RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 TCIRG1Q13488 830 aa24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC10-208ENST00000469521 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC10-208ENST00000469521 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRELPP51888 382 aa24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC10-208ENST00000469521 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC10-208ENST00000469521 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC10-208ENST00000469521 ALDH1B1P30837 517 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC10-208ENST00000469521 NLRP10Q86W26 655 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC10-208ENST00000469521 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC10-208ENST00000469521 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10-208ENST00000469521 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10-208ENST00000469521 KIF3CO14782 793 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCDC93Q567U6 631 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10-208ENST00000469521 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10-208ENST00000469521 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10-208ENST00000469521 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10-208ENST00000469521 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC10-208ENST00000469521 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC10-208ENST00000469521 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC10-208ENST00000469521 SNED1Q8TER0 1413 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC10-208ENST00000469521 GOLGA2Q08379 1002 aa24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC10-208ENST00000469521 WDR63Q8IWG1 891 aa24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC10-208ENST00000469521 TSPYL6Q8N831 410 aa24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC10-208ENST00000469521 NLRP3Q96P20 1036 aa24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC10-208ENST00000469521 NMRK2Q9NPI5 230 aa24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC10-208ENST00000469521 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.33■■□□□ 1.48
TRAPPC10-208ENST00000469521 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC10-208ENST00000469521 RTKN2Q8IZC4 609 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC10-208ENST00000469521 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC10-208ENST00000469521 CRAMP1Q96RY5 1269 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC10-208ENST00000469521 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC10-208ENST00000469521 CACNA1FO60840 1977 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC10-208ENST00000469521 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC10-208ENST00000469521 WDR90Q96KV7 1748 aa24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC10-208ENST00000469521 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC10-208ENST00000469521 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC10-208ENST00000469521 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC10-208ENST00000469521 GLTPD2A6NH11 291 aa24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC10-208ENST00000469521 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC10-208ENST00000469521 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC10-208ENST00000469521 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC10-208ENST00000469521 OLFM4Q6UX06 510 aa24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC10-208ENST00000469521 STK31Q9BXU1 1019 aa24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC10-208ENST00000469521 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC10-208ENST00000469521 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC10-208ENST00000469521 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC10-208ENST00000469521 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC10-208ENST00000469521 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC10-208ENST00000469521 TOMM70O94826 608 aa24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC10-208ENST00000469521 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC10-208ENST00000469521 SYNE4Q8N205 404 aa24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC10-208ENST00000469521 PSMD1Q99460 953 aa24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC10-208ENST00000469521 ABCC4O15439 1325 aa24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC10-208ENST00000469521 DPY19L2Q6NUT2 758 aa24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC10-208ENST00000469521 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC10-208ENST00000469521 RRAGCQ9HB90 399 aa24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC10-208ENST00000469521 TAF1P21675 1872 aa24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC10-208ENST00000469521 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM89AQ96GI7 184 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC10-208ENST00000469521 MYD88Q99836 296 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC10-208ENST00000469521 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC10-208ENST00000469521 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC10-208ENST00000469521 IARSP41252 1262 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC10-208ENST00000469521 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF428Q96B54 188 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC10-208ENST00000469521 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF521Q96K83 1311 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 KSR2Q6VAB6 950 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 SCN4AP35499 1836 aa24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 BBOX1O75936 387 aa24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 GRAPQ13588 217 aa24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 COL4A5P29400 1685 aa24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 MYH3P11055 1940 aa24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC4A2P04920 1241 aa24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 HSPA6P17066 643 aa24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 VAMP4O75379 141 aa24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 TMC4Q7Z404 712 aa24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC51AQ86UW1 340 aa24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.17■■□□□ 1.46
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