203ENST00000474160 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
SYF2-203ENST00000474160 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
SYF2-203ENST00000474160 G2E3Q7L622 706 aa24.18■■□□□ 1.46
SYF2-203ENST00000474160 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.18■■□□□ 1.46
SYF2-203ENST00000474160 C21orf2O43822 256 aa24.17■■□□□ 1.46
SYF2-203ENST00000474160 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SYF2-203ENST00000474160 CCDC93Q567U6 631 aa24.17■■□□□ 1.46
SYF2-203ENST00000474160 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SYF2-203ENST00000474160 SLX4Q8IY92 1834 aa24.17■■□□□ 1.46
SYF2-203ENST00000474160 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.16■■□□□ 1.46
SYF2-203ENST00000474160 LMNB1P20700 586 aa24.15■■□□□ 1.46
SYF2-203ENST00000474160 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
SYF2-203ENST00000474160 RTKN2Q8IZC4 609 aa24.15■■□□□ 1.46
SYF2-203ENST00000474160 FAM89AQ96GI7 184 aa24.15■■□□□ 1.46
SYF2-203ENST00000474160 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.14■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 C9orf131Q5VYM1 1079 aa24.14■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.14■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.13■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa24.13■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 NFKBIEO00221 500 aa24.13■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 IGKV5-2P06315 115 aa24.13■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 TMC4Q7Z404 712 aa24.13■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 LINS1Q8NG48 757 aa24.13■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.13■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 LAMB2P55268 1798 aa24.13■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.12■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 BBOX1O75936 387 aa24.12■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.12■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 CACNA1SQ13698 1873 aa24.11■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 SYNE4Q8N205 404 aa24.11■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 RNF181Q9P0P0 153 aa24.11■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 SBF1O95248 1867 aa24.11■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 PTPRCP08575 1304 aa24.1■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.1■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 ABCC4O15439 1325 aa24.1■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 PDE8AO60658 829 aa24.09■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 RASSF7Q02833 373 aa24.09■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 GRAPQ13588 217 aa24.09■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 GCKRQ14397 625 aa24.08■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 PSMD1Q99460 953 aa24.08■■□□□ 1.45
SYF2-203ENST00000474160 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SYF2-203ENST00000474160 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa24.07■■□□□ 1.44
SYF2-203ENST00000474160 SNED1Q8TER0 1413 aa24.07■■□□□ 1.44
SYF2-203ENST00000474160 H7C1W4 665 aa24.06■■□□□ 1.44
SYF2-203ENST00000474160 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SYF2-203ENST00000474160 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.7 ms