RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.6■■□□□ 1.69
CTPS1-206ENST00000470271 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
CTPS1-206ENST00000470271 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.59■■□□□ 1.69
CTPS1-206ENST00000470271 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
CTPS1-206ENST00000470271 VAMP4O75379 141 aa25.58■■□□□ 1.69
CTPS1-206ENST00000470271 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
CTPS1-206ENST00000470271 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.58■■□□□ 1.69
CTPS1-206ENST00000470271 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.58■■□□□ 1.69
CTPS1-206ENST00000470271 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
CTPS1-206ENST00000470271 CRY2Q49AN0 593 aa25.57■■□□□ 1.68
CTPS1-206ENST00000470271 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
CTPS1-206ENST00000470271 SLX4Q8IY92 1834 aa25.56■■□□□ 1.68
CTPS1-206ENST00000470271 CACNA1SQ13698 1873 aa25.56■■□□□ 1.68
CTPS1-206ENST00000470271 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.56■■□□□ 1.68
CTPS1-206ENST00000470271 C21orf2O43822 256 aa25.56■■□□□ 1.68
CTPS1-206ENST00000470271 SLC4A2P04920 1241 aa25.56■■□□□ 1.68
CTPS1-206ENST00000470271 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.56■■□□□ 1.68
CTPS1-206ENST00000470271 ADCY9O60503 1353 aa25.56■■□□□ 1.68
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CTPS1-206ENST00000470271 ALDH1B1P30837 517 aa25.54■■□□□ 1.68
CTPS1-206ENST00000470271 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CTPS1-206ENST00000470271 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CTPS1-206ENST00000470271 NLRP3Q96P20 1036 aa25.54■■□□□ 1.68
CTPS1-206ENST00000470271 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.54■■□□□ 1.68
CTPS1-206ENST00000470271 C9orf131Q5VYM1 1079 aa25.53■■□□□ 1.68
CTPS1-206ENST00000470271 CACNA1FO60840 1977 aa25.53■■□□□ 1.68
CTPS1-206ENST00000470271 E9PSI1 815 aa25.52■■□□□ 1.68
CTPS1-206ENST00000470271 RASSF7Q02833 373 aa25.52■■□□□ 1.68
CTPS1-206ENST00000470271 SOGA3Q5TF21 947 aa25.52■■□□□ 1.68
CTPS1-206ENST00000470271 KSR2Q6VAB6 950 aa25.52■■□□□ 1.68
CTPS1-206ENST00000470271 G2E3Q7L622 706 aa25.52■■□□□ 1.68
CTPS1-206ENST00000470271 SYNE4Q8N205 404 aa25.52■■□□□ 1.68
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF428Q96B54 188 aa25.52■■□□□ 1.68
CTPS1-206ENST00000470271 MYD88Q99836 296 aa25.52■■□□□ 1.68
CTPS1-206ENST00000470271 PI4KAP2A4QPH2 592 aa25.51■■□□□ 1.67
CTPS1-206ENST00000470271 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
CTPS1-206ENST00000470271 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.51■■□□□ 1.67
CTPS1-206ENST00000470271 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.51■■□□□ 1.67
CTPS1-206ENST00000470271 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
CTPS1-206ENST00000470271 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa25.51■■□□□ 1.67
CTPS1-206ENST00000470271 SBF1O95248 1867 aa25.51■■□□□ 1.67
CTPS1-206ENST00000470271 NFKBIEO00221 500 aa25.5■■□□□ 1.67
CTPS1-206ENST00000470271 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
CTPS1-206ENST00000470271 C7orf43Q8WVR3 580 aa25.5■■□□□ 1.67
CTPS1-206ENST00000470271 RNF181Q9P0P0 153 aa25.5■■□□□ 1.67
CTPS1-206ENST00000470271 FLIIQ13045 1269 aa25.49■■□□□ 1.67
CTPS1-206ENST00000470271 FAM89AQ96GI7 184 aa25.49■■□□□ 1.67
CTPS1-206ENST00000470271 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CTPS1-206ENST00000470271 LMNB1P20700 586 aa25.48■■□□□ 1.67
CTPS1-206ENST00000470271 SLFN5Q08AF3 891 aa25.48■■□□□ 1.67
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.48■■□□□ 1.67
