RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468641.1

PTPRZ1-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRZ1, Length 554 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-203ENST00000468641 INPP5BP32019 993 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRZ1-203ENST00000468641 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRZ1-203ENST00000468641 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRZ1-203ENST00000468641 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRZ1-203ENST00000468641 LRRC4BQ9NT99 713 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRZ1-203ENST00000468641 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRZ1-203ENST00000468641 IDH3AP50213 366 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRZ1-203ENST00000468641 MAP3K10Q02779 954 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRZ1-203ENST00000468641 SPEM2Q0P670 501 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRZ1-203ENST00000468641 C16orf46Q6P387 395 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRZ1-203ENST00000468641 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRZ1-203ENST00000468641 IFT43Q96FT9 208 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRZ1-203ENST00000468641 OPLAHO14841 1288 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRZ1-203ENST00000468641 MICAL2O94851 1124 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRZ1-203ENST00000468641 GALNT6Q8NCL4 622 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRZ1-203ENST00000468641 MDFIQ99750 246 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRZ1-203ENST00000468641 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRZ1-203ENST00000468641 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP11.78□□□□□ -0.52
PTPRZ1-203ENST00000468641 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRZ1-203ENST00000468641 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PTPRZ1-203ENST00000468641 EPXP11678 715 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRZ1-203ENST00000468641 SYT9Q86SS6 491 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRZ1-203ENST00000468641 EDARADDQ8WWZ3 215 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRZ1-203ENST00000468641 PRR12Q9ULL5 1215 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRZ1-203ENST00000468641 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
PTPRZ1-203ENST00000468641 ADH6P28332 368 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRZ1-203ENST00000468641 TREML1Q86YW5 311 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRZ1-203ENST00000468641 RETREG2Q8NC44 543 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRZ1-203ENST00000468641 USP20Q9Y2K6 914 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRZ1-203ENST00000468641 GSK3AP49840 483 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRZ1-203ENST00000468641 GSX2Q9BZM3 304 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRZ1-203ENST00000468641 USTQ9Y2C2 406 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRZ1-203ENST00000468641 ARSDP51689 593 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRZ1-203ENST00000468641 ZBTB39O15060 712 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRZ1-203ENST00000468641 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
PTPRZ1-203ENST00000468641 NEDD1Q8NHV4 660 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRZ1-203ENST00000468641 ENAMQ9NRM1 1142 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRZ1-203ENST00000468641 SIN3BO75182 1162 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRZ1-203ENST00000468641 BTBD6Q96KE9 485 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRZ1-203ENST00000468641 BRD2P25440 801 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PTPRZ1-203ENST00000468641 BHMTQ93088 406 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRZ1-203ENST00000468641 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRZ1-203ENST00000468641 TNFRSF25Q93038 417 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRZ1-203ENST00000468641 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PTPRZ1-203ENST00000468641 CCINQ13939 588 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRZ1-203ENST00000468641 RGL4Q8IZJ4 473 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRZ1-203ENST00000468641 ZFATQ9P243 1243 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRZ1-203ENST00000468641 STIM2Q9P246 746 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRZ1-203ENST00000468641 KCNMB2Q9Y691 235 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRZ1-203ENST00000468641 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PTPRZ1-203ENST00000468641 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PTPRZ1-203ENST00000468641 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRZ1-203ENST00000468641 MARSP56192 900 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
PTPRZ1-203ENST00000468641 ELOA3BQ3SY89 546 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRZ1-203ENST00000468641 CHSY3Q70JA7 882 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRZ1-203ENST00000468641 ELOA3Q8NG57 546 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRZ1-203ENST00000468641 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PTPRZ1-203ENST00000468641 EPB42P16452 691 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRZ1-203ENST00000468641 NFKB1P19838 968 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRZ1-203ENST00000468641 MTMR3Q13615 1198 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRZ1-203ENST00000468641 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PTPRZ1-203ENST00000468641 HELQQ8TDG4 1101 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRZ1-203ENST00000468641 STARD13Q9Y3M8 1113 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRZ1-203ENST00000468641 KCNMA1Q12791 1236 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRZ1-203ENST00000468641 LINC00114Q6XXX2 140 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRZ1-203ENST00000468641 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRZ1-203ENST00000468641 TARSP26639 723 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRZ1-203ENST00000468641 ZAP70P43403 619 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRZ1-203ENST00000468641 DGKGP49619 791 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRZ1-203ENST00000468641 KRT25Q7Z3Z0 450 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRZ1-203ENST00000468641 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRZ1-203ENST00000468641 SASH3O75995 380 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRZ1-203ENST00000468641 EGFRP00533 1210 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRZ1-203ENST00000468641 AMPD1P23109 780 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRZ1-203ENST00000468641 ADH7P40394 386 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRZ1-203ENST00000468641 ATCAYQ86WG3 371 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRZ1-203ENST00000468641 C11orf16Q9NQ32 467 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRZ1-203ENST00000468641 IRS1P35568 1242 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRZ1-203ENST00000468641 NEUROD1Q13562 356 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRZ1-203ENST00000468641 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PTPRZ1-203ENST00000468641 EFCC1Q9HA90 598 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRZ1-203ENST00000468641 RRAGCQ9HB90 399 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRZ1-203ENST00000468641 XYLBO75191 536 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRZ1-203ENST00000468641 MPSTP25325 297 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRZ1-203ENST00000468641 MAP3K6O95382 1288 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRZ1-203ENST00000468641 ABTB2Q8N961 1025 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRZ1-203ENST00000468641 GPR152Q8TDT2 470 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRZ1-203ENST00000468641 PNMA5Q96PV4 448 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRZ1-203ENST00000468641 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PTPRZ1-203ENST00000468641 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PTPRZ1-203ENST00000468641 NAGPAQ9UK23 515 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRZ1-203ENST00000468641 SLC6A14Q9UN76 642 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRZ1-203ENST00000468641 ZBTB42B2RXF5 422 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRZ1-203ENST00000468641 ALBP02768 609 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRZ1-203ENST00000468641 NPR3P17342 541 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRZ1-203ENST00000468641 RASSF7Q02833 373 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRZ1-203ENST00000468641 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRZ1-203ENST00000468641 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
PTPRZ1-203ENST00000468641 C8orf86Q6ZUL3 223 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRZ1-203ENST00000468641 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms