RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470356.3

HMG20B-209, Transcript of high mobility group 20B, human

TSL 1 (best)

Gene HMG20B, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HMG20B-209	ENST00000470356	COPS6	Q7L5N1	327 aa		40.88	■■■■■ 4.13
HMG20B-209	ENST00000470356	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		40.86	■■■■■ 4.13
HMG20B-209	ENST00000470356	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	40.85	■■■■■ 4.13
HMG20B-209	ENST00000470356	CFAP44	Q96MT7	982 aa		40.85	■■■■■ 4.13
HMG20B-209	ENST00000470356	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	40.85	■■■■■ 4.13
HMG20B-209	ENST00000470356	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	40.85	■■■■■ 4.13
HMG20B-209	ENST00000470356	HOXB7	P09629	217 aa		40.84	■■■■■ 4.13
HMG20B-209	ENST00000470356	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	40.84	■■■■■ 4.13
HMG20B-209	ENST00000470356	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		40.84	■■■■■ 4.13
HMG20B-209	ENST00000470356	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		40.83	■■■■■ 4.13
HMG20B-209	ENST00000470356	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		40.83	■■■■■ 4.13
HMG20B-209	ENST00000470356	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		40.83	■■■■■ 4.13
HMG20B-209	ENST00000470356	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		40.82	■■■■■ 4.13
HMG20B-209	ENST00000470356	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	40.82	■■■■■ 4.13
HMG20B-209	ENST00000470356	SYNE4	Q8N205	404 aa		40.81	■■■■■ 4.12
HMG20B-209	ENST00000470356	PSMD1	Q99460	953 aa		40.81	■■■■■ 4.12
HMG20B-209	ENST00000470356	SNED1	Q8TER0	1413 aa		40.81	■■■■■ 4.12
HMG20B-209	ENST00000470356	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		40.8	■■■■■ 4.12
HMG20B-209	ENST00000470356	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		40.8	■■■■■ 4.12
HMG20B-209	ENST00000470356	NLRP3	Q96P20	1036 aa		40.8	■■■■■ 4.12
HMG20B-209	ENST00000470356	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		40.8	■■■■■ 4.12
HMG20B-209	ENST00000470356	APAF1	O14727	1248 aa		40.79	■■■■■ 4.12
HMG20B-209	ENST00000470356	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	40.79	■■■■■ 4.12
HMG20B-209	ENST00000470356	HTRA3	P83110	453 aa		40.79	■■■■■ 4.12
HMG20B-209	ENST00000470356	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		40.79	■■■■■ 4.12
HMG20B-209	ENST00000470356	TCIRG1	Q13488	830 aa		40.78	■■■■■ 4.12
HMG20B-209	ENST00000470356	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		40.78	■■■■■ 4.12
HMG20B-209	ENST00000470356	NLRP10	Q86W26	655 aa		40.77	■■■■■ 4.12
HMG20B-209	ENST00000470356	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	40.77	■■■■■ 4.12
HMG20B-209	ENST00000470356	ZNF853	P0CG23	659 aa		40.76	■■■■■ 4.12
HMG20B-209	ENST00000470356	MBIP	Q9NS73	344 aa		40.76	■■■■■ 4.12
HMG20B-209	ENST00000470356	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	40.75	■■■■■ 4.11
HMG20B-209	ENST00000470356	SCN4A	P35499	1836 aa		40.74	■■■■■ 4.11
HMG20B-209	ENST00000470356	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		40.74	■■■■■ 4.11
HMG20B-209	ENST00000470356	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		40.73	■■■■■ 4.11
HMG20B-209	ENST00000470356	KLRG1	Q96E93	195 aa		40.73	■■■■■ 4.11
HMG20B-209	ENST00000470356	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		40.72	■■■■■ 4.11
HMG20B-209	ENST00000470356	FZD9	O00144	591 aa		40.72	■■■■■ 4.11
HMG20B-209	ENST00000470356	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	40.72	■■■■■ 4.11
HMG20B-209	ENST00000470356	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	40.72	■■■■■ 4.11
HMG20B-209	ENST00000470356	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		40.71	■■■■■ 4.11
HMG20B-209	ENST00000470356	IFT57	Q9NWB7	429 aa		40.71	■■■■■ 4.11
HMG20B-209	ENST00000470356	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	40.7	■■■■■ 4.11
HMG20B-209	ENST00000470356	GNAI1	P63096	354 aa		40.69	■■■■■ 4.1
HMG20B-209	ENST00000470356	CHADL	Q6NUI6	762 aa		40.69	■■■■■ 4.1
HMG20B-209	ENST00000470356	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		40.69	■■■■■ 4.1
HMG20B-209	ENST00000470356	JDP2	Q8WYK2	163 aa		40.69	■■■■■ 4.1
HMG20B-209	ENST00000470356	HYPK	Q9NX55	129 aa		40.69	■■■■■ 4.1
HMG20B-209	ENST00000470356	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	40.68	■■■■■ 4.1
HMG20B-209	ENST00000470356	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		40.67	■■■■■ 4.1
HMG20B-209	ENST00000470356	LAMB2	P55268	1798 aa		40.67	■■■■■ 4.1
HMG20B-209	ENST00000470356	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	40.67	■■■■■ 4.1
HMG20B-209	ENST00000470356	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	40.66	■■■■■ 4.1
HMG20B-209	ENST00000470356	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	40.66	■■■■■ 4.1
HMG20B-209	ENST00000470356	POTEI	P0CG38	1075 aa		40.65	■■■■■ 4.1
HMG20B-209	ENST00000470356	POTEJ	P0CG39	1038 aa		40.65	■■■■■ 4.1
HMG20B-209	ENST00000470356	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	40.65	■■■■■ 4.1
HMG20B-209	ENST00000470356	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		40.65	■■■■■ 4.1
HMG20B-209	ENST00000470356	ABCC4	O15439	1325 aa		40.64	■■■■■ 4.1
HMG20B-209	ENST00000470356	SLC51A	Q86UW1	340 aa		40.63	■■■■■ 4.09
HMG20B-209	ENST00000470356	GPC2	Q8N158	579 aa		40.63	■■■■■ 4.09
HMG20B-209	ENST00000470356	JMY	Q8N9B5	988 aa		40.63	■■■■■ 4.09
HMG20B-209	ENST00000470356	BBOX1	O75936	387 aa		40.62	■■■■■ 4.09
HMG20B-209	ENST00000470356	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		40.62	■■■■■ 4.09
HMG20B-209	ENST00000470356	HACL1	Q9UJ83	578 aa		40.62	■■■■■ 4.09
HMG20B-209	ENST00000470356	COL4A5	P29400	1685 aa		40.61	■■■■■ 4.09
HMG20B-209	ENST00000470356	CCDC184	Q52MB2	194 aa		40.6	■■■■■ 4.09
HMG20B-209	ENST00000470356	LDHD	Q86WU2	507 aa		40.6	■■■■■ 4.09
HMG20B-209	ENST00000470356	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		40.6	■■■■■ 4.09
HMG20B-209	ENST00000470356	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	40.58	■■■■■ 4.09
HMG20B-209	ENST00000470356	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	40.58	■■■■■ 4.09
HMG20B-209	ENST00000470356	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	40.57	■■■■■ 4.09
HMG20B-209	ENST00000470356	SP8	Q8IXZ3	490 aa		40.57	■■■■■ 4.09
HMG20B-209	ENST00000470356	VPS33B	Q9H267	617 aa		40.57	■■■■■ 4.09
HMG20B-209	ENST00000470356	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		40.56	■■■■■ 4.08
HMG20B-209	ENST00000470356	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	40.56	■■■■■ 4.08
HMG20B-209	ENST00000470356	EPHX2	P34913	555 aa		40.55	■■■■■ 4.08
HMG20B-209	ENST00000470356	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		40.54	■■■■■ 4.08
HMG20B-209	ENST00000470356	ZNF428	Q96B54	188 aa		40.54	■■■■■ 4.08
HMG20B-209	ENST00000470356	TAF1	P21675	1872 aa		40.53	■■■■■ 4.08
HMG20B-209	ENST00000470356	GRAP	Q13588	217 aa		40.53	■■■■■ 4.08
HMG20B-209	ENST00000470356	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	40.53	■■■■■ 4.08
HMG20B-209	ENST00000470356	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	40.53	■■■■■ 4.08
HMG20B-209	ENST00000470356	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	40.53	■■■■■ 4.08
HMG20B-209	ENST00000470356	FAM89A	Q96GI7	184 aa		40.53	■■■■■ 4.08
HMG20B-209	ENST00000470356	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	40.53	■■■■■ 4.08
HMG20B-209	ENST00000470356	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	40.53	■■■■■ 4.08
HMG20B-209	ENST00000470356	PPIP5K2	O43314	1243 aa		40.52	■■■■■ 4.08
HMG20B-209	ENST00000470356	NIM1K	Q8IY84	436 aa		40.52	■■■■■ 4.08
HMG20B-209	ENST00000470356	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		40.52	■■■■■ 4.08
HMG20B-209	ENST00000470356	GOLGA2	Q08379	1002 aa		40.51	■■■■■ 4.08
HMG20B-209	ENST00000470356	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		40.51	■■■■■ 4.08
HMG20B-209	ENST00000470356	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		40.51	■■■■■ 4.08
HMG20B-209	ENST00000470356	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	40.51	■■■■■ 4.08
HMG20B-209	ENST00000470356	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		40.51	■■■■■ 4.08
HMG20B-209	ENST00000470356	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	40.49	■■■■■ 4.07
HMG20B-209	ENST00000470356	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	40.49	■■■■■ 4.07
HMG20B-209	ENST00000470356	TMC4	Q7Z404	712 aa		40.49	■■■■■ 4.07
HMG20B-209	ENST00000470356	MPND	Q8N594	471 aa		40.49	■■■■■ 4.07
HMG20B-209	ENST00000470356	CREBZF	Q9NS37	354 aa		40.49	■■■■■ 4.07

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