CTPS1-206ENST00000470271 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.48■■□□□ 1.67
CTPS1-206ENST00000470271 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa25.48■■□□□ 1.67
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC93Q567U6 631 aa25.47■■□□□ 1.67
CTPS1-206ENST00000470271 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CTPS1-206ENST00000470271 TAOK3Q9H2K8 898 aa25.46■■□□□ 1.67
CTPS1-206ENST00000470271 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CTPS1-206ENST00000470271 LTBP3Q9NS15 1303 aa25.45■■□□□ 1.66
CTPS1-206ENST00000470271 PRELPP51888 382 aa25.45■■□□□ 1.66
CTPS1-206ENST00000470271 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.45■■□□□ 1.66
CTPS1-206ENST00000470271 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
CTPS1-206ENST00000470271 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
CTPS1-206ENST00000470271 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.45■■□□□ 1.66
CTPS1-206ENST00000470271 LAMB2P55268 1798 aa25.45■■□□□ 1.66
CTPS1-206ENST00000470271 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CTPS1-206ENST00000470271 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa25.43■■□□□ 1.66
CTPS1-206ENST00000470271 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CTPS1-206ENST00000470271 OLFM4Q6UX06 510 aa25.43■■□□□ 1.66
CTPS1-206ENST00000470271 RTKN2Q8IZC4 609 aa25.43■■□□□ 1.66
CTPS1-206ENST00000470271 IGKV5-2P06315 115 aa25.42■■□□□ 1.66
CTPS1-206ENST00000470271 ABCC4O15439 1325 aa25.41■■□□□ 1.66
CTPS1-206ENST00000470271 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CTPS1-206ENST00000470271 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CTPS1-206ENST00000470271 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CTPS1-206ENST00000470271 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CTPS1-206ENST00000470271 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa25.41■■□□□ 1.66
CTPS1-206ENST00000470271 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CTPS1-206ENST00000470271 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CTPS1-206ENST00000470271 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CTPS1-206ENST00000470271 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25.4■■□□□ 1.66
CTPS1-206ENST00000470271 NEURL1BA8MQ27 555 aa25.39■■□□□ 1.66
CTPS1-206ENST00000470271 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.66
CTPS1-206ENST00000470271 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CTPS1-206ENST00000470271 BBOX1O75936 387 aa25.38■■□□□ 1.65
CTPS1-206ENST00000470271 GRAPQ13588 217 aa25.37■■□□□ 1.65
CTPS1-206ENST00000470271 GRIPAP1Q4V328 841 aa25.37■■□□□ 1.65
CTPS1-206ENST00000470271 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CTPS1-206ENST00000470271 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CTPS1-206ENST00000470271 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CTPS1-206ENST00000470271 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
CTPS1-206ENST00000470271 SNED1Q8TER0 1413 aa25.37■■□□□ 1.65
CTPS1-206ENST00000470271 LINS1Q8NG48 757 aa25.36■■□□□ 1.65
CTPS1-206ENST00000470271 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.36■■□□□ 1.65
CTPS1-206ENST00000470271 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.36■■□□□ 1.65
CTPS1-206ENST00000470271 TIAM2Q8IVF5 1701 aa25.35■■□□□ 1.65
CTPS1-206ENST00000470271 PDE8AO60658 829 aa25.35■■□□□ 1.65
CTPS1-206ENST00000470271 PSMD1Q99460 953 aa25.35■■□□□ 1.65
CTPS1-206ENST00000470271 F6X3S4 739 aa25.34■■□□□ 1.65
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